RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264350.7

HERC5-201, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 5, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HERC5, Length 3,513 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC5-201ENST00000264350 NISCHQ9Y2I1 1504 aa27.26■■□□□ 1.95
HERC5-201ENST00000264350 DCAF8L2P0C7V8 631 aa24.26■■□□□ 1.47
HERC5-201ENST00000264350 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa24.22■■□□□ 1.47
HERC5-201ENST00000264350 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP23.76■■□□□ 1.39
HERC5-201ENST00000264350 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP22.87■■□□□ 1.25
HERC5-201ENST00000264350 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa22.78■■□□□ 1.24
HERC5-201ENST00000264350 MYO15BQ96JP2 1530 aa22.77■■□□□ 1.24
HERC5-201ENST00000264350 HRCP23327 699 aa22.66■■□□□ 1.22
HERC5-201ENST00000264350 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP22.57■■□□□ 1.2
HERC5-201ENST00000264350 CHIC1Q5VXU3 224 aa22.53■■□□□ 1.2
HERC5-201ENST00000264350 PCGF6Q9BYE7 350 aa22.53■■□□□ 1.2
HERC5-201ENST00000264350 ABCC9O60706 1549 aa22.44■■□□□ 1.18
HERC5-201ENST00000264350 EHMT2Q96KQ7 1210 aa22.36■■□□□ 1.17
HERC5-201ENST00000264350 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa22.19■■□□□ 1.14
HERC5-201ENST00000264350 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
HERC5-201ENST00000264350 SCRIBQ14160 1630 aa22.11■■□□□ 1.13
HERC5-201ENST00000264350 TRIM41Q8WV44 630 aa21.88■■□□□ 1.09
HERC5-201ENST00000264350 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa21.87■■□□□ 1.09
HERC5-201ENST00000264350 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP21.78■■□□□ 1.08
HERC5-201ENST00000264350 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP21.68■■□□□ 1.06
HERC5-201ENST00000264350 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP21.64■■□□□ 1.06
HERC5-201ENST00000264350 CECR2Q9BXF3 1484 aa21.61■■□□□ 1.05
HERC5-201ENST00000264350 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP21.49■■□□□ 1.03
HERC5-201ENST00000264350 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP21.42■■□□□ 1.02
HERC5-201ENST00000264350 NACADO15069 1562 aa21.42■■□□□ 1.02
HERC5-201ENST00000264350 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa21.37■■□□□ 1.01
HERC5-201ENST00000264350 MROH2BQ7Z745 1585 aa21.35■■□□□ 1.01
HERC5-201ENST00000264350 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP21.22■□□□□ 0.99
HERC5-201ENST00000264350 WIZO95785 1651 aa21.19■□□□□ 0.98
HERC5-201ENST00000264350 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP21.12■□□□□ 0.97
HERC5-201ENST00000264350 UBTFP17480 764 aaKnown RBP21.08■□□□□ 0.97
HERC5-201ENST00000264350 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP21.03■□□□□ 0.96
HERC5-201ENST00000264350 NEUROD1Q13562 356 aa20.95■□□□□ 0.94
HERC5-201ENST00000264350 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP20.95■□□□□ 0.94
HERC5-201ENST00000264350 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP20.94■□□□□ 0.94
HERC5-201ENST00000264350 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP20.93■□□□□ 0.94
HERC5-201ENST00000264350 ABCC8Q09428 1581 aa20.87■□□□□ 0.93
HERC5-201ENST00000264350 CCDC88BA6NC98 1476 aa20.85■□□□□ 0.93
HERC5-201ENST00000264350 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP20.81■□□□□ 0.92
HERC5-201ENST00000264350 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa20.74■□□□□ 0.91
HERC5-201ENST00000264350 SMARCA4P51532 1647 aa20.74■□□□□ 0.91
HERC5-201ENST00000264350 CSRNP3Q8WYN3 585 aa20.73■□□□□ 0.91
HERC5-201ENST00000264350 SOGA1O94964 1423 aa20.72■□□□□ 0.91
HERC5-201ENST00000264350 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP20.67■□□□□ 0.9
HERC5-201ENST00000264350 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP20.65■□□□□ 0.9
HERC5-201ENST00000264350 UNC13AQ9UPW8 1703 aa20.63■□□□□ 0.89
HERC5-201ENST00000264350 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa20.6■□□□□ 0.89
HERC5-201ENST00000264350 APLP2Q06481 763 aa20.58■□□□□ 0.88
HERC5-201ENST00000264350 SMARCA2P51531 1590 aa20.57■□□□□ 0.88
HERC5-201ENST00000264350 BICRAQ9NZM4 1560 aa20.56■□□□□ 0.88
HERC5-201ENST00000264350 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
HERC5-201ENST00000264350 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP20.54■□□□□ 0.88
HERC5-201ENST00000264350 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP20.52■□□□□ 0.88
HERC5-201ENST00000264350 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
HERC5-201ENST00000264350 CEP162Q5TB80 1403 aa20.48■□□□□ 0.87
HERC5-201ENST00000264350 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa20.46■□□□□ 0.87
HERC5-201ENST00000264350 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP20.4■□□□□ 0.86
HERC5-201ENST00000264350 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP20.39■□□□□ 0.86
HERC5-201ENST00000264350 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP20.39■□□□□ 0.86
HERC5-201ENST00000264350 TNIKQ9UKE5 1360 aa20.32■□□□□ 0.84
HERC5-201ENST00000264350 ITGAEP38570 1179 aa20.31■□□□□ 0.84
HERC5-201ENST00000264350 MIER1Q8N108 512 aa20.3■□□□□ 0.84
HERC5-201ENST00000264350 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
HERC5-201ENST00000264350 P3H3Q8IVL6 736 aa20.23■□□□□ 0.83
HERC5-201ENST00000264350 GOLGA3Q08378 1498 aa20.22■□□□□ 0.83
HERC5-201ENST00000264350 CLIP1P30622 1438 aa20.19■□□□□ 0.82
HERC5-201ENST00000264350 SYNJ1O43426 1573 aa20.17■□□□□ 0.82
HERC5-201ENST00000264350 EEA1Q15075 1411 aa20.17■□□□□ 0.82
HERC5-201ENST00000264350 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa20.12■□□□□ 0.81
HERC5-201ENST00000264350 CEP164Q9UPV0 1460 aa20.09■□□□□ 0.81
HERC5-201ENST00000264350 PEG3Q9GZU2 1588 aa19.98■□□□□ 0.79
HERC5-201ENST00000264350 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP19.97■□□□□ 0.79
HERC5-201ENST00000264350 DNAJC5BQ9UF47 199 aa19.97■□□□□ 0.79
HERC5-201ENST00000264350 NCAPD3P42695 1498 aa19.95■□□□□ 0.78
HERC5-201ENST00000264350 KIF27Q86VH2 1401 aa19.92■□□□□ 0.78
HERC5-201ENST00000264350 VPS8Q8N3P4 1428 aa19.9■□□□□ 0.78
HERC5-201ENST00000264350 CUX2O14529 1486 aa19.9■□□□□ 0.78
HERC5-201ENST00000264350 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP19.89■□□□□ 0.77
HERC5-201ENST00000264350 ARID3CA6NKF2 412 aa19.88■□□□□ 0.77
HERC5-201ENST00000264350 CADPSQ9ULU8 1353 aa19.85■□□□□ 0.77
HERC5-201ENST00000264350 MYT1Q01538 1121 aa19.83■□□□□ 0.77
HERC5-201ENST00000264350 CUX1P39880 1505 aa19.83■□□□□ 0.76
HERC5-201ENST00000264350 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP19.78■□□□□ 0.76
HERC5-201ENST00000264350 CFTRP13569 1480 aa19.78■□□□□ 0.76
HERC5-201ENST00000264350 NESP48681 1621 aa19.77■□□□□ 0.76
HERC5-201ENST00000264350 TOP2BQ02880 1626 aa19.76■□□□□ 0.75
HERC5-201ENST00000264350 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa19.76■□□□□ 0.75
HERC5-201ENST00000264350 KCNH8Q96L42 1107 aa19.75■□□□□ 0.75
HERC5-201ENST00000264350 KIF21BO75037 1637 aa19.74■□□□□ 0.75
HERC5-201ENST00000264350 HMGXB3Q12766 1538 aa19.73■□□□□ 0.75
HERC5-201ENST00000264350 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa19.72■□□□□ 0.75
HERC5-201ENST00000264350 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa19.7■□□□□ 0.74
HERC5-201ENST00000264350 IGF1RP08069 1367 aa19.7■□□□□ 0.74
HERC5-201ENST00000264350 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP19.7■□□□□ 0.74
HERC5-201ENST00000264350 FGD5Q6ZNL6 1462 aa19.68■□□□□ 0.74
HERC5-201ENST00000264350 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP19.68■□□□□ 0.74
HERC5-201ENST00000264350 FANCD2Q9BXW9 1451 aa19.67■□□□□ 0.74
HERC5-201ENST00000264350 ARAP1Q96P48 1450 aa19.65■□□□□ 0.74
HERC5-201ENST00000264350 PRXQ9BXM0 1461 aa19.64■□□□□ 0.73
HERC5-201ENST00000264350 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa19.63■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.5 ms