Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRD0

BUD13, BUD13 homolog, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 619 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BUD13Q9BRD0 CD151-215ENST00000529810 608 ntTSL 319.97■□□□□ 0.791e-10■■■■■ 28
BUD13Q9BRD0 CD151-219ENST00000531999 580 ntTSL 318.68■□□□□ 0.581e-10■■■■■ 28
BUD13Q9BRD0 CD151-208ENST00000525868 541 ntTSL 416.94■□□□□ 0.31e-10■■■■■ 28
BUD13Q9BRD0 CD151-217ENST00000530320 648 ntTSL 316.23■□□□□ 0.191e-10■■■■■ 28
BUD13Q9BRD0 CD151-218ENST00000530726 1407 ntTSL 515.19■□□□□ 0.021e-10■■■■■ 28
BUD13Q9BRD0 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.151e-7■■■■■ 28
BUD13Q9BRD0 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 11e-7■■■■■ 28
BUD13Q9BRD0 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.792e-10■■■■■ 28
BUD13Q9BRD0 SPG21-205ENST00000558339 582 ntTSL 426.11■■□□□ 1.772e-10■■■■■ 28
BUD13Q9BRD0 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.52e-10■■■■■ 28
BUD13Q9BRD0 SPG21-211ENST00000560564 607 ntTSL 418.77■□□□□ 0.62e-10■■■■■ 28
BUD13Q9BRD0 SPG21-204ENST00000557795 747 ntTSL 517.46■□□□□ 0.392e-10■■■■■ 28
BUD13Q9BRD0 SPG21-213ENST00000561078 1520 ntTSL 516.78■□□□□ 0.282e-10■■■■■ 28
BUD13Q9BRD0 SPG21-206ENST00000558415 562 ntTSL 316.52■□□□□ 0.242e-10■■■■■ 28
BUD13Q9BRD0 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.182e-10■■■■■ 28
BUD13Q9BRD0 SPG21-207ENST00000558765 624 ntTSL 311.28□□□□□ -0.62e-10■■■■■ 28
BUD13Q9BRD0 SPG21-210ENST00000559677 553 ntTSL 310.56□□□□□ -0.722e-10■■■■■ 28
BUD13Q9BRD0 SPG21-208ENST00000558943 544 ntTSL 45.93□□□□□ -1.462e-10■■■■■ 28
BUD13Q9BRD0 SPG21-212ENST00000560878 541 ntTSL 55.35□□□□□ -1.552e-10■■■■■ 28
BUD13Q9BRD0 DUSP12-204ENST00000484291 1252 ntTSL 519.92■□□□□ 0.782e-9■■■■■ 28
BUD13Q9BRD0 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.72e-9■■■■■ 28
BUD13Q9BRD0 CBFA2T2-202ENST00000344201 1181 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.69e-8■■■■■ 28
BUD13Q9BRD0 ZNF629-201ENST00000262525 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.388e-8■■■■■ 28
BUD13Q9BRD0 MAEA-212ENST00000509531 1001 ntTSL 1 (best)22.25■■□□□ 1.152e-6■■■■■ 28
BUD13Q9BRD0 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.062e-6■■■■■ 28
BUD13Q9BRD0 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.042e-6■■■■■ 28
BUD13Q9BRD0 MAEA-209ENST00000506530 5371 ntTSL 220.93■□□□□ 0.943e-8■■■■■ 28
BUD13Q9BRD0 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.732e-6■■■■■ 28
BUD13Q9BRD0 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.612e-6■■■■■ 28
BUD13Q9BRD0 MAEA-215ENST00000512289 2426 ntTSL 218.76■□□□□ 0.593e-8■■■■■ 28
BUD13Q9BRD0 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.562e-6■■■■■ 28
BUD13Q9BRD0 MAEA-204ENST00000503162 2069 ntTSL 217.48■□□□□ 0.393e-8■■■■■ 28
BUD13Q9BRD0 MAEA-220ENST00000515766 3136 ntTSL 217■□□□□ 0.313e-8■■■■■ 28
BUD13Q9BRD0 MAEA-207ENST00000505177 1340 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.212e-6■■■■■ 28
BUD13Q9BRD0 YTHDF2-202ENST00000468863 687 ntTSL 38.7□□□□□ -1.029e-10■■■■■ 28
BUD13Q9BRD0 TNS1-202ENST00000310858 1792 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.97e-7■■■■■ 27.9
BUD13Q9BRD0 TNRC6A-205ENST00000464539 1853 ntTSL 1 (best)12.55□□□□□ -0.42e-6■■■■■ 27.9
BUD13Q9BRD0 TNRC6A-216ENST00000569098 587 ntTSL 55.98□□□□□ -1.452e-6■■■■■ 27.9
BUD13Q9BRD0 NUP85-207ENST00000578294 385 ntTSL 214.77□□□□□ -0.059e-9■■■■■ 27.9
BUD13Q9BRD0 SPTBN1-205ENST00000496323 2225 ntTSL 214.56□□□□□ -0.084e-58■■■■■ 27.9
BUD13Q9BRD0 AKAP10-207ENST00000572341 559 ntTSL 419.35■□□□□ 0.694e-10■■■■■ 27.9
BUD13Q9BRD0 AKAP10-208ENST00000576896 565 ntTSL 418.52■□□□□ 0.564e-10■■■■■ 27.9
BUD13Q9BRD0 AKAP10-210ENST00000582611 1319 ntTSL 517.49■□□□□ 0.394e-10■■■■■ 27.9
BUD13Q9BRD0 AKAP10-206ENST00000572155 578 ntTSL 416.98■□□□□ 0.314e-10■■■■■ 27.9
BUD13Q9BRD0 AKAP10-201ENST00000225737 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.362e-7■■■■■ 27.9
BUD13Q9BRD0 AKAP10-202ENST00000395536 1815 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.562e-7■■■■■ 27.9
BUD13Q9BRD0 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.061e-19■■■■■ 27.9
BUD13Q9BRD0 WBP2-205ENST00000586257 676 ntTSL 320.18■□□□□ 0.821e-19■■■■■ 27.9
BUD13Q9BRD0 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.71e-19■■■■■ 27.9
BUD13Q9BRD0 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.621e-19■■■■■ 27.9
BUD13Q9BRD0 WBP2-208ENST00000588373 1374 ntTSL 218.93■□□□□ 0.621e-19■■■■■ 27.9
BUD13Q9BRD0 WBP2-211ENST00000589642 568 ntTSL 318.84■□□□□ 0.615e-7■■■■■ 27.9
BUD13Q9BRD0 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.531e-19■■■■■ 27.9
BUD13Q9BRD0 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.461e-19■■■■■ 27.9
BUD13Q9BRD0 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.291e-19■■■■■ 27.9
BUD13Q9BRD0 WBP2-202ENST00000416574 987 ntTSL 214.98□□□□□ -0.015e-7■■■■■ 27.9
BUD13Q9BRD0 WBP2-216ENST00000591831 1406 ntTSL 514.66□□□□□ -0.061e-19■■■■■ 27.9
BUD13Q9BRD0 WBP2-206ENST00000587374 480 ntTSL 414.11□□□□□ -0.155e-7■■■■■ 27.9
BUD13Q9BRD0 WBP2-210ENST00000589241 557 ntTSL 213.82□□□□□ -0.25e-7■■■■■ 27.9
BUD13Q9BRD0 WBP2-218ENST00000593002 610 ntTSL 413.25□□□□□ -0.295e-7■■■■■ 27.9
BUD13Q9BRD0 WBP2-207ENST00000587642 3718 ntTSL 29.85□□□□□ -0.831e-19■■■■■ 27.9
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BUD13Q9BRD0 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.311e-7■■■■■ 27.9
BUD13Q9BRD0 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.121e-7■■■■■ 27.9
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BUD13Q9BRD0 SYNRG-229ENST00000621136 4841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.271e-7■■■■■ 27.9
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BUD13Q9BRD0 THAP7-205ENST00000471723 653 ntTSL 322.83■■□□□ 1.257e-8■■■■■ 27.8
BUD13Q9BRD0 FHOD1-202ENST00000561922 2069 ntTSL 222.44■■□□□ 1.187e-8■■■■■ 27.8
BUD13Q9BRD0 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.167e-8■■■■■ 27.8
BUD13Q9BRD0 FHOD1-208ENST00000568595 520 ntTSL 412.78□□□□□ -0.367e-8■■■■■ 27.8
BUD13Q9BRD0 SAT2-207ENST00000572224 669 ntTSL 312.38□□□□□ -0.436e-15■■■■■ 27.8
BUD13Q9BRD0 HERC1-206ENST00000559996 443 ntTSL 210.17□□□□□ -0.787e-8■■■■■ 27.8
BUD13Q9BRD0 AC018638.4-201ENST00000465971 1150 ntBASIC9.78□□□□□ -0.847e-8■■■■■ 27.8
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BUD13Q9BRD0 AIFM2-203ENST00000482166 952 ntTSL 312.88□□□□□ -0.351e-7■■■■■ 27.7
BUD13Q9BRD0 RECQL4-208ENST00000534626 1165 ntTSL 519.65■□□□□ 0.747e-12■■■■■ 27.7
BUD13Q9BRD0 GTPBP3-210ENST00000595951 532 ntTSL 413.84□□□□□ -0.191e-9■■■■■ 27.7
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BUD13Q9BRD0 RNF220-209ENST00000474064 2734 ntTSL 222.52■■□□□ 1.24e-7■■■■■ 27.7
BUD13Q9BRD0 RNF220-205ENST00000440132 1200 ntTSL 221.93■■□□□ 1.15e-7■■■■■ 27.7
BUD13Q9BRD0 RNF220-212ENST00000475378 916 ntTSL 321.79■■□□□ 1.083e-8■■■■■ 27.7
BUD13Q9BRD0 RNF220-214ENST00000484745 1951 ntTSL 519.03■□□□□ 0.643e-8■■■■■ 27.7
BUD13Q9BRD0 RNF220-204ENST00000372247 3010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.014e-7■■■■■ 27.7
BUD13Q9BRD0 RNF220-203ENST00000361799 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.014e-7■■■■■ 27.7
BUD13Q9BRD0 RNF220-202ENST00000355387 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.144e-7■■■■■ 27.7
BUD13Q9BRD0 VMP1-206ENST00000587945 583 ntTSL 316.79■□□□□ 0.289e-8■■■■■ 27.7
BUD13Q9BRD0 VMP1-217ENST00000593168 558 ntTSL 314.77□□□□□ -0.059e-8■■■■■ 27.7
BUD13Q9BRD0 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.65■■■□□ 2.59e-6■■■■■ 27.7
BUD13Q9BRD0 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.65■■■□□ 2.59e-6■■■■■ 27.7
BUD13Q9BRD0 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.439e-6■■■■■ 27.7
BUD13Q9BRD0 PPP5C-215ENST00000595055 556 ntTSL 228.48■■■□□ 2.153e-15■■■■■ 27.7
BUD13Q9BRD0 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.19e-6■■■■■ 27.7
BUD13Q9BRD0 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.059e-6■■■■■ 27.7
BUD13Q9BRD0 PTPRH-205ENST00000587662 571 ntTSL 427.71■■■□□ 2.033e-15■■■■■ 27.7
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