Protein–RNA interactions for Protein: Q16822

PCK2, Phosphoenolpyruvate carboxykinase [GTP], mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCK2Q16822 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
PCK2Q16822 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC29.65■■■□□ 2.34
PCK2Q16822 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
PCK2Q16822 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
PCK2Q16822 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
PCK2Q16822 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
PCK2Q16822 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PCK2Q16822 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PCK2Q16822 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PCK2Q16822 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
PCK2Q16822 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PCK2Q16822 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PCK2Q16822 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PCK2Q16822 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PCK2Q16822 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PCK2Q16822 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PCK2Q16822 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PCK2Q16822 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PCK2Q16822 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PCK2Q16822 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PCK2Q16822 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PCK2Q16822 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PCK2Q16822 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PCK2Q16822 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PCK2Q16822 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PCK2Q16822 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PCK2Q16822 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PCK2Q16822 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PCK2Q16822 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PCK2Q16822 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PCK2Q16822 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PCK2Q16822 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PCK2Q16822 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PCK2Q16822 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PCK2Q16822 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PCK2Q16822 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PCK2Q16822 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PCK2Q16822 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PCK2Q16822 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PCK2Q16822 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PCK2Q16822 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PCK2Q16822 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PCK2Q16822 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PCK2Q16822 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PCK2Q16822 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PCK2Q16822 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PCK2Q16822 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PCK2Q16822 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PCK2Q16822 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PCK2Q16822 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PCK2Q16822 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PCK2Q16822 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PCK2Q16822 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PCK2Q16822 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PCK2Q16822 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PCK2Q16822 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PCK2Q16822 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PCK2Q16822 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PCK2Q16822 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PCK2Q16822 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PCK2Q16822 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PCK2Q16822 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PCK2Q16822 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PCK2Q16822 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PCK2Q16822 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PCK2Q16822 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PCK2Q16822 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PCK2Q16822 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PCK2Q16822 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
PCK2Q16822 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PCK2Q16822 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PCK2Q16822 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PCK2Q16822 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PCK2Q16822 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PCK2Q16822 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PCK2Q16822 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PCK2Q16822 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PCK2Q16822 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PCK2Q16822 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PCK2Q16822 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PCK2Q16822 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
PCK2Q16822 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PCK2Q16822 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
PCK2Q16822 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PCK2Q16822 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PCK2Q16822 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PCK2Q16822 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PCK2Q16822 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PCK2Q16822 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PCK2Q16822 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PCK2Q16822 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PCK2Q16822 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PCK2Q16822 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PCK2Q16822 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PCK2Q16822 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PCK2Q16822 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PCK2Q16822 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PCK2Q16822 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PCK2Q16822 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PCK2Q16822 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.8 ms