RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000310858.10

TNS1-202, Transcript of tensin 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TNS1, Length 1,792 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNS1-202ENST00000310858 NISCHQ9Y2I1 1504 aa20.68■□□□□ 0.9
TNS1-202ENST00000310858 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa18.09■□□□□ 0.49
TNS1-202ENST00000310858 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP17.34■□□□□ 0.37
TNS1-202ENST00000310858 ABCC9O60706 1549 aa17.16■□□□□ 0.34
TNS1-202ENST00000310858 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa17.1■□□□□ 0.33
TNS1-202ENST00000310858 DCAF8L2P0C7V8 631 aa17.07■□□□□ 0.32
TNS1-202ENST00000310858 MYO15BQ96JP2 1530 aa16.95■□□□□ 0.3
TNS1-202ENST00000310858 NACADO15069 1562 aa16.86■□□□□ 0.29
TNS1-202ENST00000310858 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa16.75■□□□□ 0.27
TNS1-202ENST00000310858 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa16.74■□□□□ 0.27
TNS1-202ENST00000310858 SCRIBQ14160 1630 aa16.59■□□□□ 0.25
TNS1-202ENST00000310858 UNC13AQ9UPW8 1703 aa16.43■□□□□ 0.22
TNS1-202ENST00000310858 BICRAQ9NZM4 1560 aa16.25■□□□□ 0.19
TNS1-202ENST00000310858 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP16.16■□□□□ 0.18
TNS1-202ENST00000310858 CECR2Q9BXF3 1484 aa16.07■□□□□ 0.16
TNS1-202ENST00000310858 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
TNS1-202ENST00000310858 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
TNS1-202ENST00000310858 MROH2BQ7Z745 1585 aa15.97■□□□□ 0.15
TNS1-202ENST00000310858 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.15
TNS1-202ENST00000310858 SMARCA4P51532 1647 aa15.91■□□□□ 0.14
TNS1-202ENST00000310858 WIZO95785 1651 aa15.83■□□□□ 0.13
TNS1-202ENST00000310858 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP15.75■□□□□ 0.11
TNS1-202ENST00000310858 PEG3Q9GZU2 1588 aa15.73■□□□□ 0.11
TNS1-202ENST00000310858 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa15.67■□□□□ 0.1
TNS1-202ENST00000310858 SMARCA2P51531 1590 aa15.66■□□□□ 0.1
TNS1-202ENST00000310858 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP15.66■□□□□ 0.1
TNS1-202ENST00000310858 NCAPD3P42695 1498 aa15.57■□□□□ 0.08
TNS1-202ENST00000310858 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP15.57■□□□□ 0.08
TNS1-202ENST00000310858 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa15.55■□□□□ 0.08
TNS1-202ENST00000310858 HMGXB3Q12766 1538 aa15.52■□□□□ 0.08
TNS1-202ENST00000310858 CCDC88BA6NC98 1476 aa15.5■□□□□ 0.07
TNS1-202ENST00000310858 CHIC1Q5VXU3 224 aa15.36■□□□□ 0.05
TNS1-202ENST00000310858 DNAJC5BQ9UF47 199 aa15.26■□□□□ 0.03
TNS1-202ENST00000310858 CFTRP13569 1480 aa15.18■□□□□ 0.02
TNS1-202ENST00000310858 CADPSQ9ULU8 1353 aa15.15■□□□□ 0.02
TNS1-202ENST00000310858 ABCC8Q09428 1581 aa15.13■□□□□ 0.01
TNS1-202ENST00000310858 TRIM41Q8WV44 630 aa15.13■□□□□ 0.01
TNS1-202ENST00000310858 PRDM2Q13029 1718 aa15.13■□□□□ 0.01
TNS1-202ENST00000310858 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa15.05■□□□□ 0
TNS1-202ENST00000310858 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP15.05■□□□□ -0
TNS1-202ENST00000310858 NESP48681 1621 aa15.04■□□□□ -0
TNS1-202ENST00000310858 SYNJ1O43426 1573 aa14.99□□□□□ -0.01
TNS1-202ENST00000310858 FANCD2Q9BXW9 1451 aa14.97□□□□□ -0.01
TNS1-202ENST00000310858 TOP2BQ02880 1626 aa14.95□□□□□ -0.02
TNS1-202ENST00000310858 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa14.95□□□□□ -0.02
TNS1-202ENST00000310858 PDS5BQ9NTI5 1447 aa14.93□□□□□ -0.02
TNS1-202ENST00000310858 CUX1P39880 1505 aa14.93□□□□□ -0.02
TNS1-202ENST00000310858 CEP164Q9UPV0 1460 aa14.89□□□□□ -0.03
TNS1-202ENST00000310858 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa14.87□□□□□ -0.03
TNS1-202ENST00000310858 DNMBPQ6XZF7 1577 aa14.83□□□□□ -0.03
TNS1-202ENST00000310858 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.03
TNS1-202ENST00000310858 SOGA1O94964 1423 aa14.83□□□□□ -0.04
TNS1-202ENST00000310858 TOPBP1Q92547 1522 aa14.81□□□□□ -0.04
TNS1-202ENST00000310858 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
TNS1-202ENST00000310858 EEA1Q15075 1411 aa14.79□□□□□ -0.04
TNS1-202ENST00000310858 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa14.79□□□□□ -0.04
TNS1-202ENST00000310858 FGD5Q6ZNL6 1462 aa14.78□□□□□ -0.04
TNS1-202ENST00000310858 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa14.76□□□□□ -0.05
TNS1-202ENST00000310858 MRC2Q9UBG0 1479 aa14.74□□□□□ -0.05
TNS1-202ENST00000310858 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
TNS1-202ENST00000310858 CSRNP3Q8WYN3 585 aa14.72□□□□□ -0.05
TNS1-202ENST00000310858 ERCC6Q03468 1493 aa14.71□□□□□ -0.05
TNS1-202ENST00000310858 KIF27Q86VH2 1401 aa14.67□□□□□ -0.06
TNS1-202ENST00000310858 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa14.67□□□□□ -0.06
TNS1-202ENST00000310858 WDR62O43379 1518 aa14.67□□□□□ -0.06
TNS1-202ENST00000310858 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa14.66□□□□□ -0.06
TNS1-202ENST00000310858 CUX2O14529 1486 aa14.65□□□□□ -0.06
TNS1-202ENST00000310858 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
TNS1-202ENST00000310858 WDR97A6NE52 1622 aa14.63□□□□□ -0.07
TNS1-202ENST00000310858 EHMT2Q96KQ7 1210 aa14.61□□□□□ -0.07
TNS1-202ENST00000310858 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
TNS1-202ENST00000310858 KIF21BO75037 1637 aa14.6□□□□□ -0.07
TNS1-202ENST00000310858 IGF1RP08069 1367 aa14.57□□□□□ -0.08
TNS1-202ENST00000310858 GOLGA3Q08378 1498 aa14.57□□□□□ -0.08
TNS1-202ENST00000310858 PRXQ9BXM0 1461 aa14.56□□□□□ -0.08
TNS1-202ENST00000310858 IFT140Q96RY7 1462 aa14.55□□□□□ -0.08
TNS1-202ENST00000310858 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa14.55□□□□□ -0.08
TNS1-202ENST00000310858 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
TNS1-202ENST00000310858 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa14.52□□□□□ -0.08
TNS1-202ENST00000310858 TNIKQ9UKE5 1360 aa14.52□□□□□ -0.08
TNS1-202ENST00000310858 ERICH3Q5RHP9 1530 aa14.52□□□□□ -0.09
TNS1-202ENST00000310858 GAPVD1Q14C86 1478 aa14.51□□□□□ -0.09
TNS1-202ENST00000310858 UBTFP17480 764 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
TNS1-202ENST00000310858 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa14.49□□□□□ -0.09
TNS1-202ENST00000310858 CUL7Q14999 1698 aa14.47□□□□□ -0.09
TNS1-202ENST00000310858 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP14.47□□□□□ -0.092e-7■■■□□ 18.3
TNS1-202ENST00000310858 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP14.46□□□□□ -0.09
TNS1-202ENST00000310858 PBRM1Q86U86 1689 aa14.45□□□□□ -0.1
TNS1-202ENST00000310858 GRIN2BQ13224 1484 aa14.42□□□□□ -0.1
TNS1-202ENST00000310858 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP14.41□□□□□ -0.1
TNS1-202ENST00000310858 CEP162Q5TB80 1403 aa14.4□□□□□ -0.1
TNS1-202ENST00000310858 FHAD1B1AJZ9 1412 aa14.36□□□□□ -0.11
TNS1-202ENST00000310858 ADAMTS12P58397 1594 aa14.36□□□□□ -0.11
TNS1-202ENST00000310858 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa14.32□□□□□ -0.12
TNS1-202ENST00000310858 CLIP1P30622 1438 aa14.32□□□□□ -0.12
TNS1-202ENST00000310858 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP14.31□□□□□ -0.12
TNS1-202ENST00000310858 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa14.3□□□□□ -0.12
TNS1-202ENST00000310858 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP14.27□□□□□ -0.12
TNS1-202ENST00000310858 SYNJ2O15056 1496 aa14.25□□□□□ -0.13
TNS1-202ENST00000310858 GRIN2AQ12879 1464 aa14.24□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.5 ms