Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 TNIP3-201ENST00000057513 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CUL4BQ13620 CSNK1E-201ENST00000359867 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CUL4BQ13620 AC139795.2-201ENST00000499900 1751 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CUL4BQ13620 IFT172-203ENST00000416524 1982 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CUL4BQ13620 CHMP7-202ENST00000397677 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CUL4BQ13620 AC005865.2-203ENST00000636557 2959 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CUL4BQ13620 TRGV9-201ENST00000444775 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CUL4BQ13620 FBXO3-203ENST00000526785 5798 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CUL4BQ13620 PRR29-202ENST00000412177 3127 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CUL4BQ13620 DANT2-201ENST00000430756 2079 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CUL4BQ13620 FAM156A-208ENST00000615092 2098 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CUL4BQ13620 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CUL4BQ13620 CRB3-201ENST00000308243 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CUL4BQ13620 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CUL4BQ13620 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CUL4BQ13620 PPP1R2P4-201ENST00000424051 595 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CUL4BQ13620 LINC00313-205ENST00000427188 967 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CUL4BQ13620 TEX36-AS1-202ENST00000446081 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CUL4BQ13620 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CUL4BQ13620 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CUL4BQ13620 POU5F1P2-201ENST00000521750 823 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CUL4BQ13620 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CUL4BQ13620 NDUFC1-209ENST00000539002 1198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CUL4BQ13620 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CUL4BQ13620 NDUFC1-211ENST00000544855 1257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CUL4BQ13620 NACA-221ENST00000552540 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CUL4BQ13620 AC015660.1-201ENST00000560103 395 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CUL4BQ13620 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CUL4BQ13620 PRKAB1-210ENST00000630317 258 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CUL4BQ13620 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CUL4BQ13620 NHSL1-202ENST00000343505 6535 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CUL4BQ13620 DDX31-204ENST00000372159 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CUL4BQ13620 AC125611.4-201ENST00000553259 4166 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CUL4BQ13620 KCNT1-212ENST00000628528 7057 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CUL4BQ13620 LINC00174-204ENST00000421767 4702 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CUL4BQ13620 MAP3K21-202ENST00000366623 3910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CUL4BQ13620 AC036108.2-201ENST00000566974 2562 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CUL4BQ13620 ALDH7A1-234ENST00000637782 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CUL4BQ13620 ATN1-201ENST00000356654 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CUL4BQ13620 AC012531.1-201ENST00000562848 2680 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CUL4BQ13620 TBC1D22A-201ENST00000337137 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CUL4BQ13620 CRISP2-201ENST00000339139 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CUL4BQ13620 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CUL4BQ13620 RHPN1-AS1-201ENST00000518049 1918 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CUL4BQ13620 GDPD5-201ENST00000336898 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CUL4BQ13620 ITGA6-202ENST00000409080 5306 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CUL4BQ13620 LILRB3-201ENST00000245620 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CUL4BQ13620 GOLGA8K-202ENST00000512626 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CUL4BQ13620 KIF21B-201ENST00000332129 9897 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CUL4BQ13620 MLPH-201ENST00000264605 3823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CUL4BQ13620 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CUL4BQ13620 MPLKIP-201ENST00000306984 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CUL4BQ13620 ATF3-202ENST00000341491 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CUL4BQ13620 CCNE2-201ENST00000308108 2724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CUL4BQ13620 LINC01229-201ENST00000561510 1494 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CUL4BQ13620 UMODL1-206ENST00000408989 5262 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CUL4BQ13620 SLC38A1-204ENST00000546893 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CUL4BQ13620 PDLIM5-203ENST00000359265 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CUL4BQ13620 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CUL4BQ13620 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CUL4BQ13620 AC007279.1-201ENST00000448547 837 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CUL4BQ13620 AC011247.2-201ENST00000457097 233 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CUL4BQ13620 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CUL4BQ13620 FRMD4A-204ENST00000475141 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CUL4BQ13620 PCMTD1-207ENST00000522514 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CUL4BQ13620 SERGEF-208ENST00000528200 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CUL4BQ13620 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CUL4BQ13620 AC079174.1-201ENST00000552486 312 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CUL4BQ13620 PPCDC-205ENST00000563393 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CUL4BQ13620 PPCDC-208ENST00000567336 892 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CUL4BQ13620 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CUL4BQ13620 MIR3940-201ENST00000579148 102 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CUL4BQ13620 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CUL4BQ13620 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CUL4BQ13620 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CUL4BQ13620 BMT2-201ENST00000297145 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CUL4BQ13620 ZFYVE19-202ENST00000336455 1784 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CUL4BQ13620 SLC26A8-202ENST00000394602 3144 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CUL4BQ13620 VWCE-205ENST00000535710 1437 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CUL4BQ13620 SLC5A5-201ENST00000222248 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CUL4BQ13620 PES1P2-201ENST00000449745 1735 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CUL4BQ13620 IFT81-202ENST00000361948 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CUL4BQ13620 DDX19B-202ENST00000355992 1692 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CUL4BQ13620 ZFYVE19-215ENST00000570108 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CUL4BQ13620 PCDHB19P-202ENST00000625133 2914 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CUL4BQ13620 FGGY-201ENST00000303721 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CUL4BQ13620 ALDH7A1-201ENST00000409134 4964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CUL4BQ13620 KCNJ9-201ENST00000368088 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CUL4BQ13620 RHOH-224ENST00000622175 2254 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CUL4BQ13620 PHF21B-201ENST00000313237 3671 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CUL4BQ13620 NRIP3-201ENST00000309166 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CUL4BQ13620 PRDM10-204ENST00000423662 5998 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CUL4BQ13620 PTPN5-205ENST00000477854 2826 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CUL4BQ13620 LRCH3-206ENST00000438796 7394 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CUL4BQ13620 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CUL4BQ13620 PPDPF-202ENST00000370179 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CUL4BQ13620 IGHV1-3-201ENST00000390595 395 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CUL4BQ13620 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CUL4BQ13620 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CUL4BQ13620 FAM13B-203ENST00000425075 3098 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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