Protein–RNA interactions for Protein: Q15061

WDR43, WD repeat-containing protein 43, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 677 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR43Q15061 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.796e-6■□□□□ 10.6
WDR43Q15061 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.796e-6■□□□□ 10.6
WDR43Q15061 RBM6-209ENST00000441115 1876 ntTSL 224.61■■□□□ 1.536e-6■□□□□ 10.6
WDR43Q15061 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.266e-6■□□□□ 10.6
WDR43Q15061 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.146e-6■□□□□ 10.6
WDR43Q15061 AGXT-204ENST00000476698 507 ntTSL 520.53■□□□□ 0.886e-6■□□□□ 10.6
WDR43Q15061 COL27A1-203ENST00000468565 1946 ntTSL 219.06■□□□□ 0.644e-8■□□□□ 10.6
WDR43Q15061 RBM6-201ENST00000266022 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.556e-6■□□□□ 10.6
WDR43Q15061 RBM6-211ENST00000443081 4010 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.556e-6■□□□□ 10.6
WDR43Q15061 AGXT-203ENST00000472436 1034 ntTSL 217.84■□□□□ 0.456e-6■□□□□ 10.6
WDR43Q15061 TTYH3-204ENST00000407643 4537 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.426e-6■□□□□ 10.6
WDR43Q15061 PRRC2C-208ENST00000476522 1931 ntTSL 516.18■□□□□ 0.186e-6■□□□□ 10.6
WDR43Q15061 TTYH3-203ENST00000403167 4263 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.146e-6■□□□□ 10.6
WDR43Q15061 RBM6-213ENST00000454079 4324 ntTSL 215.73■□□□□ 0.116e-6■□□□□ 10.6
WDR43Q15061 PRRC2C-204ENST00000426496 10175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.136e-6■□□□□ 10.6
WDR43Q15061 PRRC2C-203ENST00000392078 1919 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.446e-6■□□□□ 10.6
WDR43Q15061 PRRC2C-201ENST00000338920 10355 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.716e-6■□□□□ 10.6
WDR43Q15061 PRRC2C-202ENST00000367742 10366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.976e-6■□□□□ 10.6
WDR43Q15061 RBM6-207ENST00000434592 2342 ntTSL 28.43□□□□□ -1.066e-6■□□□□ 10.6
WDR43Q15061 RBM6-208ENST00000438912 473 ntTSL 55.15□□□□□ -1.596e-6■□□□□ 10.6
WDR43Q15061 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.942e-8■□□□□ 10.5
WDR43Q15061 SLC16A3-209ENST00000580098 859 ntTSL 225.99■■□□□ 1.752e-8■□□□□ 10.5
WDR43Q15061 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.837e-7■□□□□ 10.5
WDR43Q15061 GOLGA4-204ENST00000429018 2036 ntTSL 1 (best)20.97■□□□□ 0.954e-6■□□□□ 10.4
WDR43Q15061 SNORD65B-201ENST00000459126 73 ntBASIC0.52□□□□□ -2.333e-12■□□□□ 10.4
WDR43Q15061 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.224e-6■□□□□ 10.4
WDR43Q15061 ATXN2L-207ENST00000561732 643 ntTSL 225.24■■□□□ 1.632e-7■□□□□ 10.4
WDR43Q15061 ATXN2L-217ENST00000565845 750 ntTSL 523.34■■□□□ 1.332e-7■□□□□ 10.4
WDR43Q15061 ATXN2L-212ENST00000564035 786 ntTSL 221.74■■□□□ 1.072e-7■□□□□ 10.4
WDR43Q15061 ATXN2L-224ENST00000569318 559 ntTSL 521.05■□□□□ 0.962e-7■□□□□ 10.4
WDR43Q15061 HIST1H2AE-201ENST00000303910 509 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.312e-7■□□□□ 10.4
WDR43Q15061 ATXN2L-209ENST00000562686 489 ntTSL 316.76■□□□□ 0.272e-7■□□□□ 10.4
WDR43Q15061 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.172e-6■□□□□ 10.4
WDR43Q15061 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.942e-6■□□□□ 10.4
WDR43Q15061 HSP90B1-203ENST00000548462 3032 ntTSL 215.38■□□□□ 0.052e-6■□□□□ 10.4
WDR43Q15061 PCF11-203ENST00000530304 2649 ntTSL 1 (best)25.69■■□□□ 1.72e-6■□□□□ 10.4
WDR43Q15061 PCF11-206ENST00000533018 580 ntTSL 323.38■■□□□ 1.332e-6■□□□□ 10.4
WDR43Q15061 PCF11-207ENST00000624931 1720 nt22.94■■□□□ 1.262e-6■□□□□ 10.4
WDR43Q15061 PCF11-204ENST00000530660 3309 ntTSL 217.69■□□□□ 0.422e-6■□□□□ 10.4
WDR43Q15061 PCF11-201ENST00000298281 7677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.142e-6■□□□□ 10.4
WDR43Q15061 EHBP1-204ENST00000405482 1311 ntTSL 229.76■■■□□ 2.364e-12■□□□□ 10.4
WDR43Q15061 EHBP1-205ENST00000413434 533 ntTSL 413.07□□□□□ -0.324e-12■□□□□ 10.4
WDR43Q15061 EHBP1-217ENST00000472809 1374 ntTSL 512.43□□□□□ -0.424e-12■□□□□ 10.4
WDR43Q15061 EHBP1-211ENST00000449820 539 ntTSL 511.95□□□□□ -0.54e-12■□□□□ 10.4
WDR43Q15061 EHBP1-207ENST00000426940 586 ntTSL 410.12□□□□□ -0.794e-12■□□□□ 10.4
WDR43Q15061 EHBP1-208ENST00000427809 581 ntTSL 47.33□□□□□ -1.244e-12■□□□□ 10.4
WDR43Q15061 EHBP1-219ENST00000494958 1127 ntTSL 1 (best)5.79□□□□□ -1.484e-12■□□□□ 10.4
WDR43Q15061 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.997e-7■□□□□ 10.4
WDR43Q15061 HECTD1-219ENST00000611816 8980 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.447e-7■□□□□ 10.4
WDR43Q15061 HECTD1-203ENST00000553700 9080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.327e-7■□□□□ 10.4
WDR43Q15061 HECTD1-204ENST00000553957 4395 ntTSL 25.68□□□□□ -1.57e-7■□□□□ 10.4
WDR43Q15061 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.085e-7■□□□□ 10.4
WDR43Q15061 EPRS-204ENST00000477030 1526 ntTSL 1 (best)27.08■■□□□ 1.935e-7■□□□□ 10.4
WDR43Q15061 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.745e-7■□□□□ 10.4
WDR43Q15061 EPRS-201ENST00000366923 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.425e-7■□□□□ 10.4
WDR43Q15061 LDHA-205ENST00000422447 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.295e-7■□□□□ 10.4
WDR43Q15061 LDHA-222ENST00000543695 554 ntTSL 514.93□□□□□ -0.025e-7■□□□□ 10.4
WDR43Q15061 LDHA-215ENST00000537296 1511 ntTSL 214.35□□□□□ -0.115e-7■□□□□ 10.4
WDR43Q15061 EPRS-206ENST00000609181 2968 ntTSL 1 (best)14.13□□□□□ -0.155e-7■□□□□ 10.4
WDR43Q15061 LDHA-216ENST00000538451 1345 ntTSL 213.5□□□□□ -0.255e-7■□□□□ 10.4
WDR43Q15061 LDHA-207ENST00000460405 680 ntTSL 313.32□□□□□ -0.285e-7■□□□□ 10.4
WDR43Q15061 LDHA-220ENST00000542179 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.445e-7■□□□□ 10.4
WDR43Q15061 ZNF146-202ENST00000456324 3780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.515e-7■□□□□ 10.4
WDR43Q15061 LDHA-218ENST00000540430 2305 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.525e-7■□□□□ 10.4
WDR43Q15061 ZNF146-203ENST00000586094 565 ntTSL 210.84□□□□□ -0.675e-7■□□□□ 10.4
WDR43Q15061 LDHA-201ENST00000227157 1887 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.695e-7■□□□□ 10.4
