Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ88

CDK11A, Cyclin-dependent kinase 11A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 783 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK11AQ9UQ88 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC44.01■■■■■ 4.64
CDK11AQ9UQ88 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC43.99■■■■■ 4.63
CDK11AQ9UQ88 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC43.98■■■■■ 4.63
CDK11AQ9UQ88 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC43.93■■■■■ 4.62
CDK11AQ9UQ88 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC43.92■■■■■ 4.62
CDK11AQ9UQ88 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.91■■■■■ 4.62
CDK11AQ9UQ88 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC43.9■■■■■ 4.62
CDK11AQ9UQ88 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC43.83■■■■■ 4.61
CDK11AQ9UQ88 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.83■■■■■ 4.61
CDK11AQ9UQ88 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.83■■■■■ 4.61
CDK11AQ9UQ88 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC43.83■■■■■ 4.61
CDK11AQ9UQ88 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC43.81■■■■■ 4.6
CDK11AQ9UQ88 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC43.77■■■■■ 4.6
CDK11AQ9UQ88 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC43.77■■■■■ 4.6
CDK11AQ9UQ88 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC43.77■■■■■ 4.6
CDK11AQ9UQ88 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.76■■■■■ 4.6
CDK11AQ9UQ88 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC43.76■■■■■ 4.6
CDK11AQ9UQ88 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC43.75■■■■■ 4.59
CDK11AQ9UQ88 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC43.74■■■■■ 4.59
CDK11AQ9UQ88 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.74■■■■■ 4.59
CDK11AQ9UQ88 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC43.74■■■■■ 4.59
CDK11AQ9UQ88 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.74■■■■■ 4.59
CDK11AQ9UQ88 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC43.73■■■■■ 4.59
CDK11AQ9UQ88 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC43.71■■■■■ 4.59
CDK11AQ9UQ88 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.7■■■■■ 4.59
CDK11AQ9UQ88 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.69■■■■■ 4.58
CDK11AQ9UQ88 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.69■■■■■ 4.58
CDK11AQ9UQ88 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC43.69■■■■■ 4.58
CDK11AQ9UQ88 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC43.68■■■■■ 4.58
CDK11AQ9UQ88 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC43.66■■■■■ 4.58
CDK11AQ9UQ88 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.65■■■■■ 4.58
CDK11AQ9UQ88 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.64■■■■■ 4.58
CDK11AQ9UQ88 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC43.63■■■■■ 4.57
CDK11AQ9UQ88 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC43.63■■■■■ 4.57
CDK11AQ9UQ88 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.61■■■■■ 4.57
CDK11AQ9UQ88 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC43.6■■■■■ 4.57
CDK11AQ9UQ88 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC43.59■■■■■ 4.57
CDK11AQ9UQ88 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.57■■■■■ 4.56
CDK11AQ9UQ88 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.55■■■■■ 4.56
CDK11AQ9UQ88 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC43.55■■■■■ 4.56
CDK11AQ9UQ88 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC43.55■■■■■ 4.56
CDK11AQ9UQ88 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.54■■■■■ 4.56
CDK11AQ9UQ88 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC43.54■■■■■ 4.56
CDK11AQ9UQ88 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.53■■■■■ 4.56
CDK11AQ9UQ88 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC43.51■■■■■ 4.56
CDK11AQ9UQ88 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.5■■■■■ 4.55
CDK11AQ9UQ88 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC43.47■■■■■ 4.55
CDK11AQ9UQ88 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.46■■■■■ 4.55
CDK11AQ9UQ88 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.45■■■■■ 4.55
CDK11AQ9UQ88 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC43.45■■■■■ 4.55
CDK11AQ9UQ88 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.44■■■■■ 4.54
CDK11AQ9UQ88 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC43.43■■■■■ 4.54
CDK11AQ9UQ88 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC43.42■■■■■ 4.54
CDK11AQ9UQ88 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC43.41■■■■■ 4.54
CDK11AQ9UQ88 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC43.41■■■■■ 4.54
CDK11AQ9UQ88 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC43.38■■■■■ 4.53
CDK11AQ9UQ88 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC43.37■■■■■ 4.53
CDK11AQ9UQ88 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC43.36■■■■■ 4.53
CDK11AQ9UQ88 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC43.35■■■■■ 4.53
CDK11AQ9UQ88 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC43.35■■■■■ 4.53
CDK11AQ9UQ88 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC43.33■■■■■ 4.53
CDK11AQ9UQ88 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.33■■■■■ 4.53
CDK11AQ9UQ88 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC43.33■■■■■ 4.53
CDK11AQ9UQ88 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.28■■■■■ 4.52
CDK11AQ9UQ88 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.27■■■■■ 4.52
CDK11AQ9UQ88 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC43.25■■■■■ 4.51
CDK11AQ9UQ88 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC43.24■■■■■ 4.51
CDK11AQ9UQ88 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC43.24■■■■■ 4.51
CDK11AQ9UQ88 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.22■■■■■ 4.51
CDK11AQ9UQ88 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC43.21■■■■■ 4.51
CDK11AQ9UQ88 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.2■■■■■ 4.51
CDK11AQ9UQ88 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC43.2■■■■■ 4.51
CDK11AQ9UQ88 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.18■■■■■ 4.5
CDK11AQ9UQ88 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC43.17■■■■■ 4.5
CDK11AQ9UQ88 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC43.16■■■■■ 4.5
CDK11AQ9UQ88 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.15■■■■■ 4.5
CDK11AQ9UQ88 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC43.15■■■■■ 4.5
CDK11AQ9UQ88 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC43.14■■■■■ 4.5
CDK11AQ9UQ88 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC43.14■■■■■ 4.5
CDK11AQ9UQ88 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.14■■■■■ 4.5
CDK11AQ9UQ88 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.13■■■■■ 4.49
CDK11AQ9UQ88 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC43.13■■■■■ 4.49
CDK11AQ9UQ88 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC43.12■■■■■ 4.49
CDK11AQ9UQ88 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC43.11■■■■■ 4.49
CDK11AQ9UQ88 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC43.11■■■■■ 4.49
CDK11AQ9UQ88 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC43.1■■■■■ 4.49
CDK11AQ9UQ88 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC43.1■■■■■ 4.49
CDK11AQ9UQ88 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.09■■■■■ 4.49
CDK11AQ9UQ88 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.09■■■■■ 4.49
CDK11AQ9UQ88 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.08■■■■■ 4.49
CDK11AQ9UQ88 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.04■■■■■ 4.48
CDK11AQ9UQ88 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC43.01■■■■■ 4.48
CDK11AQ9UQ88 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC43.01■■■■■ 4.48
CDK11AQ9UQ88 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC42.93■■■■■ 4.46
CDK11AQ9UQ88 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.93■■■■■ 4.46
CDK11AQ9UQ88 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC42.93■■■■■ 4.46
CDK11AQ9UQ88 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.91■■■■■ 4.46
CDK11AQ9UQ88 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.9■■■■■ 4.46
CDK11AQ9UQ88 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC42.9■■■■■ 4.46
CDK11AQ9UQ88 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC42.89■■■■■ 4.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms