Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6N6

LAMC3, Laminin subunit gamma-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMC3Q9Y6N6 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.2■■■■■ 5.63
LAMC3Q9Y6N6 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC50.16■■■■■ 5.62
LAMC3Q9Y6N6 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC50.14■■■■■ 5.62
LAMC3Q9Y6N6 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC50.13■■■■■ 5.61
LAMC3Q9Y6N6 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC50.12■■■■■ 5.61
LAMC3Q9Y6N6 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC50.08■■■■■ 5.61
LAMC3Q9Y6N6 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC50.07■■■■■ 5.61
LAMC3Q9Y6N6 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC50.06■■■■■ 5.61
LAMC3Q9Y6N6 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.05■■■■■ 5.6
LAMC3Q9Y6N6 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC50.01■■■■■ 5.6
LAMC3Q9Y6N6 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC50.01■■■■■ 5.6
LAMC3Q9Y6N6 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC50■■■■■ 5.6
LAMC3Q9Y6N6 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC50■■■■■ 5.59
LAMC3Q9Y6N6 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.98■■■■■ 5.59
LAMC3Q9Y6N6 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC49.96■■■■■ 5.59
LAMC3Q9Y6N6 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC49.96■■■■■ 5.59
LAMC3Q9Y6N6 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC49.96■■■■■ 5.59
LAMC3Q9Y6N6 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC49.95■■■■■ 5.59
LAMC3Q9Y6N6 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC49.94■■■■■ 5.59
LAMC3Q9Y6N6 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC49.94■■■■■ 5.59
LAMC3Q9Y6N6 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC49.94■■■■■ 5.59
LAMC3Q9Y6N6 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC49.94■■■■■ 5.58
LAMC3Q9Y6N6 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC49.89■■■■■ 5.58
LAMC3Q9Y6N6 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC49.87■■■■■ 5.57
LAMC3Q9Y6N6 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.87■■■■■ 5.57
LAMC3Q9Y6N6 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC49.83■■■■■ 5.57
LAMC3Q9Y6N6 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC49.83■■■■■ 5.57
LAMC3Q9Y6N6 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC49.81■■■■■ 5.57
LAMC3Q9Y6N6 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC49.8■■■■■ 5.56
LAMC3Q9Y6N6 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC49.75■■■■■ 5.55
LAMC3Q9Y6N6 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC49.75■■■■■ 5.55
LAMC3Q9Y6N6 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC49.73■■■■■ 5.55
LAMC3Q9Y6N6 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC49.71■■■■■ 5.55
LAMC3Q9Y6N6 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC49.7■■■■■ 5.55
LAMC3Q9Y6N6 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC49.66■■■■■ 5.54
LAMC3Q9Y6N6 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC49.64■■■■■ 5.54
LAMC3Q9Y6N6 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.58■■■■■ 5.53
LAMC3Q9Y6N6 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.58■■■■■ 5.53
LAMC3Q9Y6N6 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC49.57■■■■■ 5.53
LAMC3Q9Y6N6 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC49.57■■■■■ 5.53
LAMC3Q9Y6N6 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC49.56■■■■■ 5.52
LAMC3Q9Y6N6 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC49.55■■■■■ 5.52
LAMC3Q9Y6N6 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC49.53■■■■■ 5.52
LAMC3Q9Y6N6 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC49.52■■■■■ 5.52
LAMC3Q9Y6N6 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC49.52■■■■■ 5.52
LAMC3Q9Y6N6 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC49.5■■■■■ 5.52
LAMC3Q9Y6N6 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC49.49■■■■■ 5.51
LAMC3Q9Y6N6 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC49.49■■■■■ 5.51
LAMC3Q9Y6N6 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC49.48■■■■■ 5.51
LAMC3Q9Y6N6 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.48■■■■■ 5.51
LAMC3Q9Y6N6 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC49.46■■■■■ 5.51
LAMC3Q9Y6N6 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC49.45■■■■■ 5.51
LAMC3Q9Y6N6 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC49.45■■■■■ 5.51
LAMC3Q9Y6N6 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC49.45■■■■■ 5.51
LAMC3Q9Y6N6 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.45■■■■■ 5.51
LAMC3Q9Y6N6 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC49.45■■■■■ 5.51
LAMC3Q9Y6N6 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC49.45■■■■■ 5.51
LAMC3Q9Y6N6 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC49.43■■■■■ 5.5
LAMC3Q9Y6N6 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC49.38■■■■■ 5.5
LAMC3Q9Y6N6 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.36■■■■■ 5.49
LAMC3Q9Y6N6 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC49.34■■■■■ 5.49
LAMC3Q9Y6N6 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC49.31■■■■■ 5.48
LAMC3Q9Y6N6 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC49.3■■■■■ 5.48
LAMC3Q9Y6N6 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC49.29■■■■■ 5.48
LAMC3Q9Y6N6 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.28■■■■■ 5.48
LAMC3Q9Y6N6 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC49.24■■■■■ 5.47
LAMC3Q9Y6N6 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC49.23■■■■■ 5.47
LAMC3Q9Y6N6 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC49.23■■■■■ 5.47
LAMC3Q9Y6N6 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.19■■■■■ 5.47
LAMC3Q9Y6N6 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC49.19■■■■■ 5.47
LAMC3Q9Y6N6 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.19■■■■■ 5.47
LAMC3Q9Y6N6 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.19■■■■■ 5.46
LAMC3Q9Y6N6 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC49.18■■■■■ 5.46
LAMC3Q9Y6N6 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC49.18■■■■■ 5.46
LAMC3Q9Y6N6 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC49.18■■■■■ 5.46
LAMC3Q9Y6N6 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC49.18■■■■■ 5.46
LAMC3Q9Y6N6 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC49.17■■■■■ 5.46
LAMC3Q9Y6N6 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC49.16■■■■■ 5.46
LAMC3Q9Y6N6 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC49.16■■■■■ 5.46
LAMC3Q9Y6N6 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC49.16■■■■■ 5.46
LAMC3Q9Y6N6 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC49.13■■■■■ 5.46
LAMC3Q9Y6N6 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC49.13■■■■■ 5.46
LAMC3Q9Y6N6 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC49.13■■■■■ 5.46
LAMC3Q9Y6N6 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC49.12■■■■■ 5.45
LAMC3Q9Y6N6 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC49.11■■■■■ 5.45
LAMC3Q9Y6N6 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.08■■■■■ 5.45
LAMC3Q9Y6N6 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC48.99■■■■■ 5.43
LAMC3Q9Y6N6 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.95■■■■■ 5.43
LAMC3Q9Y6N6 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.95■■■■■ 5.43
LAMC3Q9Y6N6 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC48.94■■■■■ 5.42
LAMC3Q9Y6N6 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC48.92■■■■■ 5.42
LAMC3Q9Y6N6 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC48.92■■■■■ 5.42
LAMC3Q9Y6N6 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC48.9■■■■■ 5.42
LAMC3Q9Y6N6 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC48.89■■■■■ 5.42
LAMC3Q9Y6N6 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC48.89■■■■■ 5.42
LAMC3Q9Y6N6 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC48.88■■■■■ 5.42
LAMC3Q9Y6N6 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC48.85■■■■■ 5.41
LAMC3Q9Y6N6 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC48.85■■■■■ 5.41
LAMC3Q9Y6N6 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC48.85■■■■■ 5.41
LAMC3Q9Y6N6 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.84■■■■■ 5.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms