Protein–RNA interactions for Protein: Q9NW64

RBM22, Pre-mRNA-splicing factor RBM22, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 420 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM22Q9NW64 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.963e-10■■■■■ 33.8
RBM22Q9NW64 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.823e-10■■■■■ 33.8
RBM22Q9NW64 FDFT1-207ENST00000525607 1773 ntTSL 219.17■□□□□ 0.663e-10■■■■■ 33.8
RBM22Q9NW64 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.633e-10■■■■■ 33.8
RBM22Q9NW64 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.053e-10■■■■■ 33.8
RBM22Q9NW64 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.023e-10■■■■■ 33.8
RBM22Q9NW64 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.083e-10■■■■■ 33.8
RBM22Q9NW64 FDFT1-214ENST00000528812 2013 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.193e-10■■■■■ 33.8
RBM22Q9NW64 FDFT1-218ENST00000530664 1761 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.43e-10■■■■■ 33.8
RBM22Q9NW64 FDFT1-225ENST00000622850 1987 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.643e-10■■■■■ 33.8
RBM22Q9NW64 FDFT1-222ENST00000538689 2289 ntTSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.263e-10■■■■■ 33.8
RBM22Q9NW64 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.551e-8■■■■■ 33.8
RBM22Q9NW64 HUWE1-209ENST00000474288 1254 ntTSL 210.79□□□□□ -0.684e-9■■■■■ 33.8
RBM22Q9NW64 HUWE1-207ENST00000468322 729 ntTSL 28.01□□□□□ -1.134e-9■■■■■ 33.8
RBM22Q9NW64 RBM39-232ENST00000481037 687 ntTSL 34.82□□□□□ -1.641e-8■■■■■ 33.7
RBM22Q9NW64 RBM39-210ENST00000425184 526 ntTSL 32.74□□□□□ -1.971e-8■■■■■ 33.7
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RBM22Q9NW64 CFB-273ENST00000460718 768 ntTSL 511.43□□□□□ -0.583e-6■■■■■ 33.7
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RBM22Q9NW64 AL645922.1-202ENST00000477310 3377 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.643e-6■■■■■ 33.7
RBM22Q9NW64 AL645922.1-201ENST00000456570 3874 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.783e-6■■■■■ 33.7
RBM22Q9NW64 RBM25-205ENST00000527432 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.955e-15■■■■■ 33.7
RBM22Q9NW64 RBM25-201ENST00000261973 6910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.215e-15■■■■■ 33.7
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RBM22Q9NW64 RBM25-211ENST00000532483 1052 ntTSL 56.16□□□□□ -1.425e-15■■■■■ 33.7
RBM22Q9NW64 RBM25-207ENST00000528081 3008 ntTSL 26.04□□□□□ -1.445e-15■■■■■ 33.7
RBM22Q9NW64 RBM25-206ENST00000527449 3469 ntTSL 1 (best)3.02□□□□□ -1.935e-15■■■■■ 33.7
RBM22Q9NW64 CD164-208ENST00000506649 778 ntTSL 321.14■□□□□ 0.978e-7■■■■■ 33.7
RBM22Q9NW64 CD164-210ENST00000512821 964 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.098e-7■■■■■ 33.7
RBM22Q9NW64 CD164-204ENST00000413644 2414 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.458e-7■■■■■ 33.7
RBM22Q9NW64 CD164-202ENST00000310786 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.768e-7■■■■■ 33.7
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RBM22Q9NW64 CD164-201ENST00000275080 2954 ntTSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.938e-7■■■■■ 33.7
RBM22Q9NW64 CD164-207ENST00000504373 1402 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.488e-7■■■■■ 33.7
RBM22Q9NW64 CD164-206ENST00000499860 2845 ntTSL 1 (best)2.01□□□□□ -2.098e-7■■■■■ 33.7
RBM22Q9NW64 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.026e-8■■■■■ 33.7
