Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2I1

NISCH, Nischarin, humanhuman

Predictions only

Length 1,504 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCHQ9Y2I1 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC66.73■■■■■ 8.27
NISCHQ9Y2I1 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC66.66■■■■■ 8.26
NISCHQ9Y2I1 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC66.65■■■■■ 8.26
NISCHQ9Y2I1 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC66.63■■■■■ 8.26
NISCHQ9Y2I1 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC66.62■■■■■ 8.25
NISCHQ9Y2I1 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC66.62■■■■■ 8.25
NISCHQ9Y2I1 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC66.62■■■■■ 8.25
NISCHQ9Y2I1 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC66.57■■■■■ 8.25
NISCHQ9Y2I1 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC66.49■■■■■ 8.23
NISCHQ9Y2I1 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC66.49■■■■■ 8.23
NISCHQ9Y2I1 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC66.44■■■■■ 8.23
NISCHQ9Y2I1 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC66.41■■■■■ 8.22
NISCHQ9Y2I1 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC66.36■■■■■ 8.21
NISCHQ9Y2I1 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC66.29■■■■■ 8.2
NISCHQ9Y2I1 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC66.27■■■■■ 8.2
NISCHQ9Y2I1 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC66.23■■■■■ 8.19
NISCHQ9Y2I1 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC66.23■■■■■ 8.19
NISCHQ9Y2I1 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC66.23■■■■■ 8.19
NISCHQ9Y2I1 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC66.2■■■■■ 8.19
NISCHQ9Y2I1 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC66.18■■■■■ 8.19
NISCHQ9Y2I1 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC66.15■■■■■ 8.18
NISCHQ9Y2I1 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC66.15■■■■■ 8.18
NISCHQ9Y2I1 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC66.15■■■■■ 8.18
NISCHQ9Y2I1 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC66.07■■■■■ 8.17
NISCHQ9Y2I1 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC66.07■■■■■ 8.17
NISCHQ9Y2I1 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC66.01■■■■■ 8.16
NISCHQ9Y2I1 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC65.99■■■■■ 8.15
NISCHQ9Y2I1 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC65.97■■■■■ 8.15
NISCHQ9Y2I1 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC65.97■■■■■ 8.15
NISCHQ9Y2I1 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC65.95■■■■■ 8.15
NISCHQ9Y2I1 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC65.92■■■■■ 8.14
NISCHQ9Y2I1 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC65.91■■■■■ 8.14
NISCHQ9Y2I1 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC65.91■■■■■ 8.14
NISCHQ9Y2I1 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC65.9■■■■■ 8.14
NISCHQ9Y2I1 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC65.9■■■■■ 8.14
NISCHQ9Y2I1 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC65.9■■■■■ 8.14
NISCHQ9Y2I1 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC65.89■■■■■ 8.14
NISCHQ9Y2I1 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC65.88■■■■■ 8.14
NISCHQ9Y2I1 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC65.87■■■■■ 8.14
NISCHQ9Y2I1 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC65.87■■■■■ 8.14
NISCHQ9Y2I1 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC65.87■■■■■ 8.13
NISCHQ9Y2I1 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC65.82■■■■■ 8.13
NISCHQ9Y2I1 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC65.78■■■■■ 8.12
NISCHQ9Y2I1 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC65.78■■■■■ 8.12
NISCHQ9Y2I1 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC65.77■■■■■ 8.12
NISCHQ9Y2I1 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC65.76■■■■■ 8.12
NISCHQ9Y2I1 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC65.74■■■■■ 8.11
NISCHQ9Y2I1 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC65.71■■■■■ 8.11
NISCHQ9Y2I1 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC65.67■■■■■ 8.1
NISCHQ9Y2I1 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC65.66■■■■■ 8.1
NISCHQ9Y2I1 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC65.66■■■■■ 8.1
NISCHQ9Y2I1 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC65.66■■■■■ 8.1
NISCHQ9Y2I1 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC65.65■■■■■ 8.1
NISCHQ9Y2I1 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC65.64■■■■■ 8.1
NISCHQ9Y2I1 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC65.63■■■■■ 8.1
NISCHQ9Y2I1 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC65.61■■■■■ 8.09
NISCHQ9Y2I1 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC65.61■■■■■ 8.09
NISCHQ9Y2I1 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC65.61■■■■■ 8.09
NISCHQ9Y2I1 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC65.58■■■■■ 8.09
NISCHQ9Y2I1 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC65.57■■■■■ 8.09
NISCHQ9Y2I1 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC65.56■■■■■ 8.09
NISCHQ9Y2I1 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC65.54■■■■■ 8.08
NISCHQ9Y2I1 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC65.53■■■■■ 8.08
NISCHQ9Y2I1 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC65.5■■■■■ 8.08
NISCHQ9Y2I1 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC65.49■■■■■ 8.07
NISCHQ9Y2I1 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC65.48■■■■■ 8.07
NISCHQ9Y2I1 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC65.47■■■■■ 8.07
NISCHQ9Y2I1 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC65.46■■■■■ 8.07
NISCHQ9Y2I1 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC65.43■■■■■ 8.07
NISCHQ9Y2I1 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC65.43■■■■■ 8.06
NISCHQ9Y2I1 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC65.43■■■■■ 8.06
NISCHQ9Y2I1 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC65.42■■■■■ 8.06
NISCHQ9Y2I1 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC65.41■■■■■ 8.06
NISCHQ9Y2I1 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC65.4■■■■■ 8.06
NISCHQ9Y2I1 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC65.39■■■■■ 8.06
NISCHQ9Y2I1 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC65.38■■■■■ 8.06
NISCHQ9Y2I1 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC65.36■■■■■ 8.05
NISCHQ9Y2I1 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC65.32■■■■■ 8.05
NISCHQ9Y2I1 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC65.32■■■■■ 8.05
NISCHQ9Y2I1 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC65.29■■■■■ 8.04
NISCHQ9Y2I1 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC65.26■■■■■ 8.04
NISCHQ9Y2I1 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC65.26■■■■■ 8.04
NISCHQ9Y2I1 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC65.26■■■■■ 8.04
NISCHQ9Y2I1 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC65.2■■■■■ 8.03
NISCHQ9Y2I1 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC65.2■■■■■ 8.03
NISCHQ9Y2I1 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC65.19■■■■■ 8.03
NISCHQ9Y2I1 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC65.17■■■■■ 8.02
NISCHQ9Y2I1 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC65.09■■■■■ 8.01
NISCHQ9Y2I1 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC65.09■■■■■ 8.01
NISCHQ9Y2I1 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC65.05■■■■■ 8
NISCHQ9Y2I1 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC65.03■■■■■ 8
NISCHQ9Y2I1 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC65.02■■■■■ 8
NISCHQ9Y2I1 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC65■■■■■ 8
NISCHQ9Y2I1 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC65■■■■■ 8
NISCHQ9Y2I1 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC65■■■■■ 8
NISCHQ9Y2I1 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC64.98■■■■■ 7.99
NISCHQ9Y2I1 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC64.98■■■■■ 7.99
NISCHQ9Y2I1 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC64.97■■■■■ 7.99
NISCHQ9Y2I1 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC64.95■■■■■ 7.99
NISCHQ9Y2I1 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC64.95■■■■■ 7.99
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