Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4W6

AFG3L2, AFG3-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFG3L2Q9Y4W6 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
AFG3L2Q9Y4W6 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC32.98■■■□□ 2.87
AFG3L2Q9Y4W6 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.98■■■□□ 2.87
AFG3L2Q9Y4W6 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC32.97■■■□□ 2.87
AFG3L2Q9Y4W6 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
AFG3L2Q9Y4W6 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC32.93■■■□□ 2.86
AFG3L2Q9Y4W6 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
AFG3L2Q9Y4W6 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
AFG3L2Q9Y4W6 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
AFG3L2Q9Y4W6 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC32.9■■■□□ 2.86
AFG3L2Q9Y4W6 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC32.84■■■□□ 2.85
AFG3L2Q9Y4W6 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
AFG3L2Q9Y4W6 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC32.82■■■□□ 2.84
AFG3L2Q9Y4W6 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
AFG3L2Q9Y4W6 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC32.81■■■□□ 2.84
AFG3L2Q9Y4W6 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
AFG3L2Q9Y4W6 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
AFG3L2Q9Y4W6 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC32.78■■■□□ 2.84
AFG3L2Q9Y4W6 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
AFG3L2Q9Y4W6 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.75■■■□□ 2.83
AFG3L2Q9Y4W6 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC32.75■■■□□ 2.83
AFG3L2Q9Y4W6 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
AFG3L2Q9Y4W6 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.75■■■□□ 2.83
AFG3L2Q9Y4W6 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
AFG3L2Q9Y4W6 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.73■■■□□ 2.83
AFG3L2Q9Y4W6 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC32.73■■■□□ 2.83
AFG3L2Q9Y4W6 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
AFG3L2Q9Y4W6 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
AFG3L2Q9Y4W6 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
AFG3L2Q9Y4W6 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.82
AFG3L2Q9Y4W6 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
AFG3L2Q9Y4W6 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
AFG3L2Q9Y4W6 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
AFG3L2Q9Y4W6 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC32.68■■■□□ 2.82
AFG3L2Q9Y4W6 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.68■■■□□ 2.82
AFG3L2Q9Y4W6 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
AFG3L2Q9Y4W6 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC32.67■■■□□ 2.82
AFG3L2Q9Y4W6 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
AFG3L2Q9Y4W6 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.64■■■□□ 2.82
AFG3L2Q9Y4W6 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.64■■■□□ 2.82
AFG3L2Q9Y4W6 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC32.64■■■□□ 2.82
AFG3L2Q9Y4W6 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.64■■■□□ 2.82
AFG3L2Q9Y4W6 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC32.64■■■□□ 2.82
AFG3L2Q9Y4W6 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC32.62■■■□□ 2.81
AFG3L2Q9Y4W6 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
AFG3L2Q9Y4W6 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC32.59■■■□□ 2.81
AFG3L2Q9Y4W6 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
AFG3L2Q9Y4W6 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
AFG3L2Q9Y4W6 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
AFG3L2Q9Y4W6 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC32.54■■■□□ 2.8
AFG3L2Q9Y4W6 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC32.53■■■□□ 2.8
AFG3L2Q9Y4W6 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
AFG3L2Q9Y4W6 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC32.52■■■□□ 2.8
AFG3L2Q9Y4W6 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC32.51■■■□□ 2.8
AFG3L2Q9Y4W6 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
AFG3L2Q9Y4W6 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
AFG3L2Q9Y4W6 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC32.5■■■□□ 2.79
AFG3L2Q9Y4W6 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
AFG3L2Q9Y4W6 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC32.5■■■□□ 2.79
AFG3L2Q9Y4W6 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
AFG3L2Q9Y4W6 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
AFG3L2Q9Y4W6 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC32.47■■■□□ 2.79
AFG3L2Q9Y4W6 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
AFG3L2Q9Y4W6 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
AFG3L2Q9Y4W6 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC32.45■■■□□ 2.79
AFG3L2Q9Y4W6 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC32.44■■■□□ 2.78
AFG3L2Q9Y4W6 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
AFG3L2Q9Y4W6 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
AFG3L2Q9Y4W6 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC32.39■■■□□ 2.78
AFG3L2Q9Y4W6 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
AFG3L2Q9Y4W6 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.39■■■□□ 2.78
AFG3L2Q9Y4W6 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC32.38■■■□□ 2.77
AFG3L2Q9Y4W6 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
AFG3L2Q9Y4W6 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC32.37■■■□□ 2.77
AFG3L2Q9Y4W6 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
AFG3L2Q9Y4W6 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC32.35■■■□□ 2.77
AFG3L2Q9Y4W6 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
AFG3L2Q9Y4W6 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
AFG3L2Q9Y4W6 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.33■■■□□ 2.77
AFG3L2Q9Y4W6 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
AFG3L2Q9Y4W6 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC32.32■■■□□ 2.76
AFG3L2Q9Y4W6 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.76
AFG3L2Q9Y4W6 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC32.31■■■□□ 2.76
AFG3L2Q9Y4W6 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC32.31■■■□□ 2.76
AFG3L2Q9Y4W6 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
AFG3L2Q9Y4W6 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
AFG3L2Q9Y4W6 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
AFG3L2Q9Y4W6 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
AFG3L2Q9Y4W6 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
AFG3L2Q9Y4W6 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
AFG3L2Q9Y4W6 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
AFG3L2Q9Y4W6 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
AFG3L2Q9Y4W6 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC32.21■■■□□ 2.75
AFG3L2Q9Y4W6 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.75
AFG3L2Q9Y4W6 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
AFG3L2Q9Y4W6 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
AFG3L2Q9Y4W6 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC32.18■■■□□ 2.74
AFG3L2Q9Y4W6 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.16■■■□□ 2.74
AFG3L2Q9Y4W6 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
AFG3L2Q9Y4W6 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC32.14■■■□□ 2.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.4 ms