Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4P9

SPEF1, Sperm flagellar protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPEF1Q9Y4P9 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SPEF1Q9Y4P9 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SPEF1Q9Y4P9 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SPEF1Q9Y4P9 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SPEF1Q9Y4P9 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SPEF1Q9Y4P9 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SPEF1Q9Y4P9 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SPEF1Q9Y4P9 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SPEF1Q9Y4P9 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SPEF1Q9Y4P9 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SPEF1Q9Y4P9 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SPEF1Q9Y4P9 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SPEF1Q9Y4P9 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SPEF1Q9Y4P9 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SPEF1Q9Y4P9 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SPEF1Q9Y4P9 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SPEF1Q9Y4P9 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SPEF1Q9Y4P9 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SPEF1Q9Y4P9 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SPEF1Q9Y4P9 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SPEF1Q9Y4P9 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SPEF1Q9Y4P9 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SPEF1Q9Y4P9 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SPEF1Q9Y4P9 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SPEF1Q9Y4P9 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SPEF1Q9Y4P9 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SPEF1Q9Y4P9 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SPEF1Q9Y4P9 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SPEF1Q9Y4P9 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SPEF1Q9Y4P9 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
SPEF1Q9Y4P9 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SPEF1Q9Y4P9 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SPEF1Q9Y4P9 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SPEF1Q9Y4P9 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SPEF1Q9Y4P9 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SPEF1Q9Y4P9 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SPEF1Q9Y4P9 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SPEF1Q9Y4P9 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SPEF1Q9Y4P9 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SPEF1Q9Y4P9 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
SPEF1Q9Y4P9 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SPEF1Q9Y4P9 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SPEF1Q9Y4P9 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SPEF1Q9Y4P9 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SPEF1Q9Y4P9 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SPEF1Q9Y4P9 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SPEF1Q9Y4P9 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SPEF1Q9Y4P9 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SPEF1Q9Y4P9 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SPEF1Q9Y4P9 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SPEF1Q9Y4P9 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SPEF1Q9Y4P9 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SPEF1Q9Y4P9 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SPEF1Q9Y4P9 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SPEF1Q9Y4P9 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SPEF1Q9Y4P9 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SPEF1Q9Y4P9 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SPEF1Q9Y4P9 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SPEF1Q9Y4P9 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SPEF1Q9Y4P9 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SPEF1Q9Y4P9 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SPEF1Q9Y4P9 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SPEF1Q9Y4P9 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SPEF1Q9Y4P9 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SPEF1Q9Y4P9 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SPEF1Q9Y4P9 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SPEF1Q9Y4P9 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SPEF1Q9Y4P9 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SPEF1Q9Y4P9 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SPEF1Q9Y4P9 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
SPEF1Q9Y4P9 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SPEF1Q9Y4P9 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SPEF1Q9Y4P9 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SPEF1Q9Y4P9 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SPEF1Q9Y4P9 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SPEF1Q9Y4P9 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SPEF1Q9Y4P9 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SPEF1Q9Y4P9 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SPEF1Q9Y4P9 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SPEF1Q9Y4P9 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SPEF1Q9Y4P9 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SPEF1Q9Y4P9 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SPEF1Q9Y4P9 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SPEF1Q9Y4P9 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SPEF1Q9Y4P9 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SPEF1Q9Y4P9 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SPEF1Q9Y4P9 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SPEF1Q9Y4P9 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SPEF1Q9Y4P9 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SPEF1Q9Y4P9 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SPEF1Q9Y4P9 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SPEF1Q9Y4P9 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SPEF1Q9Y4P9 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SPEF1Q9Y4P9 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SPEF1Q9Y4P9 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SPEF1Q9Y4P9 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
SPEF1Q9Y4P9 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SPEF1Q9Y4P9 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SPEF1Q9Y4P9 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SPEF1Q9Y4P9 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 207.6 ms