RBM22Q9NW64 FGFR1OP-207ENST00000622353 3451 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.436e-8■■■■■ 33.7
RBM22Q9NW64 FGFR1OP-205ENST00000494781 460 ntTSL 311.97□□□□□ -0.496e-8■■■■■ 33.7
RBM22Q9NW64 FGFR1OP-202ENST00000366847 14166 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.166e-8■■■■■ 33.7
RBM22Q9NW64 Z94721.2-201ENST00000609590 5310 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.566e-8■■■■■ 33.7
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RBM22Q9NW64 NUDT4-206ENST00000549992 3607 ntTSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.074e-12■■■■■ 33.6
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RBM22Q9NW64 PATL1-202ENST00000531919 440 ntTSL 50.93□□□□□ -2.265e-7■■■■■ 33.5
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RBM22Q9NW64 ZFYVE27-203ENST00000359980 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.582e-7■■■■■ 33.4
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RBM22Q9NW64 ZFYVE27-209ENST00000473237 386 ntTSL 35.39□□□□□ -1.554e-13■■■■■ 33.4
RBM22Q9NW64 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.153e-7■■■■■ 33.4
RBM22Q9NW64 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.083e-7■■■■■ 33.4
RBM22Q9NW64 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.893e-7■■■■■ 33.4
RBM22Q9NW64 NEURL4-204ENST00000571243 460 ntTSL 319.15■□□□□ 0.663e-7■■■■■ 33.4
RBM22Q9NW64 NEURL4-206ENST00000571887 4291 ntAPPRIS ALT2 TSL 515.38■□□□□ 0.053e-7■■■■■ 33.4
RBM22Q9NW64 LRP5-202ENST00000528714 534 ntTSL 315.1■□□□□ 0.012e-13■■■■■ 33.4
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RBM22Q9NW64 NEURL4-210ENST00000573651 1850 ntTSL 512.96□□□□□ -0.333e-7■■■■■ 33.4
RBM22Q9NW64 NEURL4-209ENST00000573186 4431 ntTSL 511.15□□□□□ -0.623e-7■■■■■ 33.4
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RBM22Q9NW64 LNPK-203ENST00000409660 2028 ntTSL 1 (best)26.05■■□□□ 1.766e-8■■■■■ 33.4
RBM22Q9NW64 LNPK-202ENST00000392540 528 ntTSL 424.18■■□□□ 1.466e-8■■■■■ 33.4
RBM22Q9NW64 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.296e-8■■■■■ 33.4
RBM22Q9NW64 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.286e-8■■■■■ 33.4
RBM22Q9NW64 ARL5A-205ENST00000487723 696 ntTSL 322.24■■□□□ 1.158e-19■■■■■ 33.4
RBM22Q9NW64 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.126e-8■■■■■ 33.4
RBM22Q9NW64 UBFD1-210ENST00000571064 794 ntTSL 321.7■■□□□ 1.066e-8■■■■■ 33.4
RBM22Q9NW64 PMPCA-202ENST00000371720 713 ntTSL 421.53■■□□□ 1.046e-8■■■■■ 33.4
RBM22Q9NW64 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.016e-8■■■■■ 33.4
RBM22Q9NW64 FLOT1-208ENST00000470643 852 ntTSL 321.37■■□□□ 1.016e-8■■■■■ 33.4
RBM22Q9NW64 FLOT1-210ENST00000484168 1101 ntTSL 521.37■■□□□ 1.016e-8■■■■■ 33.4
RBM22Q9NW64 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 16e-8■■■■■ 33.4
RBM22Q9NW64 PMPCA-212ENST00000622209 1013 ntTSL 1 (best)21.22■□□□□ 0.996e-8■■■■■ 33.4
RBM22Q9NW64 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.976e-8■■■■■ 33.4
RBM22Q9NW64 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.918e-19■■■■■ 33.4
RBM22Q9NW64 PMPCA-207ENST00000612553 1174 ntTSL 220.68■□□□□ 0.96e-8■■■■■ 33.4
RBM22Q9NW64 ARL5A-204ENST00000458140 1076 ntTSL 520.28■□□□□ 0.848e-19■■■■■ 33.4
RBM22Q9NW64 PMPCA-208ENST00000614402 505 ntTSL 220.25■□□□□ 0.836e-8■■■■■ 33.4
RBM22Q9NW64 FLOT1-202ENST00000413165 856 ntTSL 520.12■□□□□ 0.816e-8■■■■■ 33.4
RBM22Q9NW64 PDXDC1-207ENST00000562119 884 ntTSL 519.66■□□□□ 0.746e-8■■■■■ 33.4
RBM22Q9NW64 NUP58-203ENST00000381747 1659 ntTSL 519.35■□□□□ 0.696e-8■■■■■ 33.4
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