Protein–RNA interactions for Protein: P53367

ARFIP1, Arfaptin-1, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFIP1P53367 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ARFIP1P53367 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ARFIP1P53367 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ARFIP1P53367 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ARFIP1P53367 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ARFIP1P53367 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ARFIP1P53367 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ARFIP1P53367 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ARFIP1P53367 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ARFIP1P53367 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ARFIP1P53367 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ARFIP1P53367 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ARFIP1P53367 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ARFIP1P53367 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ARFIP1P53367 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ARFIP1P53367 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
ARFIP1P53367 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ARFIP1P53367 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ARFIP1P53367 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ARFIP1P53367 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ARFIP1P53367 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ARFIP1P53367 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ARFIP1P53367 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ARFIP1P53367 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ARFIP1P53367 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ARFIP1P53367 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ARFIP1P53367 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ARFIP1P53367 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ARFIP1P53367 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ARFIP1P53367 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ARFIP1P53367 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ARFIP1P53367 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ARFIP1P53367 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ARFIP1P53367 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ARFIP1P53367 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ARFIP1P53367 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ARFIP1P53367 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ARFIP1P53367 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ARFIP1P53367 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ARFIP1P53367 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ARFIP1P53367 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ARFIP1P53367 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ARFIP1P53367 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ARFIP1P53367 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ARFIP1P53367 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ARFIP1P53367 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ARFIP1P53367 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ARFIP1P53367 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ARFIP1P53367 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ARFIP1P53367 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ARFIP1P53367 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ARFIP1P53367 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ARFIP1P53367 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ARFIP1P53367 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ARFIP1P53367 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ARFIP1P53367 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ARFIP1P53367 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ARFIP1P53367 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ARFIP1P53367 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ARFIP1P53367 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ARFIP1P53367 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ARFIP1P53367 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ARFIP1P53367 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ARFIP1P53367 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ARFIP1P53367 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ARFIP1P53367 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
ARFIP1P53367 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
ARFIP1P53367 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ARFIP1P53367 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ARFIP1P53367 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ARFIP1P53367 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ARFIP1P53367 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ARFIP1P53367 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ARFIP1P53367 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ARFIP1P53367 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ARFIP1P53367 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ARFIP1P53367 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
ARFIP1P53367 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ARFIP1P53367 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ARFIP1P53367 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ARFIP1P53367 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
ARFIP1P53367 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ARFIP1P53367 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ARFIP1P53367 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ARFIP1P53367 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
ARFIP1P53367 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ARFIP1P53367 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ARFIP1P53367 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ARFIP1P53367 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ARFIP1P53367 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ARFIP1P53367 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ARFIP1P53367 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ARFIP1P53367 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ARFIP1P53367 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ARFIP1P53367 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ARFIP1P53367 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ARFIP1P53367 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ARFIP1P53367 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ARFIP1P53367 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ARFIP1P53367 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms