Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2H6

FNDC3A, Fibronectin type-III domain-containing protein 3A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNDC3AQ9Y2H6 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
FNDC3AQ9Y2H6 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
FNDC3AQ9Y2H6 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
FNDC3AQ9Y2H6 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
FNDC3AQ9Y2H6 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
FNDC3AQ9Y2H6 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
FNDC3AQ9Y2H6 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
FNDC3AQ9Y2H6 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
FNDC3AQ9Y2H6 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
FNDC3AQ9Y2H6 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
FNDC3AQ9Y2H6 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
FNDC3AQ9Y2H6 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
FNDC3AQ9Y2H6 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
FNDC3AQ9Y2H6 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
FNDC3AQ9Y2H6 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
FNDC3AQ9Y2H6 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
FNDC3AQ9Y2H6 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
FNDC3AQ9Y2H6 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
FNDC3AQ9Y2H6 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
FNDC3AQ9Y2H6 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
FNDC3AQ9Y2H6 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
FNDC3AQ9Y2H6 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
FNDC3AQ9Y2H6 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
FNDC3AQ9Y2H6 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
FNDC3AQ9Y2H6 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
FNDC3AQ9Y2H6 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
FNDC3AQ9Y2H6 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
FNDC3AQ9Y2H6 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
FNDC3AQ9Y2H6 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
FNDC3AQ9Y2H6 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
FNDC3AQ9Y2H6 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
FNDC3AQ9Y2H6 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
FNDC3AQ9Y2H6 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
FNDC3AQ9Y2H6 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
FNDC3AQ9Y2H6 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
FNDC3AQ9Y2H6 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
FNDC3AQ9Y2H6 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
FNDC3AQ9Y2H6 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
FNDC3AQ9Y2H6 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
FNDC3AQ9Y2H6 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
FNDC3AQ9Y2H6 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
FNDC3AQ9Y2H6 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
FNDC3AQ9Y2H6 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
FNDC3AQ9Y2H6 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
FNDC3AQ9Y2H6 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
FNDC3AQ9Y2H6 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
FNDC3AQ9Y2H6 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
FNDC3AQ9Y2H6 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
FNDC3AQ9Y2H6 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
FNDC3AQ9Y2H6 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
FNDC3AQ9Y2H6 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
FNDC3AQ9Y2H6 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
FNDC3AQ9Y2H6 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
FNDC3AQ9Y2H6 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
FNDC3AQ9Y2H6 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
FNDC3AQ9Y2H6 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
FNDC3AQ9Y2H6 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
FNDC3AQ9Y2H6 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
FNDC3AQ9Y2H6 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
FNDC3AQ9Y2H6 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
FNDC3AQ9Y2H6 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
FNDC3AQ9Y2H6 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
FNDC3AQ9Y2H6 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
FNDC3AQ9Y2H6 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
FNDC3AQ9Y2H6 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
FNDC3AQ9Y2H6 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
FNDC3AQ9Y2H6 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
FNDC3AQ9Y2H6 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
FNDC3AQ9Y2H6 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
FNDC3AQ9Y2H6 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
FNDC3AQ9Y2H6 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
FNDC3AQ9Y2H6 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
FNDC3AQ9Y2H6 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
FNDC3AQ9Y2H6 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
FNDC3AQ9Y2H6 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
FNDC3AQ9Y2H6 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
FNDC3AQ9Y2H6 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
FNDC3AQ9Y2H6 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
FNDC3AQ9Y2H6 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
FNDC3AQ9Y2H6 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
FNDC3AQ9Y2H6 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
FNDC3AQ9Y2H6 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
FNDC3AQ9Y2H6 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
FNDC3AQ9Y2H6 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
FNDC3AQ9Y2H6 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
FNDC3AQ9Y2H6 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
FNDC3AQ9Y2H6 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
FNDC3AQ9Y2H6 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
FNDC3AQ9Y2H6 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
FNDC3AQ9Y2H6 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
FNDC3AQ9Y2H6 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
FNDC3AQ9Y2H6 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
FNDC3AQ9Y2H6 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.01
FNDC3AQ9Y2H6 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
FNDC3AQ9Y2H6 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
FNDC3AQ9Y2H6 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
FNDC3AQ9Y2H6 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC27.61■■■□□ 2.01
FNDC3AQ9Y2H6 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
FNDC3AQ9Y2H6 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
FNDC3AQ9Y2H6 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.3 ms