Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVR7

TBCCD1, TBCC domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 557 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBCCD1Q9NVR7 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TBCCD1Q9NVR7 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TBCCD1Q9NVR7 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TBCCD1Q9NVR7 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TBCCD1Q9NVR7 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TBCCD1Q9NVR7 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TBCCD1Q9NVR7 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TBCCD1Q9NVR7 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TBCCD1Q9NVR7 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TBCCD1Q9NVR7 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TBCCD1Q9NVR7 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TBCCD1Q9NVR7 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TBCCD1Q9NVR7 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TBCCD1Q9NVR7 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TBCCD1Q9NVR7 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TBCCD1Q9NVR7 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TBCCD1Q9NVR7 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TBCCD1Q9NVR7 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TBCCD1Q9NVR7 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TBCCD1Q9NVR7 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TBCCD1Q9NVR7 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TBCCD1Q9NVR7 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TBCCD1Q9NVR7 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TBCCD1Q9NVR7 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TBCCD1Q9NVR7 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TBCCD1Q9NVR7 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TBCCD1Q9NVR7 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TBCCD1Q9NVR7 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
TBCCD1Q9NVR7 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TBCCD1Q9NVR7 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TBCCD1Q9NVR7 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
TBCCD1Q9NVR7 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TBCCD1Q9NVR7 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TBCCD1Q9NVR7 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TBCCD1Q9NVR7 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TBCCD1Q9NVR7 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TBCCD1Q9NVR7 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TBCCD1Q9NVR7 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TBCCD1Q9NVR7 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TBCCD1Q9NVR7 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TBCCD1Q9NVR7 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
TBCCD1Q9NVR7 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TBCCD1Q9NVR7 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TBCCD1Q9NVR7 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TBCCD1Q9NVR7 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TBCCD1Q9NVR7 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TBCCD1Q9NVR7 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TBCCD1Q9NVR7 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TBCCD1Q9NVR7 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TBCCD1Q9NVR7 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TBCCD1Q9NVR7 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TBCCD1Q9NVR7 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TBCCD1Q9NVR7 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TBCCD1Q9NVR7 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TBCCD1Q9NVR7 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TBCCD1Q9NVR7 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TBCCD1Q9NVR7 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TBCCD1Q9NVR7 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TBCCD1Q9NVR7 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TBCCD1Q9NVR7 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TBCCD1Q9NVR7 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TBCCD1Q9NVR7 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TBCCD1Q9NVR7 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TBCCD1Q9NVR7 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TBCCD1Q9NVR7 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TBCCD1Q9NVR7 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TBCCD1Q9NVR7 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TBCCD1Q9NVR7 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TBCCD1Q9NVR7 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TBCCD1Q9NVR7 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TBCCD1Q9NVR7 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TBCCD1Q9NVR7 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TBCCD1Q9NVR7 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TBCCD1Q9NVR7 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TBCCD1Q9NVR7 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TBCCD1Q9NVR7 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TBCCD1Q9NVR7 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TBCCD1Q9NVR7 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TBCCD1Q9NVR7 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TBCCD1Q9NVR7 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TBCCD1Q9NVR7 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TBCCD1Q9NVR7 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TBCCD1Q9NVR7 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TBCCD1Q9NVR7 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TBCCD1Q9NVR7 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TBCCD1Q9NVR7 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TBCCD1Q9NVR7 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TBCCD1Q9NVR7 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TBCCD1Q9NVR7 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TBCCD1Q9NVR7 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TBCCD1Q9NVR7 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TBCCD1Q9NVR7 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TBCCD1Q9NVR7 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TBCCD1Q9NVR7 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TBCCD1Q9NVR7 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TBCCD1Q9NVR7 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TBCCD1Q9NVR7 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TBCCD1Q9NVR7 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
TBCCD1Q9NVR7 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
TBCCD1Q9NVR7 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
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