Protein–RNA interactions for Protein: P0DP42

TMEM225B, Transmembrane protein 225B, humanhuman

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Length 221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM225BP0DP42 CASC4-202ENST00000345795 3764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
TMEM225BP0DP42 AC020763.3-201ENST00000625095 2904 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
TMEM225BP0DP42 PAM-207ENST00000455264 2898 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
TMEM225BP0DP42 SYNM-203ENST00000560674 5908 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
TMEM225BP0DP42 NFATC1-204ENST00000397790 3453 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
TMEM225BP0DP42 SYNCRIP-201ENST00000355238 6449 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
TMEM225BP0DP42 AC026271.4-201ENST00000578214 1833 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
TMEM225BP0DP42 PCDHB10-201ENST00000239446 3290 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
TMEM225BP0DP42 AC092123.2-201ENST00000611189 5421 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
TMEM225BP0DP42 TPM2-204ENST00000378300 1771 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
TMEM225BP0DP42 HERPUD1-203ENST00000379792 1782 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
TMEM225BP0DP42 VHL-201ENST00000256474 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
TMEM225BP0DP42 UBN1-202ENST00000396658 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
TMEM225BP0DP42 MTMR11-201ENST00000369140 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
TMEM225BP0DP42 HNF1B-204ENST00000617811 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
TMEM225BP0DP42 KIF17-202ENST00000375044 3572 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
TMEM225BP0DP42 HNRNPUL1-204ENST00000392006 3555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
TMEM225BP0DP42 UBE2V1-224ENST00000625172 2297 ntTSL 4 BASIC11.97□□□□□ -0.49
TMEM225BP0DP42 SCAF4-201ENST00000286835 4193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
TMEM225BP0DP42 STRIP2-202ENST00000435494 2866 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
TMEM225BP0DP42 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
TMEM225BP0DP42 CELSR3-201ENST00000164024 11956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
TMEM225BP0DP42 GFRA2-202ENST00000517328 2104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
TMEM225BP0DP42 OS9-220ENST00000552285 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
TMEM225BP0DP42 EFHC1-227ENST00000637089 2133 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
TMEM225BP0DP42 SEC24B-201ENST00000265175 5083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
TMEM225BP0DP42 CDK11A-201ENST00000356200 2653 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
TMEM225BP0DP42 GPR176-201ENST00000299092 3844 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
TMEM225BP0DP42 BCL2L13-214ENST00000543133 4975 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
TMEM225BP0DP42 BCL2L13-217ENST00000618481 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
TMEM225BP0DP42 OS9-203ENST00000389142 2457 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
TMEM225BP0DP42 TJP2-206ENST00000453658 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
TMEM225BP0DP42 KCNH6-204ENST00000581784 3017 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
TMEM225BP0DP42 PCNX4-202ENST00000391611 4073 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
TMEM225BP0DP42 HERC5-201ENST00000264350 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
TMEM225BP0DP42 CEP112-202ENST00000392769 3517 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
TMEM225BP0DP42 NPTN-201ENST00000345330 2444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
TMEM225BP0DP42 PRUNE1-205ENST00000368937 1850 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
TMEM225BP0DP42 AC010970.1-201ENST00000445125 1848 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
TMEM225BP0DP42 BCRP2-203ENST00000461808 1832 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
TMEM225BP0DP42 AC002350.2-201ENST00000623894 1828 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
TMEM225BP0DP42 CTIF-202ENST00000382998 4407 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
TMEM225BP0DP42 PARP3-201ENST00000398755 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
TMEM225BP0DP42 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
TMEM225BP0DP42 ADARB2-AS1-201ENST00000381301 625 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
TMEM225BP0DP42 IGF2-201ENST00000381389 1023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
TMEM225BP0DP42 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
TMEM225BP0DP42 AC006987.1-201ENST00000413610 527 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
TMEM225BP0DP42 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
TMEM225BP0DP42 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
TMEM225BP0DP42 RPS27L-203ENST00000439025 970 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
TMEM225BP0DP42 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
TMEM225BP0DP42 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
TMEM225BP0DP42 RN7SL530P-201ENST00000485097 298 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
TMEM225BP0DP42 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
TMEM225BP0DP42 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
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TMEM225BP0DP42 ANP32A-210ENST00000560303 724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
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TMEM225BP0DP42 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
TMEM225BP0DP42 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
TMEM225BP0DP42 SDR9C7-201ENST00000293502 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
TMEM225BP0DP42 SLC6A19-201ENST00000304460 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
TMEM225BP0DP42 IRF2BPL-201ENST00000238647 4157 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.5
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TMEM225BP0DP42 NKAP-201ENST00000371410 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
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TMEM225BP0DP42 ANKZF1-201ENST00000323348 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
TMEM225BP0DP42 WNT9A-201ENST00000272164 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
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TMEM225BP0DP42 KDELR1-201ENST00000330720 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
TMEM225BP0DP42 POM121L14P-201ENST00000406100 1558 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
TMEM225BP0DP42 FAM200A-202ENST00000449309 2480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
TMEM225BP0DP42 ZFAT-209ENST00000520727 4686 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
TMEM225BP0DP42 CATSPERE-203ENST00000366534 3333 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
TMEM225BP0DP42 FAM155A-201ENST00000375915 8503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
TMEM225BP0DP42 MTMR3-201ENST00000323630 5866 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
TMEM225BP0DP42 C3orf18-206ENST00000449241 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
TMEM225BP0DP42 DMTF1-202ENST00000394703 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
TMEM225BP0DP42 ZBTB7B-203ENST00000417934 4017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
TMEM225BP0DP42 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
TMEM225BP0DP42 CXCR5-201ENST00000292174 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
TMEM225BP0DP42 LINC01029-204ENST00000583106 1465 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
TMEM225BP0DP42 UBBP4-202ENST00000584755 1459 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
TMEM225BP0DP42 SEPT6-201ENST00000343984 2693 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
TMEM225BP0DP42 PGM3-201ENST00000283977 2219 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
TMEM225BP0DP42 ROBO1-212ENST00000618833 7492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
TMEM225BP0DP42 IFT81-202ENST00000361948 3048 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
TMEM225BP0DP42 CAMTA2-204ENST00000414043 4589 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
TMEM225BP0DP42 KIRREL3-205ENST00000529097 3397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
TMEM225BP0DP42 PTPN6-202ENST00000399448 2159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
TMEM225BP0DP42 Z98885.3-201ENST00000624882 1757 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
TMEM225BP0DP42 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
TMEM225BP0DP42 ATG4C-201ENST00000317868 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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