RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587662.1

PTPRH-205, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type H, humanhuman

TSL 4

Gene PTPRH, Length 571 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRH-205ENST00000587662 NISCHQ9Y2I1 1504 aa59.08■■■■■ 7.05
PTPRH-205ENST00000587662 ABCC9O60706 1549 aa53.09■■■■■ 6.09
PTPRH-205ENST00000587662 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa52.93■■■■■ 6.06
PTPRH-205ENST00000587662 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa50.4■■■■■ 5.66
PTPRH-205ENST00000587662 NACADO15069 1562 aa50.08■■■■■ 5.61
PTPRH-205ENST00000587662 DNAJC5BQ9UF47 199 aa50.05■■■■■ 5.6
PTPRH-205ENST00000587662 DCAF8L2P0C7V8 631 aa49.72■■■■■ 5.55
PTPRH-205ENST00000587662 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP49.45■■■■■ 5.51
PTPRH-205ENST00000587662 MYO15BQ96JP2 1530 aa49.43■■■■■ 5.5
PTPRH-205ENST00000587662 UNC13AQ9UPW8 1703 aa49.35■■■■■ 5.49
PTPRH-205ENST00000587662 BICRAQ9NZM4 1560 aa49.15■■■■■ 5.46
PTPRH-205ENST00000587662 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP48.97■■■■■ 5.43
PTPRH-205ENST00000587662 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa48.78■■■■■ 5.4
PTPRH-205ENST00000587662 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa48.29■■■■■ 5.32
PTPRH-205ENST00000587662 SCRIBQ14160 1630 aa48.29■■■■■ 5.32
PTPRH-205ENST00000587662 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa47.94■■■■■ 5.26
PTPRH-205ENST00000587662 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP47.84■■■■■ 5.25
PTPRH-205ENST00000587662 CECR2Q9BXF3 1484 aa47.8■■■■■ 5.24
PTPRH-205ENST00000587662 NCAPD3P42695 1498 aa46.31■■■■■ 5
PTPRH-205ENST00000587662 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa46.18■■■■■ 4.98
PTPRH-205ENST00000587662 SMARCA4P51532 1647 aa46.07■■■■■ 4.97
PTPRH-205ENST00000587662 SMARCA2P51531 1590 aa45.92■■■■■ 4.94
PTPRH-205ENST00000587662 HMGXB3Q12766 1538 aa45.92■■■■■ 4.94
PTPRH-205ENST00000587662 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa45.84■■■■■ 4.93
PTPRH-205ENST00000587662 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP45.78■■■■■ 4.92
PTPRH-205ENST00000587662 CUX2O14529 1486 aa45.71■■■■■ 4.91
PTPRH-205ENST00000587662 ERCC6Q03468 1493 aa45.7■■■■■ 4.91
PTPRH-205ENST00000587662 PEG3Q9GZU2 1588 aa45.67■■■■■ 4.9
PTPRH-205ENST00000587662 NESP48681 1621 aa45.66■■■■■ 4.9
PTPRH-205ENST00000587662 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP45.63■■■■■ 4.9
PTPRH-205ENST00000587662 MROH2BQ7Z745 1585 aa45.58■■■■■ 4.89
PTPRH-205ENST00000587662 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa45.19■■■■■ 4.82
PTPRH-205ENST00000587662 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP45.16■■■■■ 4.82
PTPRH-205ENST00000587662 WIZO95785 1651 aa44.96■■■■■ 4.79
PTPRH-205ENST00000587662 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa44.96■■■■■ 4.79
PTPRH-205ENST00000587662 PDS5BQ9NTI5 1447 aa44.9■■■■■ 4.78
PTPRH-205ENST00000587662 CADPSQ9ULU8 1353 aa44.87■■■■■ 4.77
PTPRH-205ENST00000587662 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP44.61■■■■■ 4.73
PTPRH-205ENST00000587662 MRC2Q9UBG0 1479 aa44.58■■■■■ 4.73
PTPRH-205ENST00000587662 WDR62O43379 1518 aa44.51■■■■■ 4.72
PTPRH-205ENST00000587662 CFTRP13569 1480 aa44.39■■■■■ 4.7
PTPRH-205ENST00000587662 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP44.36■■■■■ 4.69
PTPRH-205ENST00000587662 FANCD2Q9BXW9 1451 aa44.35■■■■■ 4.69
PTPRH-205ENST00000587662 CEP164Q9UPV0 1460 aa44.35■■■■■ 4.69
PTPRH-205ENST00000587662 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP44.08■■■■■ 4.65
PTPRH-205ENST00000587662 CCDC88BA6NC98 1476 aa43.92■■■■■ 4.62
PTPRH-205ENST00000587662 PRDM2Q13029 1718 aa43.77■■■■■ 4.6
PTPRH-205ENST00000587662 TRIM41Q8WV44 630 aa43.7■■■■■ 4.59
PTPRH-205ENST00000587662 OSCARQ8IYS5 282 aa43.58■■■■■ 4.57
