Protein–RNA interactions for Protein: Q15649

ZNHIT3, Zinc finger HIT domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 155 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNHIT3Q15649 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ZNHIT3Q15649 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ZNHIT3Q15649 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ZNHIT3Q15649 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ZNHIT3Q15649 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ZNHIT3Q15649 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ZNHIT3Q15649 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
ZNHIT3Q15649 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ZNHIT3Q15649 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
ZNHIT3Q15649 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
ZNHIT3Q15649 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
ZNHIT3Q15649 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ZNHIT3Q15649 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ZNHIT3Q15649 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ZNHIT3Q15649 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ZNHIT3Q15649 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ZNHIT3Q15649 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ZNHIT3Q15649 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ZNHIT3Q15649 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ZNHIT3Q15649 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
ZNHIT3Q15649 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ZNHIT3Q15649 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ZNHIT3Q15649 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ZNHIT3Q15649 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ZNHIT3Q15649 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ZNHIT3Q15649 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ZNHIT3Q15649 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ZNHIT3Q15649 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ZNHIT3Q15649 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ZNHIT3Q15649 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ZNHIT3Q15649 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ZNHIT3Q15649 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ZNHIT3Q15649 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ZNHIT3Q15649 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ZNHIT3Q15649 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ZNHIT3Q15649 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
ZNHIT3Q15649 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
ZNHIT3Q15649 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
ZNHIT3Q15649 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
ZNHIT3Q15649 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC20.67■□□□□ 0.9
ZNHIT3Q15649 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ZNHIT3Q15649 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
ZNHIT3Q15649 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ZNHIT3Q15649 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ZNHIT3Q15649 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ZNHIT3Q15649 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ZNHIT3Q15649 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ZNHIT3Q15649 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ZNHIT3Q15649 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ZNHIT3Q15649 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ZNHIT3Q15649 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ZNHIT3Q15649 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ZNHIT3Q15649 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ZNHIT3Q15649 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ZNHIT3Q15649 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ZNHIT3Q15649 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ZNHIT3Q15649 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ZNHIT3Q15649 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ZNHIT3Q15649 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ZNHIT3Q15649 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ZNHIT3Q15649 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ZNHIT3Q15649 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ZNHIT3Q15649 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ZNHIT3Q15649 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ZNHIT3Q15649 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ZNHIT3Q15649 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ZNHIT3Q15649 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ZNHIT3Q15649 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ZNHIT3Q15649 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ZNHIT3Q15649 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ZNHIT3Q15649 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ZNHIT3Q15649 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
ZNHIT3Q15649 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ZNHIT3Q15649 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ZNHIT3Q15649 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ZNHIT3Q15649 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ZNHIT3Q15649 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ZNHIT3Q15649 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ZNHIT3Q15649 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC20.64■□□□□ 0.9
ZNHIT3Q15649 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
ZNHIT3Q15649 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
ZNHIT3Q15649 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC20.64■□□□□ 0.9
ZNHIT3Q15649 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
ZNHIT3Q15649 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ZNHIT3Q15649 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ZNHIT3Q15649 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ZNHIT3Q15649 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ZNHIT3Q15649 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ZNHIT3Q15649 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ZNHIT3Q15649 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ZNHIT3Q15649 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ZNHIT3Q15649 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ZNHIT3Q15649 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ZNHIT3Q15649 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ZNHIT3Q15649 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ZNHIT3Q15649 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ZNHIT3Q15649 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
ZNHIT3Q15649 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ZNHIT3Q15649 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ZNHIT3Q15649 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
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