WDR43Q15061 LDHA-204ENST00000396222 1766 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.795e-7■□□□□ 10.4
WDR43Q15061 ZNF146-204ENST00000587285 571 ntTSL 1 (best)9.95□□□□□ -0.825e-7■□□□□ 10.4
WDR43Q15061 LDHA-210ENST00000486690 664 ntTSL 59.51□□□□□ -0.895e-7■□□□□ 10.4
WDR43Q15061 LDHA-206ENST00000430553 1310 ntTSL 2 BASIC9.46□□□□□ -0.95e-7■□□□□ 10.4
WDR43Q15061 LDHA-214ENST00000536528 516 ntTSL 39.14□□□□□ -0.955e-7■□□□□ 10.4
WDR43Q15061 LDHA-219ENST00000541097 582 ntTSL 38.95□□□□□ -0.985e-7■□□□□ 10.4
WDR43Q15061 LDHA-202ENST00000375710 2169 ntTSL 28.76□□□□□ -1.015e-7■□□□□ 10.4
WDR43Q15061 LDHA-223ENST00000545215 1340 ntTSL 1 (best)8.42□□□□□ -1.065e-7■□□□□ 10.4
WDR43Q15061 ZNF146-201ENST00000443387 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.16□□□□□ -1.15e-7■□□□□ 10.4
WDR43Q15061 ZNF146-205ENST00000591063 533 ntTSL 24.56□□□□□ -1.685e-7■□□□□ 10.4
WDR43Q15061 UTRN-206ENST00000421035 572 ntTSL 28.47□□□□□ -1.056e-7■□□□□ 10.4
WDR43Q15061 UTRN-213ENST00000628146 597 ntTSL 22.79□□□□□ -1.966e-7■□□□□ 10.4
WDR43Q15061 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC23.15■■□□□ 1.31e-323■□□□□ 10.3
WDR43Q15061 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC22.84■■□□□ 1.251e-323■□□□□ 10.3
WDR43Q15061 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.033e-6■□□□□ 10.3
WDR43Q15061 EEF2-205ENST00000598436 549 ntTSL 217.02■□□□□ 0.327e-37■□□□□ 10.3
WDR43Q15061 EEF2-201ENST00000309311 3164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.17e-37■□□□□ 10.3
WDR43Q15061 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.136e-7■□□□□ 10.3
WDR43Q15061 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.896e-7■□□□□ 10.3
WDR43Q15061 HDGF-205ENST00000469145 844 ntTSL 227■■□□□ 1.916e-7■□□□□ 10.3
WDR43Q15061 HDGF-209ENST00000495212 744 ntTSL 326.24■■□□□ 1.796e-7■□□□□ 10.3
WDR43Q15061 HDGF-204ENST00000465180 2060 ntTSL 1 (best)20.72■□□□□ 0.916e-7■□□□□ 10.3
WDR43Q15061 HDGF-207ENST00000477306 686 ntTSL 218.94■□□□□ 0.626e-7■□□□□ 10.3
WDR43Q15061 HDGF-203ENST00000368209 2171 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.446e-7■□□□□ 10.3
WDR43Q15061 HDGF-202ENST00000368206 960 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.376e-7■□□□□ 10.3
WDR43Q15061 HDGF-206ENST00000471377 592 ntTSL 312.09□□□□□ -0.476e-7■□□□□ 10.3
WDR43Q15061 HDGF-208ENST00000482651 966 ntTSL 311.48□□□□□ -0.576e-7■□□□□ 10.3
WDR43Q15061 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.841e-10■□□□□ 10.3
WDR43Q15061 SRSF5-201ENST00000394366 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.441e-10■□□□□ 10.3
WDR43Q15061 SRSF5-215ENST00000556587 1863 ntTSL 1 (best)16.8■□□□□ 0.281e-10■□□□□ 10.3
WDR43Q15061 SRSF5-205ENST00000553635 1412 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.151e-10■□□□□ 10.3
WDR43Q15061 SRSF5-212ENST00000556184 2443 ntTSL 1 (best)13.58□□□□□ -0.241e-10■□□□□ 10.3
WDR43Q15061 SRSF5-208ENST00000554929 947 ntTSL 213.47□□□□□ -0.251e-10■□□□□ 10.3
WDR43Q15061 SRSF5-217ENST00000557154 1500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.351e-10■□□□□ 10.3
Retrieved 100 of 3,951 protein–RNA pairs in 59.3 ms