PTPRH-205ENST00000587662 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP43.56■■■■■ 4.56
PTPRH-205ENST00000587662 TOPBP1Q92547 1522 aa43.53■■■■■ 4.56
PTPRH-205ENST00000587662 IFT140Q96RY7 1462 aa43.49■■■■■ 4.55
PTPRH-205ENST00000587662 DNMBPQ6XZF7 1577 aa43.33■■■■■ 4.53
PTPRH-205ENST00000587662 ABCC8Q09428 1581 aa43.29■■■■■ 4.52
PTPRH-205ENST00000587662 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP43.21■■■■■ 4.51
PTPRH-205ENST00000587662 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP43.19■■■■■ 4.51
PTPRH-205ENST00000587662 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP43.11■■■■■ 4.491e-6■■■■□ 20.4
PTPRH-205ENST00000587662 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP43.1■■■■■ 4.49
PTPRH-205ENST00000587662 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa43.1■■■■■ 4.49
PTPRH-205ENST00000587662 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa43.1■■■■■ 4.49
PTPRH-205ENST00000587662 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa43.1■■■■■ 4.49
PTPRH-205ENST00000587662 ARHGEF11O15085 1522 aa42.97■■■■■ 4.47
PTPRH-205ENST00000587662 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa42.97■■■■■ 4.47
PTPRH-205ENST00000587662 CHD1O14646 1710 aa42.87■■■■■ 4.45
PTPRH-205ENST00000587662 SOGA1O94964 1423 aa42.84■■■■■ 4.45
PTPRH-205ENST00000587662 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP42.82■■■■■ 4.45
PTPRH-205ENST00000587662 CUX1P39880 1505 aa42.81■■■■■ 4.44
PTPRH-205ENST00000587662 FGD5Q6ZNL6 1462 aa42.8■■■■■ 4.44
PTPRH-205ENST00000587662 FBLN2P98095 1184 aa42.67■■■■■ 4.42
PTPRH-205ENST00000587662 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa42.62■■■■■ 4.41
PTPRH-205ENST00000587662 CYB5RLQ6IPT4 315 aa42.6■■■■■ 4.41
PTPRH-205ENST00000587662 ARAP1Q96P48 1450 aa42.6■■■■■ 4.41
PTPRH-205ENST00000587662 WDR97A6NE52 1622 aa42.6■■■■■ 4.41
PTPRH-205ENST00000587662 CLASP1Q7Z460 1538 aa42.47■■■■■ 4.39
PTPRH-205ENST00000587662 GRIN2BQ13224 1484 aa42.47■■■■■ 4.39
PTPRH-205ENST00000587662 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP42.47■■■■■ 4.39
PTPRH-205ENST00000587662 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP42.44■■■■■ 4.38
PTPRH-205ENST00000587662 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP42.36■■■■■ 4.37
PTPRH-205ENST00000587662 SYNJ2O15056 1496 aa42.35■■■■■ 4.37
PTPRH-205ENST00000587662 GAPVD1Q14C86 1478 aa42.32■■■■■ 4.37
PTPRH-205ENST00000587662 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa42.31■■■■■ 4.36
PTPRH-205ENST00000587662 SYNJ1O43426 1573 aa42.28■■■■■ 4.36
PTPRH-205ENST00000587662 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa42.27■■■■■ 4.36
PTPRH-205ENST00000587662 PBRM1Q86U86 1689 aa42.26■■■■■ 4.36
PTPRH-205ENST00000587662 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP42.06■■■■■ 4.32
PTPRH-205ENST00000587662 TRHP20396 242 aaPredicted RBP42.04■■■■■ 4.32
PTPRH-205ENST00000587662 TOP2BQ02880 1626 aa42.03■■■■■ 4.32
PTPRH-205ENST00000587662 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa42.03■■■■■ 4.32
PTPRH-205ENST00000587662 GRIN2AQ12879 1464 aa41.96■■■■■ 4.31
PTPRH-205ENST00000587662 ADAMTS12P58397 1594 aa41.93■■■■■ 4.3
PTPRH-205ENST00000587662 ERCC6L2Q5T890 1561 aa41.88■■■■■ 4.29
PTPRH-205ENST00000587662 NUP160Q12769 1436 aa41.87■■■■■ 4.29
PTPRH-205ENST00000587662 CEP170Q5SW79 1584 aa41.85■■■■■ 4.29
PTPRH-205ENST00000587662 FHAD1B1AJZ9 1412 aa41.78■■■■■ 4.28
PTPRH-205ENST00000587662 ERICH3Q5RHP9 1530 aa41.73■■■■■ 4.27
PTPRH-205ENST00000587662 SHROOM2Q13796 1616 aa41.66■■■■■ 4.26
PTPRH-205ENST00000587662 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP41.41■■■■■ 4.22
PTPRH-205ENST00000587662 JPH4Q96JJ6 628 aa41.36■■■■■ 4.21
PTPRH-205ENST00000587662 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa41.35■■■■■ 4.21
PTPRH-205ENST00000587662 IGF1RP08069 1367 aa41.28■■■■■ 4.2
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