Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5F1

PCDHB12, Protocadherin beta-12, humanhuman

Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHB12Q9Y5F1 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC30.27■■■□□ 2.44
PCDHB12Q9Y5F1 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
PCDHB12Q9Y5F1 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
PCDHB12Q9Y5F1 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
PCDHB12Q9Y5F1 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
PCDHB12Q9Y5F1 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC30.24■■■□□ 2.43
PCDHB12Q9Y5F1 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC30.24■■■□□ 2.43
PCDHB12Q9Y5F1 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC30.23■■■□□ 2.43
PCDHB12Q9Y5F1 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
PCDHB12Q9Y5F1 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
PCDHB12Q9Y5F1 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
PCDHB12Q9Y5F1 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC30.17■■■□□ 2.42
PCDHB12Q9Y5F1 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
PCDHB12Q9Y5F1 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
PCDHB12Q9Y5F1 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
PCDHB12Q9Y5F1 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
PCDHB12Q9Y5F1 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
PCDHB12Q9Y5F1 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
PCDHB12Q9Y5F1 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
PCDHB12Q9Y5F1 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
PCDHB12Q9Y5F1 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
PCDHB12Q9Y5F1 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
PCDHB12Q9Y5F1 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC30.07■■■□□ 2.4
PCDHB12Q9Y5F1 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC30.07■■■□□ 2.4
PCDHB12Q9Y5F1 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC30.07■■■□□ 2.4
PCDHB12Q9Y5F1 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
PCDHB12Q9Y5F1 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
PCDHB12Q9Y5F1 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
PCDHB12Q9Y5F1 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
PCDHB12Q9Y5F1 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
PCDHB12Q9Y5F1 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC30.02■■■□□ 2.4
PCDHB12Q9Y5F1 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
PCDHB12Q9Y5F1 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
PCDHB12Q9Y5F1 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
PCDHB12Q9Y5F1 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
PCDHB12Q9Y5F1 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
PCDHB12Q9Y5F1 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
PCDHB12Q9Y5F1 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
PCDHB12Q9Y5F1 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
PCDHB12Q9Y5F1 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
PCDHB12Q9Y5F1 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
PCDHB12Q9Y5F1 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
PCDHB12Q9Y5F1 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
PCDHB12Q9Y5F1 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
PCDHB12Q9Y5F1 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
PCDHB12Q9Y5F1 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
PCDHB12Q9Y5F1 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
PCDHB12Q9Y5F1 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
PCDHB12Q9Y5F1 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
PCDHB12Q9Y5F1 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
PCDHB12Q9Y5F1 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
PCDHB12Q9Y5F1 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
PCDHB12Q9Y5F1 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
PCDHB12Q9Y5F1 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
PCDHB12Q9Y5F1 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
PCDHB12Q9Y5F1 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
PCDHB12Q9Y5F1 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
PCDHB12Q9Y5F1 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
PCDHB12Q9Y5F1 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
PCDHB12Q9Y5F1 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
PCDHB12Q9Y5F1 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
PCDHB12Q9Y5F1 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
PCDHB12Q9Y5F1 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
PCDHB12Q9Y5F1 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
PCDHB12Q9Y5F1 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
PCDHB12Q9Y5F1 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC29.78■■■□□ 2.36
PCDHB12Q9Y5F1 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
PCDHB12Q9Y5F1 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
PCDHB12Q9Y5F1 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
PCDHB12Q9Y5F1 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
PCDHB12Q9Y5F1 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
PCDHB12Q9Y5F1 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
PCDHB12Q9Y5F1 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
PCDHB12Q9Y5F1 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
PCDHB12Q9Y5F1 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
PCDHB12Q9Y5F1 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC29.72■■■□□ 2.35
PCDHB12Q9Y5F1 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
PCDHB12Q9Y5F1 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
PCDHB12Q9Y5F1 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
PCDHB12Q9Y5F1 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC29.69■■■□□ 2.34
PCDHB12Q9Y5F1 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
PCDHB12Q9Y5F1 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
PCDHB12Q9Y5F1 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
PCDHB12Q9Y5F1 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
PCDHB12Q9Y5F1 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
PCDHB12Q9Y5F1 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
PCDHB12Q9Y5F1 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
PCDHB12Q9Y5F1 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
PCDHB12Q9Y5F1 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
PCDHB12Q9Y5F1 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
PCDHB12Q9Y5F1 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
PCDHB12Q9Y5F1 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
PCDHB12Q9Y5F1 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
PCDHB12Q9Y5F1 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
PCDHB12Q9Y5F1 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
PCDHB12Q9Y5F1 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
PCDHB12Q9Y5F1 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
PCDHB12Q9Y5F1 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
PCDHB12Q9Y5F1 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
PCDHB12Q9Y5F1 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.7 ms