Protein–RNA interactions for Protein: P22459

KCNA4, Potassium voltage-gated channel subfamily A member 4, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNA4P22459 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KCNA4P22459 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KCNA4P22459 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KCNA4P22459 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KCNA4P22459 OR6C65-201ENST00000379665 1076 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KCNA4P22459 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KCNA4P22459 TRIM36-IT1-201ENST00000503723 881 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
KCNA4P22459 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KCNA4P22459 AC020658.4-201ENST00000613987 684 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
KCNA4P22459 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KCNA4P22459 AC005785.2-201ENST00000624655 631 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
KCNA4P22459 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KCNA4P22459 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KCNA4P22459 AC123912.3-201ENST00000600907 1367 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
KCNA4P22459 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KCNA4P22459 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KCNA4P22459 C3orf49-201ENST00000295896 1292 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KCNA4P22459 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KCNA4P22459 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KCNA4P22459 GYG2-AS1-201ENST00000445107 515 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KCNA4P22459 RPL12P24-201ENST00000474907 486 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
KCNA4P22459 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KCNA4P22459 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KCNA4P22459 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KCNA4P22459 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KCNA4P22459 AC073987.1-201ENST00000422683 638 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KCNA4P22459 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KCNA4P22459 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
KCNA4P22459 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KCNA4P22459 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KCNA4P22459 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KCNA4P22459 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KCNA4P22459 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KCNA4P22459 FABP5-201ENST00000297258 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KCNA4P22459 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KCNA4P22459 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KCNA4P22459 LINC01221-201ENST00000432488 662 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KCNA4P22459 NOVA1-209ENST00000547619 947 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KCNA4P22459 AC008567.2-201ENST00000589751 656 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KCNA4P22459 AC005954.1-201ENST00000591962 337 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KCNA4P22459 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KCNA4P22459 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KCNA4P22459 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KCNA4P22459 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KCNA4P22459 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KCNA4P22459 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KCNA4P22459 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KCNA4P22459 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KCNA4P22459 COA1-202ENST00000310564 1085 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KCNA4P22459 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KCNA4P22459 AC090079.2-201ENST00000575289 768 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
KCNA4P22459 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KCNA4P22459 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KCNA4P22459 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KCNA4P22459 LINC01108-202ENST00000635227 776 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KCNA4P22459 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KCNA4P22459 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KCNA4P22459 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KCNA4P22459 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KCNA4P22459 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KCNA4P22459 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KCNA4P22459 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
KCNA4P22459 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
KCNA4P22459 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KCNA4P22459 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
KCNA4P22459 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KCNA4P22459 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
KCNA4P22459 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KCNA4P22459 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KCNA4P22459 TPRG1-AS2-201ENST00000425454 479 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
KCNA4P22459 AC021546.1-201ENST00000518927 1031 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
KCNA4P22459 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KCNA4P22459 AC019227.1-201ENST00000526902 510 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
KCNA4P22459 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
KCNA4P22459 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KCNA4P22459 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KCNA4P22459 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KCNA4P22459 AC005162.3-202ENST00000609495 483 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KCNA4P22459 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KCNA4P22459 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KCNA4P22459 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KCNA4P22459 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KCNA4P22459 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KCNA4P22459 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KCNA4P22459 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KCNA4P22459 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KCNA4P22459 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KCNA4P22459 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KCNA4P22459 STATH-202ENST00000381060 534 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KCNA4P22459 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KCNA4P22459 TMEM177-203ENST00000409951 1216 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KCNA4P22459 VN1R53P-201ENST00000429536 957 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
KCNA4P22459 AC008080.4-202ENST00000440034 1005 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KCNA4P22459 AC068985.1-201ENST00000463297 703 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KCNA4P22459 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KCNA4P22459 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KCNA4P22459 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KCNA4P22459 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KCNA4P22459 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
KCNA4P22459 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms