Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y651

SOX21, Transcription factor SOX-21, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX21Q9Y651 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SOX21Q9Y651 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SOX21Q9Y651 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SOX21Q9Y651 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SOX21Q9Y651 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SOX21Q9Y651 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SOX21Q9Y651 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SOX21Q9Y651 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SOX21Q9Y651 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SOX21Q9Y651 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SOX21Q9Y651 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SOX21Q9Y651 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SOX21Q9Y651 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SOX21Q9Y651 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SOX21Q9Y651 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SOX21Q9Y651 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SOX21Q9Y651 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SOX21Q9Y651 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SOX21Q9Y651 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SOX21Q9Y651 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SOX21Q9Y651 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SOX21Q9Y651 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SOX21Q9Y651 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SOX21Q9Y651 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SOX21Q9Y651 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SOX21Q9Y651 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SOX21Q9Y651 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SOX21Q9Y651 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SOX21Q9Y651 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SOX21Q9Y651 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SOX21Q9Y651 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SOX21Q9Y651 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SOX21Q9Y651 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SOX21Q9Y651 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SOX21Q9Y651 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SOX21Q9Y651 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SOX21Q9Y651 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SOX21Q9Y651 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SOX21Q9Y651 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SOX21Q9Y651 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SOX21Q9Y651 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SOX21Q9Y651 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SOX21Q9Y651 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SOX21Q9Y651 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SOX21Q9Y651 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SOX21Q9Y651 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SOX21Q9Y651 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SOX21Q9Y651 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SOX21Q9Y651 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SOX21Q9Y651 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SOX21Q9Y651 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SOX21Q9Y651 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SOX21Q9Y651 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SOX21Q9Y651 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SOX21Q9Y651 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SOX21Q9Y651 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SOX21Q9Y651 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SOX21Q9Y651 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SOX21Q9Y651 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SOX21Q9Y651 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SOX21Q9Y651 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SOX21Q9Y651 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SOX21Q9Y651 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SOX21Q9Y651 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SOX21Q9Y651 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SOX21Q9Y651 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SOX21Q9Y651 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SOX21Q9Y651 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SOX21Q9Y651 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SOX21Q9Y651 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SOX21Q9Y651 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SOX21Q9Y651 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SOX21Q9Y651 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SOX21Q9Y651 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SOX21Q9Y651 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SOX21Q9Y651 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SOX21Q9Y651 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SOX21Q9Y651 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SOX21Q9Y651 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SOX21Q9Y651 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SOX21Q9Y651 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SOX21Q9Y651 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SOX21Q9Y651 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SOX21Q9Y651 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SOX21Q9Y651 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SOX21Q9Y651 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SOX21Q9Y651 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SOX21Q9Y651 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SOX21Q9Y651 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SOX21Q9Y651 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SOX21Q9Y651 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SOX21Q9Y651 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SOX21Q9Y651 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SOX21Q9Y651 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SOX21Q9Y651 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SOX21Q9Y651 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SOX21Q9Y651 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SOX21Q9Y651 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SOX21Q9Y651 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SOX21Q9Y651 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms