Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y287

ITM2B, Integral membrane protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITM2BQ9Y287 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
ITM2BQ9Y287 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ITM2BQ9Y287 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC28■■■□□ 2.07
ITM2BQ9Y287 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ITM2BQ9Y287 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ITM2BQ9Y287 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ITM2BQ9Y287 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ITM2BQ9Y287 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ITM2BQ9Y287 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
ITM2BQ9Y287 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ITM2BQ9Y287 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
ITM2BQ9Y287 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
ITM2BQ9Y287 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ITM2BQ9Y287 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ITM2BQ9Y287 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
ITM2BQ9Y287 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ITM2BQ9Y287 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ITM2BQ9Y287 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ITM2BQ9Y287 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ITM2BQ9Y287 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ITM2BQ9Y287 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ITM2BQ9Y287 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ITM2BQ9Y287 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ITM2BQ9Y287 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ITM2BQ9Y287 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ITM2BQ9Y287 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
ITM2BQ9Y287 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ITM2BQ9Y287 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ITM2BQ9Y287 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ITM2BQ9Y287 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ITM2BQ9Y287 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
ITM2BQ9Y287 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ITM2BQ9Y287 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
ITM2BQ9Y287 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ITM2BQ9Y287 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
ITM2BQ9Y287 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
ITM2BQ9Y287 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ITM2BQ9Y287 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ITM2BQ9Y287 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ITM2BQ9Y287 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
ITM2BQ9Y287 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
ITM2BQ9Y287 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
ITM2BQ9Y287 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
ITM2BQ9Y287 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ITM2BQ9Y287 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ITM2BQ9Y287 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ITM2BQ9Y287 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ITM2BQ9Y287 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ITM2BQ9Y287 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ITM2BQ9Y287 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ITM2BQ9Y287 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ITM2BQ9Y287 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ITM2BQ9Y287 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ITM2BQ9Y287 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
ITM2BQ9Y287 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
ITM2BQ9Y287 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ITM2BQ9Y287 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ITM2BQ9Y287 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ITM2BQ9Y287 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ITM2BQ9Y287 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ITM2BQ9Y287 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ITM2BQ9Y287 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ITM2BQ9Y287 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ITM2BQ9Y287 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ITM2BQ9Y287 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ITM2BQ9Y287 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ITM2BQ9Y287 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ITM2BQ9Y287 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ITM2BQ9Y287 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ITM2BQ9Y287 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
ITM2BQ9Y287 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
ITM2BQ9Y287 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ITM2BQ9Y287 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
ITM2BQ9Y287 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ITM2BQ9Y287 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ITM2BQ9Y287 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ITM2BQ9Y287 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ITM2BQ9Y287 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
ITM2BQ9Y287 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ITM2BQ9Y287 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ITM2BQ9Y287 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ITM2BQ9Y287 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ITM2BQ9Y287 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
ITM2BQ9Y287 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
ITM2BQ9Y287 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ITM2BQ9Y287 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ITM2BQ9Y287 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ITM2BQ9Y287 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ITM2BQ9Y287 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ITM2BQ9Y287 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
ITM2BQ9Y287 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
ITM2BQ9Y287 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
ITM2BQ9Y287 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ITM2BQ9Y287 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ITM2BQ9Y287 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ITM2BQ9Y287 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ITM2BQ9Y287 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ITM2BQ9Y287 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
ITM2BQ9Y287 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ITM2BQ9Y287 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms