Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2X3

NOP58, Nucleolar protein 58, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOP58Q9Y2X3 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
NOP58Q9Y2X3 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
NOP58Q9Y2X3 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC35.38■■■■□ 3.25
NOP58Q9Y2X3 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
NOP58Q9Y2X3 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
NOP58Q9Y2X3 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC35.36■■■■□ 3.25
NOP58Q9Y2X3 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC35.35■■■■□ 3.25
NOP58Q9Y2X3 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
NOP58Q9Y2X3 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC35.33■■■■□ 3.25
NOP58Q9Y2X3 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
NOP58Q9Y2X3 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.29■■■■□ 3.24
NOP58Q9Y2X3 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
NOP58Q9Y2X3 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
NOP58Q9Y2X3 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
NOP58Q9Y2X3 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC35.21■■■■□ 3.23
NOP58Q9Y2X3 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
NOP58Q9Y2X3 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
NOP58Q9Y2X3 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
NOP58Q9Y2X3 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.22
NOP58Q9Y2X3 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.22
NOP58Q9Y2X3 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
NOP58Q9Y2X3 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC35.17■■■■□ 3.22
NOP58Q9Y2X3 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC35.17■■■■□ 3.22
NOP58Q9Y2X3 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
NOP58Q9Y2X3 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC35.17■■■■□ 3.22
NOP58Q9Y2X3 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
NOP58Q9Y2X3 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.15■■■■□ 3.22
NOP58Q9Y2X3 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
NOP58Q9Y2X3 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
NOP58Q9Y2X3 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
NOP58Q9Y2X3 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
NOP58Q9Y2X3 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
NOP58Q9Y2X3 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
NOP58Q9Y2X3 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
NOP58Q9Y2X3 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.21
NOP58Q9Y2X3 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.07■■■■□ 3.2
NOP58Q9Y2X3 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC35.06■■■■□ 3.2
NOP58Q9Y2X3 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC35.05■■■■□ 3.2
NOP58Q9Y2X3 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
NOP58Q9Y2X3 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
NOP58Q9Y2X3 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.01■■■■□ 3.2
NOP58Q9Y2X3 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
NOP58Q9Y2X3 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC34.99■■■■□ 3.19
NOP58Q9Y2X3 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC34.98■■■■□ 3.19
NOP58Q9Y2X3 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC34.98■■■■□ 3.19
NOP58Q9Y2X3 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
NOP58Q9Y2X3 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
NOP58Q9Y2X3 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
NOP58Q9Y2X3 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.94■■■■□ 3.18
NOP58Q9Y2X3 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
NOP58Q9Y2X3 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
NOP58Q9Y2X3 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
NOP58Q9Y2X3 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
NOP58Q9Y2X3 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
NOP58Q9Y2X3 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC34.89■■■■□ 3.18
NOP58Q9Y2X3 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
NOP58Q9Y2X3 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
NOP58Q9Y2X3 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC34.84■■■■□ 3.17
NOP58Q9Y2X3 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC34.84■■■■□ 3.17
NOP58Q9Y2X3 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC34.84■■■■□ 3.17
NOP58Q9Y2X3 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
NOP58Q9Y2X3 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.83■■■■□ 3.17
NOP58Q9Y2X3 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.17
NOP58Q9Y2X3 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
NOP58Q9Y2X3 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
NOP58Q9Y2X3 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC34.78■■■■□ 3.16
NOP58Q9Y2X3 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.77■■■■□ 3.16
NOP58Q9Y2X3 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
NOP58Q9Y2X3 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
NOP58Q9Y2X3 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.75■■■■□ 3.15
NOP58Q9Y2X3 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
NOP58Q9Y2X3 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
NOP58Q9Y2X3 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
NOP58Q9Y2X3 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
NOP58Q9Y2X3 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.69■■■■□ 3.14
NOP58Q9Y2X3 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC34.69■■■■□ 3.14
NOP58Q9Y2X3 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
NOP58Q9Y2X3 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
NOP58Q9Y2X3 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC34.66■■■■□ 3.14
NOP58Q9Y2X3 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
NOP58Q9Y2X3 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC34.64■■■■□ 3.14
NOP58Q9Y2X3 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
NOP58Q9Y2X3 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
NOP58Q9Y2X3 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
NOP58Q9Y2X3 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
NOP58Q9Y2X3 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC34.59■■■■□ 3.13
NOP58Q9Y2X3 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.59■■■■□ 3.13
NOP58Q9Y2X3 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
NOP58Q9Y2X3 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC34.58■■■■□ 3.13
NOP58Q9Y2X3 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC34.58■■■■□ 3.13
NOP58Q9Y2X3 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC34.58■■■■□ 3.13
NOP58Q9Y2X3 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
NOP58Q9Y2X3 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC34.56■■■■□ 3.12
NOP58Q9Y2X3 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
NOP58Q9Y2X3 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC34.55■■■■□ 3.12
NOP58Q9Y2X3 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
NOP58Q9Y2X3 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
NOP58Q9Y2X3 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC34.53■■■■□ 3.12
NOP58Q9Y2X3 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
NOP58Q9Y2X3 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms