Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULB5

CDH7, Cadherin-7, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH7Q9ULB5 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
CDH7Q9ULB5 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CDH7Q9ULB5 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CDH7Q9ULB5 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
CDH7Q9ULB5 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CDH7Q9ULB5 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
CDH7Q9ULB5 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
CDH7Q9ULB5 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CDH7Q9ULB5 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CDH7Q9ULB5 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CDH7Q9ULB5 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CDH7Q9ULB5 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CDH7Q9ULB5 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CDH7Q9ULB5 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CDH7Q9ULB5 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CDH7Q9ULB5 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CDH7Q9ULB5 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CDH7Q9ULB5 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CDH7Q9ULB5 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CDH7Q9ULB5 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CDH7Q9ULB5 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CDH7Q9ULB5 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
CDH7Q9ULB5 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CDH7Q9ULB5 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CDH7Q9ULB5 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CDH7Q9ULB5 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CDH7Q9ULB5 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CDH7Q9ULB5 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CDH7Q9ULB5 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CDH7Q9ULB5 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CDH7Q9ULB5 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CDH7Q9ULB5 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CDH7Q9ULB5 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CDH7Q9ULB5 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CDH7Q9ULB5 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CDH7Q9ULB5 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CDH7Q9ULB5 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CDH7Q9ULB5 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
CDH7Q9ULB5 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CDH7Q9ULB5 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CDH7Q9ULB5 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CDH7Q9ULB5 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CDH7Q9ULB5 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CDH7Q9ULB5 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CDH7Q9ULB5 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CDH7Q9ULB5 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CDH7Q9ULB5 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CDH7Q9ULB5 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
CDH7Q9ULB5 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CDH7Q9ULB5 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CDH7Q9ULB5 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CDH7Q9ULB5 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CDH7Q9ULB5 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CDH7Q9ULB5 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
CDH7Q9ULB5 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
CDH7Q9ULB5 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CDH7Q9ULB5 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CDH7Q9ULB5 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CDH7Q9ULB5 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CDH7Q9ULB5 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
CDH7Q9ULB5 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
CDH7Q9ULB5 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CDH7Q9ULB5 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CDH7Q9ULB5 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
CDH7Q9ULB5 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
CDH7Q9ULB5 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CDH7Q9ULB5 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CDH7Q9ULB5 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CDH7Q9ULB5 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CDH7Q9ULB5 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CDH7Q9ULB5 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CDH7Q9ULB5 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CDH7Q9ULB5 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CDH7Q9ULB5 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
CDH7Q9ULB5 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CDH7Q9ULB5 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
CDH7Q9ULB5 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CDH7Q9ULB5 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
CDH7Q9ULB5 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CDH7Q9ULB5 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CDH7Q9ULB5 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CDH7Q9ULB5 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CDH7Q9ULB5 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CDH7Q9ULB5 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CDH7Q9ULB5 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CDH7Q9ULB5 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CDH7Q9ULB5 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CDH7Q9ULB5 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CDH7Q9ULB5 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CDH7Q9ULB5 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CDH7Q9ULB5 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CDH7Q9ULB5 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CDH7Q9ULB5 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CDH7Q9ULB5 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CDH7Q9ULB5 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CDH7Q9ULB5 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CDH7Q9ULB5 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CDH7Q9ULB5 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CDH7Q9ULB5 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CDH7Q9ULB5 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10 ms