Protein–RNA interactions for Protein: P23396

RPS3, 40S ribosomal protein S3, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 243 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS3P23396 DDX56-204ENST00000431640 1554 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.372e-6■■■■■ 30.9
RPS3P23396 DDX56-206ENST00000446987 1853 ntTSL 512.48□□□□□ -0.412e-6■■■■■ 30.9
RPS3P23396 DDX56-203ENST00000421223 3028 ntTSL 210.71□□□□□ -0.692e-6■■■■■ 30.9
RPS3P23396 DDX56-212ENST00000485367 1781 ntTSL 510.2□□□□□ -0.782e-6■■■■■ 30.9
RPS3P23396 VWCE-208ENST00000613271 3032 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.554e-7■■■■■ 30.9
RPS3P23396 NAPRT-201ENST00000340490 1774 ntTSL 1 (best)24.62■■□□□ 1.532e-6■■■■■ 30.9
RPS3P23396 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.082e-6■■■■■ 30.9
RPS3P23396 NAPRT-212ENST00000525583 1066 ntTSL 521.48■■□□□ 1.032e-6■■■■■ 30.9
RPS3P23396 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.632e-6■■■■■ 30.9
RPS3P23396 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.542e-6■■■■■ 30.9
RPS3P23396 NAPRT-207ENST00000464332 1212 ntTSL 218.3■□□□□ 0.522e-6■■■■■ 30.9
RPS3P23396 NAPRT-209ENST00000488096 1032 ntTSL 518.29■□□□□ 0.522e-6■■■■■ 30.9
RPS3P23396 NAPRT-208ENST00000480946 1199 ntTSL 518.29■□□□□ 0.522e-6■■■■■ 30.9
RPS3P23396 NAPRT-214ENST00000532645 866 ntTSL 517.22■□□□□ 0.352e-6■■■■■ 30.9
RPS3P23396 TIMP1-204ENST00000445623 595 ntTSL 213.01□□□□□ -0.339e-10■■■■■ 30.9
RPS3P23396 MCM6-203ENST00000492091 712 ntTSL 58.52□□□□□ -1.056e-7■■■■■ 30.9
RPS3P23396 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.689e-7■■■■■ 30.9
RPS3P23396 CALM1-215ENST00000557123 569 ntTSL 315.99■□□□□ 0.154e-8■■■■■ 30.9
RPS3P23396 CALM1-210ENST00000555132 554 ntTSL 415.99■□□□□ 0.154e-8■■■■■ 30.9
RPS3P23396 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.613e-8■■■■■ 30.9
RPS3P23396 C1QBP-202ENST00000570805 688 ntTSL 39.77□□□□□ -0.853e-8■■■■■ 30.9
RPS3P23396 C1QBP-206ENST00000574444 901 ntTSL 3 BASIC4.18□□□□□ -1.745e-8■■■■■ 30.9
RPS3P23396 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.634e-7■■■■■ 30.8
RPS3P23396 TRIP6-206ENST00000476870 1750 ntTSL 218.6■□□□□ 0.574e-7■■■■■ 30.8
RPS3P23396 TRIP6-202ENST00000417475 992 ntTSL 1 (best)18.21■□□□□ 0.514e-7■■■■■ 30.8
RPS3P23396 TRIP6-204ENST00000437505 875 ntTSL 316.33■□□□□ 0.24e-7■■■■■ 30.8
RPS3P23396 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.184e-7■■■■■ 30.8
RPS3P23396 ALG1-205ENST00000591783 742 ntTSL 419.06■□□□□ 0.646e-7■■■■■ 30.8
RPS3P23396 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.492e-17■■■■■ 30.8
RPS3P23396 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.172e-17■■■■■ 30.8
RPS3P23396 BANF1-203ENST00000524628 612 ntTSL 215.02■□□□□ -02e-7■■■■■ 30.8
RPS3P23396 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.012e-7■■■■■ 30.8
RPS3P23396 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.242e-7■■■■■ 30.8
RPS3P23396 USP10-217ENST00000569925 572 ntTSL 35.56□□□□□ -1.527e-8■■■■■ 30.8
RPS3P23396 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.532e-7■■■■■ 30.8
RPS3P23396 CYSTM1-204ENST00000509789 813 ntTSL 413.69□□□□□ -0.222e-7■■■■■ 30.8
RPS3P23396 CYSTM1-202ENST00000504227 588 ntTSL 513.69□□□□□ -0.222e-7■■■■■ 30.8
RPS3P23396 CYSTM1-203ENST00000509589 665 ntTSL 39.69□□□□□ -0.862e-7■■■■■ 30.8
RPS3P23396 NUP37-204ENST00000547269 798 ntTSL 24.3□□□□□ -1.723e-7■■■■■ 30.8
RPS3P23396 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.362e-6■■■■■ 30.8
RPS3P23396 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.071e-11■■■■■ 30.7
RPS3P23396 IFITM1-202ENST00000408968 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.331e-11■■■■■ 30.7
RPS3P23396 IFITM1-201ENST00000328221 844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.331e-11■■■■■ 30.7
RPS3P23396 TMBIM6-209ENST00000547798 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.232e-8■■■■■ 30.7
RPS3P23396 GSTO1-204ENST00000445155 829 ntTSL 221.58■■□□□ 1.051e-10■■■■■ 30.7
RPS3P23396 MT1X-204ENST00000568370 1727 nt15.97■□□□□ 0.158e-17■■■■■ 30.7
RPS3P23396 AC026461.1-201ENST00000567563 551 ntTSL 4 BASIC12.52□□□□□ -0.418e-17■■■■■ 30.7
RPS3P23396 MT1X-201ENST00000394485 450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.058e-17■■■■■ 30.7
RPS3P23396 MT1X-203ENST00000564974 549 ntTSL 1 (best)8.44□□□□□ -1.068e-17■■■■■ 30.7
RPS3P23396 CYC1-202ENST00000525122 543 ntTSL 212.72□□□□□ -0.374e-16■■■■■ 30.7
RPS3P23396 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.451e-6■■■■■ 30.7
RPS3P23396 PHGDH-225ENST00000641720 548 nt7.19□□□□□ -1.262e-12■■■■■ 30.7
RPS3P23396 MAGEC2-201ENST00000247452 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.563e-7■■■■■ 30.7
RPS3P23396 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.241e-8■■■■■ 30.7
RPS3P23396 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.181e-8■■■■■ 30.7
RPS3P23396 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.061e-8■■■■■ 30.7
RPS3P23396 HIST1H3D-203ENST00000635641 1637 ntTSL 517.72■□□□□ 0.433e-10■■■■■ 30.7
RPS3P23396 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.063e-10■■■■■ 30.7
RPS3P23396 AL512328.1-201ENST00000412344 536 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.764e-35■■■■■ 30.7
RPS3P23396 RPL36AL-201ENST00000298289 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.512e-7■■■■■ 30.7
RPS3P23396 SPNS1-208ENST00000566059 1615 ntTSL 517.56■□□□□ 0.41e-6■■■■■ 30.6
RPS3P23396 MDH2-208ENST00000492663 546 ntTSL 28.97□□□□□ -0.977e-18■■■■■ 30.6
RPS3P23396 MPDU1-210ENST00000572836 1523 ntTSL 218.98■□□□□ 0.631e-6■■■■■ 30.6
RPS3P23396 MPDU1-216ENST00000577088 1645 ntTSL 216.22■□□□□ 0.191e-6■■■■■ 30.6
RPS3P23396 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.031e-6■■■■■ 30.6
RPS3P23396 MPDU1-227ENST00000585217 438 ntTSL 312.44□□□□□ -0.421e-6■■■■■ 30.6
RPS3P23396 MPDU1-203ENST00000396501 1125 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.451e-6■■■■■ 30.6
RPS3P23396 MPDU1-204ENST00000423172 888 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.81e-6■■■■■ 30.6
RPS3P23396 MPDU1-212ENST00000574558 900 ntTSL 38.73□□□□□ -1.011e-6■■■■■ 30.6
RPS3P23396 MPDU1-224ENST00000584378 475 ntTSL 45.54□□□□□ -1.521e-6■■■■■ 30.6
RPS3P23396 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.284e-7■■■■■ 30.6
RPS3P23396 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.442e-6■■■■■ 30.6
RPS3P23396 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.372e-6■■■■■ 30.6
RPS3P23396 SDF4-204ENST00000459994 604 ntTSL 515.25■□□□□ 0.031e-11■■■■■ 30.6
RPS3P23396 RPA2-203ENST00000373912 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.232e-6■■■■■ 30.6
RPS3P23396 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.941e-7■■■■■ 30.6
RPS3P23396 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.032e-22■■■■■ 30.6
RPS3P23396 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.022e-22■■■■■ 30.6
RPS3P23396 CTSD-208ENST00000636843 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.492e-22■■■■■ 30.6
RPS3P23396 PSMB4-205ENST00000493673 1650 ntTSL 515.5■□□□□ 0.073e-7■■■■■ 30.6
RPS3P23396 PSMB4-204ENST00000476467 2067 ntTSL 213.05□□□□□ -0.323e-7■■■■■ 30.6
RPS3P23396 PSMB4-201ENST00000290541 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.323e-7■■■■■ 30.6
RPS3P23396 PHGDH-219ENST00000641513 735 nt8.75□□□□□ -1.013e-8■■■■■ 30.5
RPS3P23396 TBL2-206ENST00000433464 1423 ntTSL 226.49■■□□□ 1.834e-10■■■■■ 30.5
RPS3P23396 TBL2-203ENST00000424598 2276 ntTSL 223.49■■□□□ 1.354e-10■■■■■ 30.5
RPS3P23396 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.34e-10■■■■■ 30.5
RPS3P23396 TBL2-209ENST00000450285 2209 ntTSL 1 (best)21.83■■□□□ 1.094e-10■■■■■ 30.5
RPS3P23396 TBL2-202ENST00000417008 1717 ntTSL 517.8■□□□□ 0.444e-10■■■■■ 30.5
RPS3P23396 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.244e-10■■■■■ 30.5
RPS3P23396 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.043e-7■■■■■ 30.5
RPS3P23396 RRM1-202ENST00000526304 514 ntTSL 45.24□□□□□ -1.573e-7■■■■■ 30.5
RPS3P23396 RRM1-213ENST00000533495 2381 ntTSL 24.77□□□□□ -1.653e-7■■■■■ 30.5
RPS3P23396 RRM1-206ENST00000528470 579 ntTSL 33.59□□□□□ -1.833e-7■■■■■ 30.5
RPS3P23396 RRM1-209ENST00000531591 639 ntTSL 22.66□□□□□ -1.983e-7■■■■■ 30.5
RPS3P23396 RRM1-207ENST00000529109 448 ntTSL 20.45□□□□□ -2.343e-7■■■■■ 30.5
RPS3P23396 CPE-203ENST00000480404 437 ntTSL 217.29■□□□□ 0.361e-17■■■■■ 30.5
RPS3P23396 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.093e-7■■■■■ 30.5
RPS3P23396 MSN-206ENST00000609672 568 ntTSL 412.12□□□□□ -0.477e-8■■■■■ 30.5
RPS3P23396 ACO2-201ENST00000216254 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.367e-7■■■■■ 30.5
RPS3P23396 ACO2-202ENST00000396512 2811 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.437e-7■■■■■ 30.5
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