Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7L9

SUDS3, Sin3 histone deacetylase corepressor complex component SDS3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUDS3Q9H7L9 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SUDS3Q9H7L9 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SUDS3Q9H7L9 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SUDS3Q9H7L9 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SUDS3Q9H7L9 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SUDS3Q9H7L9 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SUDS3Q9H7L9 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SUDS3Q9H7L9 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SUDS3Q9H7L9 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SUDS3Q9H7L9 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SUDS3Q9H7L9 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SUDS3Q9H7L9 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SUDS3Q9H7L9 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SUDS3Q9H7L9 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SUDS3Q9H7L9 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SUDS3Q9H7L9 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SUDS3Q9H7L9 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SUDS3Q9H7L9 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SUDS3Q9H7L9 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SUDS3Q9H7L9 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SUDS3Q9H7L9 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SUDS3Q9H7L9 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SUDS3Q9H7L9 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SUDS3Q9H7L9 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SUDS3Q9H7L9 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SUDS3Q9H7L9 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SUDS3Q9H7L9 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SUDS3Q9H7L9 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SUDS3Q9H7L9 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SUDS3Q9H7L9 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SUDS3Q9H7L9 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SUDS3Q9H7L9 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SUDS3Q9H7L9 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SUDS3Q9H7L9 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SUDS3Q9H7L9 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SUDS3Q9H7L9 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SUDS3Q9H7L9 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SUDS3Q9H7L9 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SUDS3Q9H7L9 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SUDS3Q9H7L9 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SUDS3Q9H7L9 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SUDS3Q9H7L9 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SUDS3Q9H7L9 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SUDS3Q9H7L9 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SUDS3Q9H7L9 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SUDS3Q9H7L9 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SUDS3Q9H7L9 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SUDS3Q9H7L9 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.19
SUDS3Q9H7L9 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SUDS3Q9H7L9 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SUDS3Q9H7L9 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SUDS3Q9H7L9 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SUDS3Q9H7L9 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SUDS3Q9H7L9 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SUDS3Q9H7L9 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SUDS3Q9H7L9 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SUDS3Q9H7L9 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SUDS3Q9H7L9 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SUDS3Q9H7L9 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SUDS3Q9H7L9 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SUDS3Q9H7L9 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SUDS3Q9H7L9 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SUDS3Q9H7L9 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SUDS3Q9H7L9 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SUDS3Q9H7L9 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SUDS3Q9H7L9 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SUDS3Q9H7L9 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SUDS3Q9H7L9 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SUDS3Q9H7L9 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SUDS3Q9H7L9 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SUDS3Q9H7L9 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SUDS3Q9H7L9 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SUDS3Q9H7L9 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SUDS3Q9H7L9 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SUDS3Q9H7L9 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SUDS3Q9H7L9 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SUDS3Q9H7L9 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SUDS3Q9H7L9 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SUDS3Q9H7L9 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SUDS3Q9H7L9 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SUDS3Q9H7L9 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SUDS3Q9H7L9 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SUDS3Q9H7L9 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SUDS3Q9H7L9 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SUDS3Q9H7L9 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SUDS3Q9H7L9 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SUDS3Q9H7L9 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SUDS3Q9H7L9 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SUDS3Q9H7L9 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SUDS3Q9H7L9 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SUDS3Q9H7L9 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SUDS3Q9H7L9 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SUDS3Q9H7L9 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SUDS3Q9H7L9 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SUDS3Q9H7L9 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SUDS3Q9H7L9 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SUDS3Q9H7L9 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SUDS3Q9H7L9 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SUDS3Q9H7L9 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SUDS3Q9H7L9 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms