Protein–RNA interactions for Protein: C9JL84

HHLA1, HERV-H LTR-associating protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HHLA1C9JL84 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HHLA1C9JL84 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HHLA1C9JL84 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HHLA1C9JL84 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HHLA1C9JL84 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HHLA1C9JL84 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HHLA1C9JL84 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HHLA1C9JL84 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HHLA1C9JL84 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
HHLA1C9JL84 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
HHLA1C9JL84 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
HHLA1C9JL84 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
HHLA1C9JL84 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HHLA1C9JL84 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HHLA1C9JL84 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HHLA1C9JL84 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HHLA1C9JL84 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HHLA1C9JL84 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HHLA1C9JL84 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HHLA1C9JL84 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HHLA1C9JL84 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
HHLA1C9JL84 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HHLA1C9JL84 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HHLA1C9JL84 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HHLA1C9JL84 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HHLA1C9JL84 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
HHLA1C9JL84 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HHLA1C9JL84 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HHLA1C9JL84 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HHLA1C9JL84 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
HHLA1C9JL84 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
HHLA1C9JL84 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HHLA1C9JL84 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HHLA1C9JL84 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HHLA1C9JL84 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HHLA1C9JL84 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HHLA1C9JL84 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HHLA1C9JL84 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HHLA1C9JL84 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HHLA1C9JL84 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HHLA1C9JL84 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HHLA1C9JL84 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
HHLA1C9JL84 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HHLA1C9JL84 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HHLA1C9JL84 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HHLA1C9JL84 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HHLA1C9JL84 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HHLA1C9JL84 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HHLA1C9JL84 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HHLA1C9JL84 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HHLA1C9JL84 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HHLA1C9JL84 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HHLA1C9JL84 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HHLA1C9JL84 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HHLA1C9JL84 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HHLA1C9JL84 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
HHLA1C9JL84 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HHLA1C9JL84 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
HHLA1C9JL84 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HHLA1C9JL84 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HHLA1C9JL84 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HHLA1C9JL84 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HHLA1C9JL84 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HHLA1C9JL84 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HHLA1C9JL84 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HHLA1C9JL84 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HHLA1C9JL84 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HHLA1C9JL84 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HHLA1C9JL84 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HHLA1C9JL84 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HHLA1C9JL84 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HHLA1C9JL84 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
HHLA1C9JL84 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HHLA1C9JL84 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HHLA1C9JL84 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HHLA1C9JL84 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HHLA1C9JL84 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HHLA1C9JL84 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HHLA1C9JL84 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
HHLA1C9JL84 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
HHLA1C9JL84 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
HHLA1C9JL84 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
HHLA1C9JL84 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HHLA1C9JL84 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HHLA1C9JL84 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HHLA1C9JL84 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HHLA1C9JL84 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HHLA1C9JL84 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HHLA1C9JL84 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HHLA1C9JL84 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HHLA1C9JL84 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HHLA1C9JL84 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HHLA1C9JL84 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HHLA1C9JL84 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HHLA1C9JL84 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HHLA1C9JL84 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HHLA1C9JL84 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
HHLA1C9JL84 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HHLA1C9JL84 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HHLA1C9JL84 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms