Protein–RNA interactions for Protein: Q12849

GRSF1, G-rich sequence factor 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRSF1Q12849 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.282e-8■□□□□ 8.6
GRSF1Q12849 EPB41-208ENST00000460378 5212 ntTSL 1 (best)10.65□□□□□ -0.713e-7■□□□□ 8.6
GRSF1Q12849 EPB41-204ENST00000356093 5857 ntTSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.923e-7■□□□□ 8.6
GRSF1Q12849 EPB41-206ENST00000373798 5933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.963e-7■□□□□ 8.6
GRSF1Q12849 EPB41-201ENST00000343067 5956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.993e-7■□□□□ 8.6
GRSF1Q12849 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.058e-8■□□□□ 8.6
GRSF1Q12849 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.718e-8■□□□□ 8.6
GRSF1Q12849 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.368e-8■□□□□ 8.6
GRSF1Q12849 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.368e-8■□□□□ 8.6
GRSF1Q12849 NR2F2-AS1-202ENST00000557863 515 ntTSL 316.69■□□□□ 0.262e-7■□□□□ 8.6
GRSF1Q12849 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.112e-7■□□□□ 8.6
GRSF1Q12849 ERP29-202ENST00000455836 1333 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.172e-7■□□□□ 8.6
GRSF1Q12849 FAM168B-202ENST00000409185 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.32e-7■□□□□ 8.6
GRSF1Q12849 NR2F2-AS1-210ENST00000561344 966 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.362e-7■□□□□ 8.6
GRSF1Q12849 OGFR-202ENST00000370461 4506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.398e-8■□□□□ 8.6
GRSF1Q12849 ERP29-201ENST00000261735 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.62e-7■□□□□ 8.6
GRSF1Q12849 NR2F2-AS1-201ENST00000502125 1930 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.72e-7■□□□□ 8.6
GRSF1Q12849 NR2F2-AS1-203ENST00000558929 574 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.832e-7■□□□□ 8.6
GRSF1Q12849 NR2F2-AS1-209ENST00000560800 549 ntTSL 4 BASIC6.95□□□□□ -1.32e-7■□□□□ 8.6
GRSF1Q12849 NR2F2-AS1-211ENST00000561402 589 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.762e-7■□□□□ 8.6
GRSF1Q12849 TPP1-205ENST00000524788 553 ntTSL 219.15■□□□□ 0.667e-7■□□□□ 8.5
GRSF1Q12849 TPP1-210ENST00000528807 585 ntTSL 219.15■□□□□ 0.667e-7■□□□□ 8.5
GRSF1Q12849 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.662e-15■□□□□ 8.5
GRSF1Q12849 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.462e-15■□□□□ 8.5
GRSF1Q12849 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.412e-15■□□□□ 8.5
GRSF1Q12849 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.152e-15■□□□□ 8.5
GRSF1Q12849 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.152e-15■□□□□ 8.5
GRSF1Q12849 TPP1-203ENST00000436873 560 ntTSL 415.9■□□□□ 0.147e-7■□□□□ 8.5
GRSF1Q12849 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.082e-15■□□□□ 8.5
GRSF1Q12849 FGFR3-201ENST00000260795 4132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.192e-15■□□□□ 8.5
GRSF1Q12849 COL18A1-206ENST00000459895 588 ntTSL 313.25□□□□□ -0.297e-13■□□□□ 8.5
GRSF1Q12849 DPP4-201ENST00000360534 3904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.671e-7■□□□□ 8.5
GRSF1Q12849 TPP1-215ENST00000533371 3536 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.777e-7■□□□□ 8.5
GRSF1Q12849 TPP1-201ENST00000299427 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.787e-7■□□□□ 8.5
GRSF1Q12849 CDK5RAP2-214ENST00000481266 970 ntTSL 521.92■■□□□ 1.11e-7■□□□□ 8.4
GRSF1Q12849 CDK5RAP2-218ENST00000491334 546 ntTSL 221.04■□□□□ 0.961e-7■□□□□ 8.4
GRSF1Q12849 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.123e-14■□□□□ 8.4
GRSF1Q12849 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.131e-7■□□□□ 8.4
GRSF1Q12849 AL136295.3-201ENST00000558325 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.213e-14■□□□□ 8.4
GRSF1Q12849 DCAF11-204ENST00000446197 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.383e-14■□□□□ 8.4
GRSF1Q12849 DCAF11-201ENST00000326009 2570 ntTSL 1 (best)12.61□□□□□ -0.393e-14■□□□□ 8.4
GRSF1Q12849 CDK5RAP2-212ENST00000480112 5826 ntTSL 1 (best)12.33□□□□□ -0.431e-7■□□□□ 8.4
GRSF1Q12849 DCAF11-212ENST00000558624 2627 ntTSL 212.32□□□□□ -0.443e-14■□□□□ 8.4
GRSF1Q12849 DCAF11-203ENST00000396941 2402 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.443e-14■□□□□ 8.4
GRSF1Q12849 DCAF11-205ENST00000557802 4202 ntTSL 1 (best)12.23□□□□□ -0.453e-14■□□□□ 8.4
GRSF1Q12849 CDK5RAP2-201ENST00000349780 6228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.531e-7■□□□□ 8.4
GRSF1Q12849 DCAF11-202ENST00000396936 2469 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.593e-14■□□□□ 8.4
GRSF1Q12849 CDK5RAP2-203ENST00000360822 5551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.911e-7■□□□□ 8.4
GRSF1Q12849 CDK5RAP2-209ENST00000473282 5956 ntTSL 1 (best)9.09□□□□□ -0.951e-7■□□□□ 8.4
GRSF1Q12849 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.483e-7■□□□□ 8.3
GRSF1Q12849 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.433e-7■□□□□ 8.3
GRSF1Q12849 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.413e-7■□□□□ 8.3
GRSF1Q12849 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.353e-7■□□□□ 8.3
GRSF1Q12849 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.973e-7■□□□□ 8.3
GRSF1Q12849 OTUD5-205ENST00000455452 2077 ntTSL 520.89■□□□□ 0.933e-7■□□□□ 8.3
GRSF1Q12849 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.423e-7■□□□□ 8.3
GRSF1Q12849 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.373e-7■□□□□ 8.3
GRSF1Q12849 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.343e-7■□□□□ 8.3
GRSF1Q12849 LMNB2-203ENST00000490554 689 ntTSL 216.76■□□□□ 0.273e-7■□□□□ 8.3
GRSF1Q12849 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.13e-7■□□□□ 8.3
GRSF1Q12849 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.063e-7■□□□□ 8.3
GRSF1Q12849 ADCY6-201ENST00000307885 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.13e-7■□□□□ 8.3
GRSF1Q12849 ADCY6-203ENST00000547260 4758 ntTSL 213.32□□□□□ -0.283e-7■□□□□ 8.3
GRSF1Q12849 CRK-203ENST00000572145 830 ntTSL 310.27□□□□□ -0.773e-7■□□□□ 8.3
GRSF1Q12849 HNRNPH1-231ENST00000519033 832 ntTSL 317.73■□□□□ 0.432e-15■□□□□ 8.3
GRSF1Q12849 HNRNPH1-248ENST00000524179 598 ntTSL 215.48■□□□□ 0.072e-15■□□□□ 8.3
GRSF1Q12849 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.012e-15■□□□□ 8.3
GRSF1Q12849 HNRNPH1-204ENST00000442819 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.112e-15■□□□□ 8.3
GRSF1Q12849 HNRNPH1-203ENST00000393432 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.112e-15■□□□□ 8.3
GRSF1Q12849 HNRNPH1-218ENST00000510678 1996 ntTSL 514.22□□□□□ -0.132e-15■□□□□ 8.3
GRSF1Q12849 HNRNPH1-246ENST00000523449 793 ntTSL 314.03□□□□□ -0.162e-15■□□□□ 8.3
GRSF1Q12849 HNRNPH1-223ENST00000514332 2444 ntTSL 213.45□□□□□ -0.262e-15■□□□□ 8.3
GRSF1Q12849 HNRNPH1-216ENST00000510411 2105 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.32e-15■□□□□ 8.3
GRSF1Q12849 HNRNPH1-202ENST00000356731 3667 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.312e-15■□□□□ 8.3
GRSF1Q12849 HNRNPH1-206ENST00000502904 2913 ntTSL 210.87□□□□□ -0.672e-15■□□□□ 8.3
GRSF1Q12849 HNRNPH1-227ENST00000515481 5564 ntTSL 26.17□□□□□ -1.422e-15■□□□□ 8.3
GRSF1Q12849 HIST1H4B-201ENST00000377745 438 ntAPPRIS P1 BASIC14.1□□□□□ -0.158e-27■□□□□ 8.3
GRSF1Q12849 ARHGEF1-218ENST00000599589 2636 ntTSL 1 (best)19.4■□□□□ 0.71e-6■□□□□ 8.3
GRSF1Q12849 ARHGEF1-205ENST00000593609 576 ntTSL 219.28■□□□□ 0.681e-6■□□□□ 8.3
GRSF1Q12849 ARHGEF1-213ENST00000595897 2973 ntTSL 1 (best)17.29■□□□□ 0.361e-6■□□□□ 8.3
GRSF1Q12849 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.131e-6■□□□□ 8.3
GRSF1Q12849 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.061e-6■□□□□ 8.3
GRSF1Q12849 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.131e-6■□□□□ 8.3
GRSF1Q12849 ARHGEF1-201ENST00000337665 3171 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.171e-6■□□□□ 8.3
GRSF1Q12849 ARHGEF1-203ENST00000354532 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.311e-6■□□□□ 8.3
GRSF1Q12849 ARHGEF1-220ENST00000600274 3439 ntTSL 1 (best)10.9□□□□□ -0.661e-6■□□□□ 8.3
GRSF1Q12849 PHLDB3-205ENST00000596902 808 ntTSL 1 (best)24.23■■□□□ 1.471e-6■□□□□ 8.3
GRSF1Q12849 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.071e-6■□□□□ 8.3
GRSF1Q12849 HIBADH-203ENST00000428288 1669 ntTSL 320.24■□□□□ 0.831e-6■□□□□ 8.3
GRSF1Q12849 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.761e-6■□□□□ 8.3
GRSF1Q12849 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.681e-6■□□□□ 8.3
GRSF1Q12849 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.631e-6■□□□□ 8.3
GRSF1Q12849 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.31e-6■□□□□ 8.3
GRSF1Q12849 PSMB5-202ENST00000361611 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.031e-6■□□□□ 8.3
GRSF1Q12849 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.031e-6■□□□□ 8.3
GRSF1Q12849 PSMB5-206ENST00000555895 444 ntTSL 315.23■□□□□ 0.031e-6■□□□□ 8.3
GRSF1Q12849 HIBADH-202ENST00000425715 618 ntTSL 214.75□□□□□ -0.051e-6■□□□□ 8.3
GRSF1Q12849 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.128e-9■□□□□ 8.3
GRSF1Q12849 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.074e-39■□□□□ 8.2
GRSF1Q12849 CALR-204ENST00000586967 394 ntTSL 215.01□□□□□ -0.014e-39■□□□□ 8.2
Retrieved 100 of 3,244 protein–RNA pairs in 93.6 ms