Protein–RNA interactions for Protein: P24539

ATP5F1, ATP synthase F(0) complex subunit B1, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5F1P24539 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATP5F1P24539 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATP5F1P24539 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATP5F1P24539 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
ATP5F1P24539 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATP5F1P24539 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATP5F1P24539 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATP5F1P24539 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATP5F1P24539 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATP5F1P24539 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATP5F1P24539 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
ATP5F1P24539 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATP5F1P24539 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATP5F1P24539 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATP5F1P24539 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATP5F1P24539 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATP5F1P24539 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATP5F1P24539 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
ATP5F1P24539 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATP5F1P24539 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATP5F1P24539 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATP5F1P24539 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATP5F1P24539 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATP5F1P24539 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATP5F1P24539 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATP5F1P24539 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATP5F1P24539 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATP5F1P24539 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATP5F1P24539 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATP5F1P24539 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATP5F1P24539 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATP5F1P24539 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATP5F1P24539 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATP5F1P24539 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATP5F1P24539 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATP5F1P24539 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATP5F1P24539 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATP5F1P24539 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATP5F1P24539 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATP5F1P24539 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
ATP5F1P24539 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
ATP5F1P24539 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATP5F1P24539 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
ATP5F1P24539 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATP5F1P24539 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATP5F1P24539 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATP5F1P24539 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATP5F1P24539 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATP5F1P24539 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATP5F1P24539 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATP5F1P24539 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATP5F1P24539 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATP5F1P24539 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATP5F1P24539 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATP5F1P24539 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATP5F1P24539 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATP5F1P24539 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATP5F1P24539 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATP5F1P24539 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATP5F1P24539 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATP5F1P24539 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATP5F1P24539 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATP5F1P24539 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATP5F1P24539 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATP5F1P24539 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATP5F1P24539 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATP5F1P24539 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATP5F1P24539 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATP5F1P24539 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATP5F1P24539 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATP5F1P24539 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATP5F1P24539 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATP5F1P24539 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATP5F1P24539 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATP5F1P24539 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATP5F1P24539 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
ATP5F1P24539 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATP5F1P24539 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATP5F1P24539 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATP5F1P24539 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATP5F1P24539 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATP5F1P24539 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATP5F1P24539 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATP5F1P24539 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATP5F1P24539 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATP5F1P24539 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATP5F1P24539 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATP5F1P24539 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATP5F1P24539 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATP5F1P24539 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATP5F1P24539 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATP5F1P24539 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATP5F1P24539 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATP5F1P24539 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATP5F1P24539 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATP5F1P24539 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATP5F1P24539 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATP5F1P24539 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATP5F1P24539 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATP5F1P24539 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms