Protein–RNA interactions for Protein: Q14527

HLTF, Helicase-like transcription factor, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,009 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLTFQ14527 CFI-201ENST00000394634 2159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.174e-7■■□□□ 14
HLTFQ14527 CFI-205ENST00000512148 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.244e-7■■□□□ 14
HLTFQ14527 CFI-204ENST00000510800 667 ntTSL 2 BASIC7.14□□□□□ -1.274e-7■■□□□ 14
HLTFQ14527 CFI-202ENST00000394635 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.484e-7■■□□□ 14
HLTFQ14527 ZNF337-201ENST00000252979 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.161e-6■■□□□ 14
HLTFQ14527 ZNF337-202ENST00000376436 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.31e-6■■□□□ 14
HLTFQ14527 HIVEP2-203ENST00000367604 10032 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.552e-6■■□□□ 14
HLTFQ14527 HIVEP2-201ENST00000012134 9755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.732e-6■■□□□ 14
HLTFQ14527 HIVEP2-202ENST00000367603 9724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.842e-6■■□□□ 14
HLTFQ14527 UTRN-204ENST00000367545 12339 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.661e-7■■□□□ 14
HLTFQ14527 LRBA-204ENST00000507224 8826 ntTSL 5 BASIC8.8□□□□□ -11e-6■■□□□ 14
HLTFQ14527 LRBA-209ENST00000510413 10032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.121e-6■■□□□ 14
HLTFQ14527 LRBA-201ENST00000357115 9899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.181e-6■■□□□ 14
HLTFQ14527 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.276e-8■■□□□ 14
HLTFQ14527 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.276e-8■■□□□ 14
HLTFQ14527 AKAP9-202ENST00000358100 10309 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.951e-6■■□□□ 13.9
HLTFQ14527 PLCB1-218ENST00000629992 3095 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.097e-7■■□□□ 13.9
HLTFQ14527 PLCB1-219ENST00000630495 759 ntTSL 58.15□□□□□ -1.17e-7■■□□□ 13.9
HLTFQ14527 RSRP1-222ENST00000570063 1821 ntTSL 518.95■□□□□ 0.621e-8■■□□□ 13.9
HLTFQ14527 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.281e-8■■□□□ 13.9
HLTFQ14527 RSRP1-217ENST00000568254 2013 ntTSL 1 (best)16.14■□□□□ 0.171e-8■■□□□ 13.9
HLTFQ14527 RSRP1-204ENST00000473314 3034 ntTSL 215.46■□□□□ 0.071e-8■■□□□ 13.9
HLTFQ14527 RSRP1-212ENST00000565733 772 ntTSL 314.07□□□□□ -0.161e-8■■□□□ 13.9
HLTFQ14527 RSRP1-207ENST00000498238 2941 ntTSL 213.6□□□□□ -0.231e-8■■□□□ 13.9
HLTFQ14527 RSRP1-205ENST00000475766 525 ntTSL 411.2□□□□□ -0.621e-8■■□□□ 13.9
HLTFQ14527 RSRP1-213ENST00000566395 824 ntTSL 36.9□□□□□ -1.31e-8■■□□□ 13.9
HLTFQ14527 RSRP1-210ENST00000564223 395 ntTSL 35.31□□□□□ -1.561e-8■■□□□ 13.9
HLTFQ14527 RSRP1-221ENST00000569495 901 ntTSL 24.4□□□□□ -1.711e-8■■□□□ 13.9
HLTFQ14527 ATM-212ENST00000527805 4841 ntTSL 1 (best)16.34■□□□□ 0.211e-7■■□□□ 13.9
HLTFQ14527 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.395e-8■■□□□ 13.9
HLTFQ14527 SEC31A-205ENST00000395310 4259 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.033e-8■■□□□ 13.9
HLTFQ14527 SEC31A-208ENST00000448323 4255 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.13e-8■■□□□ 13.9
HLTFQ14527 SEC31A-202ENST00000311785 3909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.123e-8■■□□□ 13.9
HLTFQ14527 SEC31A-228ENST00000509142 3861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.513e-8■■□□□ 13.9
HLTFQ14527 SEC31A-227ENST00000508502 3801 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.73e-8■■□□□ 13.9
HLTFQ14527 SEC31A-207ENST00000443462 4042 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.293e-8■■□□□ 13.9
HLTFQ14527 SEC31A-204ENST00000355196 4104 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.393e-8■■□□□ 13.9
HLTFQ14527 SEC31A-217ENST00000505984 3596 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.493e-8■■□□□ 13.9
HLTFQ14527 SEC31A-226ENST00000508479 3397 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.53e-8■■□□□ 13.9
HLTFQ14527 SEC31A-209ENST00000500777 3610 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.513e-8■■□□□ 13.9
HLTFQ14527 SEC31A-237ENST00000513858 3687 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.663e-8■■□□□ 13.9
HLTFQ14527 SEC31A-203ENST00000348405 4012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.663e-8■■□□□ 13.9
HLTFQ14527 SEC31A-215ENST00000505472 4159 ntTSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.733e-8■■□□□ 13.9
HLTFQ14527 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.856e-7■■□□□ 13.9
HLTFQ14527 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.426e-7■■□□□ 13.9
HLTFQ14527 RALGAPA1-201ENST00000307138 7911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.076e-7■■□□□ 13.9
HLTFQ14527 RALGAPA1-202ENST00000382366 6328 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.346e-7■■□□□ 13.9
HLTFQ14527 RALGAPA1-215ENST00000556839 1305 ntTSL 36.15□□□□□ -1.436e-7■■□□□ 13.9
HLTFQ14527 RALGAPA1-204ENST00000553892 6271 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.496e-7■■□□□ 13.9
HLTFQ14527 RALGAPA1-209ENST00000554652 4487 ntTSL 25.31□□□□□ -1.566e-7■■□□□ 13.9
HLTFQ14527 RALGAPA1-205ENST00000553917 723 ntTSL 34.16□□□□□ -1.746e-7■■□□□ 13.9
HLTFQ14527 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.545e-7■■□□□ 13.9
HLTFQ14527 GMDS-AS1-204ENST00000525811 539 ntTSL 28.83□□□□□ -15e-7■■□□□ 13.9
HLTFQ14527 ZNF248-206ENST00000485560 1705 ntTSL 1 (best)16.47■□□□□ 0.231e-6■■□□□ 13.9
HLTFQ14527 PTCHD4-202ENST00000398738 3232 ntTSL 1 (best)10.97□□□□□ -0.659e-7■■□□□ 13.9
HLTFQ14527 ZNF460-202ENST00000537645 2037 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.022e-7■■□□□ 13.9
HLTFQ14527 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.249e-7■■□□□ 13.8
HLTFQ14527 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.019e-7■■□□□ 13.8
HLTFQ14527 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.129e-7■■□□□ 13.8
HLTFQ14527 ZNF331-203ENST00000449416 3817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.029e-7■■□□□ 13.8
HLTFQ14527 FP236383.1-201ENST00000623860 2498 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.312e-10■■□□□ 13.8
HLTFQ14527 DDI2-202ENST00000480945 10625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.712e-6■■□□□ 13.8
HLTFQ14527 RSC1A1-201ENST00000345034 1854 ntAPPRIS P1 BASIC7.09□□□□□ -1.272e-6■■□□□ 13.8
HLTFQ14527 DUXAP9-201ENST00000547220 665 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.251e-6■■□□□ 13.8
HLTFQ14527 AHNAK-208ENST00000533365 584 ntAPPRIS ALT2 TSL 519.19■□□□□ 0.666e-8■■□□□ 13.8
HLTFQ14527 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.046e-8■■□□□ 13.8
HLTFQ14527 AHNAK-205ENST00000530124 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.156e-8■■□□□ 13.8
HLTFQ14527 AHNAK-202ENST00000378024 18787 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.466e-8■■□□□ 13.8
HLTFQ14527 PCM1-213ENST00000519802 796 ntTSL 25.85□□□□□ -1.472e-6■■□□□ 13.8
HLTFQ14527 PCM1-220ENST00000523896 740 ntTSL 24.92□□□□□ -1.622e-6■■□□□ 13.8
HLTFQ14527 PCM1-208ENST00000518877 316 ntTSL 32.77□□□□□ -1.972e-6■■□□□ 13.8
HLTFQ14527 PTCHD4-201ENST00000339488 2850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.711e-6■■□□□ 13.8
HLTFQ14527 COA1-209ENST00000438444 3223 ntTSL 29.67□□□□□ -0.862e-6■■□□□ 13.8
HLTFQ14527 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.434e-7■■□□□ 13.8
HLTFQ14527 TTC6-205ENST00000533625 3567 ntTSL 217.24■□□□□ 0.354e-7■■□□□ 13.8
HLTFQ14527 ZNF343-201ENST00000278772 3632 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.773e-6■■□□□ 13.8
HLTFQ14527 ZNF343-208ENST00000617391 3300 ntTSL 4 BASIC9.66□□□□□ -0.863e-6■■□□□ 13.8
HLTFQ14527 AL049650.1-201ENST00000461548 823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.223e-6■■□□□ 13.8
HLTFQ14527 ZNF343-206ENST00000465019 3172 ntTSL 26.67□□□□□ -1.343e-6■■□□□ 13.8
HLTFQ14527 ZNF343-207ENST00000612935 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.533e-6■■□□□ 13.8
HLTFQ14527 KNOP1-201ENST00000219837 6432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.372e-7■■□□□ 13.8
HLTFQ14527 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.419e-7■■□□□ 13.8
HLTFQ14527 BPTF-208ENST00000544778 7573 ntTSL 523.2■■□□□ 1.311e-6■■□□□ 13.8
HLTFQ14527 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.161e-6■■□□□ 13.8
HLTFQ14527 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.411e-6■■□□□ 13.8
HLTFQ14527 BPTF-203ENST00000335221 2627 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.872e-6■■□□□ 13.8
HLTFQ14527 SND1-201ENST00000354725 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.62e-6■■□□□ 13.7
HLTFQ14527 NUCB2-202ENST00000458064 1279 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.782e-6■■□□□ 13.7
HLTFQ14527 SND1-211ENST00000484767 460 ntTSL 410.03□□□□□ -0.82e-6■■□□□ 13.7
HLTFQ14527 SND1-213ENST00000486037 695 ntTSL 39.87□□□□□ -0.832e-6■■□□□ 13.7
HLTFQ14527 NUCB2-220ENST00000622082 1369 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.53□□□□□ -1.042e-6■■□□□ 13.7
HLTFQ14527 NUCB2-208ENST00000529010 2274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.062e-6■■□□□ 13.7
HLTFQ14527 NUCB2-201ENST00000323688 1905 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC8.13□□□□□ -1.112e-6■■□□□ 13.7
HLTFQ14527 NUCB2-205ENST00000527580 701 ntTSL 57.05□□□□□ -1.282e-6■■□□□ 13.7
HLTFQ14527 SND1-216ENST00000492840 472 ntTSL 56.79□□□□□ -1.322e-6■■□□□ 13.7
HLTFQ14527 NUCB2-217ENST00000533773 1839 ntTSL 53.05□□□□□ -1.922e-6■■□□□ 13.7
HLTFQ14527 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.862e-6■■□□□ 13.7
HLTFQ14527 FOXN3-202ENST00000345097 7832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.782e-6■■□□□ 13.7
HLTFQ14527 SPTAN1-228ENST00000635853 5870 ntTSL 511.11□□□□□ -0.633e-8■■□□□ 13.7
HLTFQ14527 SPTAN1-210ENST00000625282 4102 ntTSL 210.09□□□□□ -0.793e-8■■□□□ 13.7
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