Protein–RNA interactions for Protein: Q16822

PCK2, Phosphoenolpyruvate carboxykinase [GTP], mitochondrial, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCK2Q16822 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PCK2Q16822 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PCK2Q16822 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PCK2Q16822 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PCK2Q16822 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PCK2Q16822 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
PCK2Q16822 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PCK2Q16822 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
PCK2Q16822 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PCK2Q16822 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
PCK2Q16822 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PCK2Q16822 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PCK2Q16822 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PCK2Q16822 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
PCK2Q16822 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PCK2Q16822 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PCK2Q16822 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PCK2Q16822 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PCK2Q16822 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PCK2Q16822 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PCK2Q16822 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PCK2Q16822 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PCK2Q16822 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PCK2Q16822 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
PCK2Q16822 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PCK2Q16822 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PCK2Q16822 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PCK2Q16822 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PCK2Q16822 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PCK2Q16822 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PCK2Q16822 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PCK2Q16822 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PCK2Q16822 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PCK2Q16822 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PCK2Q16822 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PCK2Q16822 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PCK2Q16822 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PCK2Q16822 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PCK2Q16822 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
PCK2Q16822 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PCK2Q16822 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PCK2Q16822 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PCK2Q16822 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PCK2Q16822 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PCK2Q16822 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PCK2Q16822 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PCK2Q16822 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
PCK2Q16822 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PCK2Q16822 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PCK2Q16822 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PCK2Q16822 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PCK2Q16822 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PCK2Q16822 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PCK2Q16822 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PCK2Q16822 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PCK2Q16822 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PCK2Q16822 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PCK2Q16822 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PCK2Q16822 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PCK2Q16822 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PCK2Q16822 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PCK2Q16822 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PCK2Q16822 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PCK2Q16822 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PCK2Q16822 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PCK2Q16822 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PCK2Q16822 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PCK2Q16822 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PCK2Q16822 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PCK2Q16822 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PCK2Q16822 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PCK2Q16822 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PCK2Q16822 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
PCK2Q16822 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PCK2Q16822 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PCK2Q16822 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PCK2Q16822 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PCK2Q16822 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PCK2Q16822 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PCK2Q16822 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PCK2Q16822 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PCK2Q16822 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
PCK2Q16822 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PCK2Q16822 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PCK2Q16822 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PCK2Q16822 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PCK2Q16822 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PCK2Q16822 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PCK2Q16822 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PCK2Q16822 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PCK2Q16822 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PCK2Q16822 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PCK2Q16822 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PCK2Q16822 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
PCK2Q16822 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PCK2Q16822 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PCK2Q16822 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PCK2Q16822 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PCK2Q16822 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PCK2Q16822 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
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