Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2L5

TRAPPC8, Trafficking protein particle complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC8Q9Y2L5 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.12■■■■■ 4.49
TRAPPC8Q9Y2L5 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.1■■■■■ 4.49
TRAPPC8Q9Y2L5 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.09■■■■■ 4.49
TRAPPC8Q9Y2L5 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC43.08■■■■■ 4.49
TRAPPC8Q9Y2L5 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC43.08■■■■■ 4.49
TRAPPC8Q9Y2L5 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC43.07■■■■■ 4.49
TRAPPC8Q9Y2L5 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC43.02■■■■■ 4.48
TRAPPC8Q9Y2L5 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC43.01■■■■■ 4.48
TRAPPC8Q9Y2L5 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC43.01■■■■■ 4.48
TRAPPC8Q9Y2L5 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.01■■■■■ 4.48
TRAPPC8Q9Y2L5 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC42.97■■■■■ 4.47
TRAPPC8Q9Y2L5 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.96■■■■■ 4.47
TRAPPC8Q9Y2L5 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC42.96■■■■■ 4.47
TRAPPC8Q9Y2L5 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.9■■■■■ 4.46
TRAPPC8Q9Y2L5 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.87■■■■■ 4.45
TRAPPC8Q9Y2L5 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC42.82■■■■■ 4.45
TRAPPC8Q9Y2L5 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC42.8■■■■■ 4.44
TRAPPC8Q9Y2L5 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC42.79■■■■■ 4.44
TRAPPC8Q9Y2L5 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC42.76■■■■■ 4.44
TRAPPC8Q9Y2L5 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC42.76■■■■■ 4.44
TRAPPC8Q9Y2L5 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.74■■■■■ 4.43
TRAPPC8Q9Y2L5 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.73■■■■■ 4.43
TRAPPC8Q9Y2L5 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC42.71■■■■■ 4.43
TRAPPC8Q9Y2L5 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC42.71■■■■■ 4.43
TRAPPC8Q9Y2L5 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC42.7■■■■■ 4.43
TRAPPC8Q9Y2L5 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC42.7■■■■■ 4.43
TRAPPC8Q9Y2L5 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC42.68■■■■■ 4.42
TRAPPC8Q9Y2L5 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC42.67■■■■■ 4.42
TRAPPC8Q9Y2L5 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC42.67■■■■■ 4.42
TRAPPC8Q9Y2L5 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC42.66■■■■■ 4.42
TRAPPC8Q9Y2L5 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.63■■■■■ 4.41
TRAPPC8Q9Y2L5 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC42.63■■■■■ 4.41
TRAPPC8Q9Y2L5 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC42.62■■■■■ 4.41
TRAPPC8Q9Y2L5 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC42.62■■■■■ 4.41
TRAPPC8Q9Y2L5 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.62■■■■■ 4.41
TRAPPC8Q9Y2L5 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC42.61■■■■■ 4.41
TRAPPC8Q9Y2L5 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.61■■■■■ 4.41
TRAPPC8Q9Y2L5 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.6■■■■■ 4.41
TRAPPC8Q9Y2L5 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC42.58■■■■■ 4.41
TRAPPC8Q9Y2L5 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC42.57■■■■■ 4.41
TRAPPC8Q9Y2L5 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC42.56■■■■■ 4.4
TRAPPC8Q9Y2L5 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.54■■■■■ 4.4
TRAPPC8Q9Y2L5 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC42.54■■■■■ 4.4
TRAPPC8Q9Y2L5 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC42.51■■■■■ 4.4
TRAPPC8Q9Y2L5 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.47■■■■■ 4.39
TRAPPC8Q9Y2L5 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC42.46■■■■■ 4.39
TRAPPC8Q9Y2L5 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC42.46■■■■■ 4.39
TRAPPC8Q9Y2L5 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC42.43■■■■■ 4.38
TRAPPC8Q9Y2L5 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC42.42■■■■■ 4.38
TRAPPC8Q9Y2L5 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.41■■■■■ 4.38
TRAPPC8Q9Y2L5 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.41■■■■■ 4.38
TRAPPC8Q9Y2L5 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC42.4■■■■■ 4.38
TRAPPC8Q9Y2L5 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC42.4■■■■■ 4.38
TRAPPC8Q9Y2L5 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC42.4■■■■■ 4.38
TRAPPC8Q9Y2L5 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC42.4■■■■■ 4.38
TRAPPC8Q9Y2L5 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC42.39■■■■■ 4.38
TRAPPC8Q9Y2L5 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC42.38■■■■■ 4.38
TRAPPC8Q9Y2L5 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC42.37■■■■■ 4.37
TRAPPC8Q9Y2L5 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.36■■■■■ 4.37
TRAPPC8Q9Y2L5 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC42.34■■■■■ 4.37
TRAPPC8Q9Y2L5 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC42.32■■■■■ 4.37
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC42.27■■■■■ 4.36
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.27■■■■■ 4.36
TRAPPC8Q9Y2L5 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.26■■■■■ 4.36
TRAPPC8Q9Y2L5 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC42.26■■■■■ 4.36
TRAPPC8Q9Y2L5 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.26■■■■■ 4.36
TRAPPC8Q9Y2L5 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.25■■■■■ 4.35
TRAPPC8Q9Y2L5 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC42.24■■■■■ 4.35
TRAPPC8Q9Y2L5 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC42.23■■■■■ 4.35
TRAPPC8Q9Y2L5 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.23■■■■■ 4.35
TRAPPC8Q9Y2L5 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC42.22■■■■■ 4.35
TRAPPC8Q9Y2L5 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC42.22■■■■■ 4.35
TRAPPC8Q9Y2L5 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC42.21■■■■■ 4.35
TRAPPC8Q9Y2L5 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC42.2■■■■■ 4.35
TRAPPC8Q9Y2L5 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC42.2■■■■■ 4.35
TRAPPC8Q9Y2L5 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.19■■■■■ 4.34
TRAPPC8Q9Y2L5 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC42.19■■■■■ 4.34
TRAPPC8Q9Y2L5 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC42.19■■■■■ 4.34
TRAPPC8Q9Y2L5 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC42.18■■■■■ 4.34
TRAPPC8Q9Y2L5 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC42.17■■■■■ 4.34
TRAPPC8Q9Y2L5 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.16■■■■■ 4.34
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC42.15■■■■■ 4.34
TRAPPC8Q9Y2L5 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.15■■■■■ 4.34
TRAPPC8Q9Y2L5 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC42.14■■■■■ 4.34
TRAPPC8Q9Y2L5 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.14■■■■■ 4.34
TRAPPC8Q9Y2L5 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.12■■■■■ 4.33
TRAPPC8Q9Y2L5 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC42.11■■■■■ 4.33
TRAPPC8Q9Y2L5 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.08■■■■■ 4.33
TRAPPC8Q9Y2L5 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.08■■■■■ 4.33
TRAPPC8Q9Y2L5 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.07■■■■■ 4.33
TRAPPC8Q9Y2L5 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC42.05■■■■■ 4.32
TRAPPC8Q9Y2L5 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.05■■■■■ 4.32
TRAPPC8Q9Y2L5 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC42.03■■■■■ 4.32
TRAPPC8Q9Y2L5 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC42.03■■■■■ 4.32
TRAPPC8Q9Y2L5 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC42.02■■■■■ 4.32
TRAPPC8Q9Y2L5 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.01■■■■■ 4.32
TRAPPC8Q9Y2L5 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.01■■■■■ 4.32
TRAPPC8Q9Y2L5 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC42■■■■■ 4.31
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC41.98■■■■■ 4.31
TRAPPC8Q9Y2L5 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC41.97■■■■■ 4.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.6 ms