Protein–RNA interactions for Protein: Q15751

HERC1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC1, humanhuman

Predictions only

Length 4,861 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC1Q15751 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
HERC1Q15751 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
HERC1Q15751 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
HERC1Q15751 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
HERC1Q15751 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
HERC1Q15751 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
HERC1Q15751 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
HERC1Q15751 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
HERC1Q15751 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
HERC1Q15751 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
HERC1Q15751 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.3
HERC1Q15751 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.3
HERC1Q15751 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
HERC1Q15751 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
HERC1Q15751 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
HERC1Q15751 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
HERC1Q15751 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC13.21□□□□□ -0.3
HERC1Q15751 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC13.21□□□□□ -0.3
HERC1Q15751 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
HERC1Q15751 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
HERC1Q15751 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
HERC1Q15751 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
HERC1Q15751 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
HERC1Q15751 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
HERC1Q15751 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
HERC1Q15751 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
HERC1Q15751 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
HERC1Q15751 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
HERC1Q15751 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
HERC1Q15751 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
HERC1Q15751 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
HERC1Q15751 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
HERC1Q15751 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
HERC1Q15751 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
HERC1Q15751 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
HERC1Q15751 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC13.19□□□□□ -0.3
HERC1Q15751 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
HERC1Q15751 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
HERC1Q15751 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
HERC1Q15751 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC13.19□□□□□ -0.3
HERC1Q15751 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
HERC1Q15751 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
HERC1Q15751 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
HERC1Q15751 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
HERC1Q15751 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
HERC1Q15751 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
HERC1Q15751 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
HERC1Q15751 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
HERC1Q15751 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
HERC1Q15751 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
HERC1Q15751 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
HERC1Q15751 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
HERC1Q15751 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
HERC1Q15751 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
HERC1Q15751 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
HERC1Q15751 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
HERC1Q15751 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
HERC1Q15751 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
HERC1Q15751 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC13.18□□□□□ -0.3
HERC1Q15751 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
HERC1Q15751 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
HERC1Q15751 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
HERC1Q15751 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
HERC1Q15751 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC13.18□□□□□ -0.3
HERC1Q15751 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
HERC1Q15751 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC13.18□□□□□ -0.3
HERC1Q15751 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
HERC1Q15751 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
HERC1Q15751 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
HERC1Q15751 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
HERC1Q15751 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
HERC1Q15751 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
HERC1Q15751 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
HERC1Q15751 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
HERC1Q15751 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
HERC1Q15751 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
HERC1Q15751 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
HERC1Q15751 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
HERC1Q15751 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
HERC1Q15751 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
HERC1Q15751 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
HERC1Q15751 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
HERC1Q15751 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
HERC1Q15751 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC13.17□□□□□ -0.3
HERC1Q15751 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
HERC1Q15751 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
HERC1Q15751 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
HERC1Q15751 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
HERC1Q15751 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
HERC1Q15751 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
HERC1Q15751 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
HERC1Q15751 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
HERC1Q15751 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
HERC1Q15751 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC13.16□□□□□ -0.3
HERC1Q15751 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
HERC1Q15751 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
HERC1Q15751 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
HERC1Q15751 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.16□□□□□ -0.3
HERC1Q15751 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
HERC1Q15751 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms