Protein–RNA interactions for Protein: A1L188

NDUFAF8, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex assembly factor 8, humanhuman

Predictions only

Length 74 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFAF8A1L188 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
NDUFAF8A1L188 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
NDUFAF8A1L188 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
NDUFAF8A1L188 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
NDUFAF8A1L188 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
NDUFAF8A1L188 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
NDUFAF8A1L188 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
NDUFAF8A1L188 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
NDUFAF8A1L188 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
NDUFAF8A1L188 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
NDUFAF8A1L188 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
NDUFAF8A1L188 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
NDUFAF8A1L188 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
NDUFAF8A1L188 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
NDUFAF8A1L188 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
NDUFAF8A1L188 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
NDUFAF8A1L188 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
NDUFAF8A1L188 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
NDUFAF8A1L188 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
NDUFAF8A1L188 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
NDUFAF8A1L188 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
NDUFAF8A1L188 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
NDUFAF8A1L188 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
NDUFAF8A1L188 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
NDUFAF8A1L188 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
NDUFAF8A1L188 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
NDUFAF8A1L188 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
NDUFAF8A1L188 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
NDUFAF8A1L188 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
NDUFAF8A1L188 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
NDUFAF8A1L188 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
NDUFAF8A1L188 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
NDUFAF8A1L188 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
NDUFAF8A1L188 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
NDUFAF8A1L188 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
NDUFAF8A1L188 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
NDUFAF8A1L188 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
NDUFAF8A1L188 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
NDUFAF8A1L188 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
NDUFAF8A1L188 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
NDUFAF8A1L188 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
NDUFAF8A1L188 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
NDUFAF8A1L188 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
NDUFAF8A1L188 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
NDUFAF8A1L188 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
NDUFAF8A1L188 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
NDUFAF8A1L188 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
NDUFAF8A1L188 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
NDUFAF8A1L188 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
NDUFAF8A1L188 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
NDUFAF8A1L188 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
NDUFAF8A1L188 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
NDUFAF8A1L188 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
NDUFAF8A1L188 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
NDUFAF8A1L188 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
NDUFAF8A1L188 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
NDUFAF8A1L188 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
NDUFAF8A1L188 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
NDUFAF8A1L188 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
NDUFAF8A1L188 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
NDUFAF8A1L188 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
NDUFAF8A1L188 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
NDUFAF8A1L188 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
NDUFAF8A1L188 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
NDUFAF8A1L188 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
NDUFAF8A1L188 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
NDUFAF8A1L188 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
NDUFAF8A1L188 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
NDUFAF8A1L188 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
NDUFAF8A1L188 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
NDUFAF8A1L188 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
NDUFAF8A1L188 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
NDUFAF8A1L188 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
NDUFAF8A1L188 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
NDUFAF8A1L188 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
NDUFAF8A1L188 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
NDUFAF8A1L188 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
NDUFAF8A1L188 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
NDUFAF8A1L188 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
NDUFAF8A1L188 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
NDUFAF8A1L188 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
NDUFAF8A1L188 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
NDUFAF8A1L188 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
NDUFAF8A1L188 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
NDUFAF8A1L188 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
NDUFAF8A1L188 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
NDUFAF8A1L188 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
NDUFAF8A1L188 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
NDUFAF8A1L188 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
NDUFAF8A1L188 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
NDUFAF8A1L188 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
NDUFAF8A1L188 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC9.46□□□□□ -0.89
NDUFAF8A1L188 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.46□□□□□ -0.89
NDUFAF8A1L188 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
NDUFAF8A1L188 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
NDUFAF8A1L188 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
NDUFAF8A1L188 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
NDUFAF8A1L188 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.89
NDUFAF8A1L188 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.89
NDUFAF8A1L188 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.46□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms