Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKX7

NUP50, Nuclear pore complex protein Nup50, humanhuman

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP50Q9UKX7 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NUP50Q9UKX7 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NUP50Q9UKX7 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NUP50Q9UKX7 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NUP50Q9UKX7 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NUP50Q9UKX7 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NUP50Q9UKX7 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NUP50Q9UKX7 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NUP50Q9UKX7 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NUP50Q9UKX7 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NUP50Q9UKX7 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NUP50Q9UKX7 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NUP50Q9UKX7 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NUP50Q9UKX7 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NUP50Q9UKX7 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NUP50Q9UKX7 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NUP50Q9UKX7 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NUP50Q9UKX7 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
NUP50Q9UKX7 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NUP50Q9UKX7 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NUP50Q9UKX7 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NUP50Q9UKX7 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NUP50Q9UKX7 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NUP50Q9UKX7 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NUP50Q9UKX7 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NUP50Q9UKX7 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
NUP50Q9UKX7 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NUP50Q9UKX7 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NUP50Q9UKX7 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NUP50Q9UKX7 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NUP50Q9UKX7 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NUP50Q9UKX7 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NUP50Q9UKX7 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NUP50Q9UKX7 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NUP50Q9UKX7 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NUP50Q9UKX7 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NUP50Q9UKX7 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NUP50Q9UKX7 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NUP50Q9UKX7 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NUP50Q9UKX7 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NUP50Q9UKX7 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NUP50Q9UKX7 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NUP50Q9UKX7 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
NUP50Q9UKX7 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NUP50Q9UKX7 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NUP50Q9UKX7 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NUP50Q9UKX7 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NUP50Q9UKX7 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NUP50Q9UKX7 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NUP50Q9UKX7 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NUP50Q9UKX7 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NUP50Q9UKX7 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NUP50Q9UKX7 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NUP50Q9UKX7 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NUP50Q9UKX7 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NUP50Q9UKX7 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NUP50Q9UKX7 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NUP50Q9UKX7 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NUP50Q9UKX7 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NUP50Q9UKX7 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NUP50Q9UKX7 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NUP50Q9UKX7 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NUP50Q9UKX7 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NUP50Q9UKX7 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NUP50Q9UKX7 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NUP50Q9UKX7 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NUP50Q9UKX7 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NUP50Q9UKX7 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NUP50Q9UKX7 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NUP50Q9UKX7 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NUP50Q9UKX7 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NUP50Q9UKX7 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NUP50Q9UKX7 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NUP50Q9UKX7 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NUP50Q9UKX7 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NUP50Q9UKX7 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NUP50Q9UKX7 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NUP50Q9UKX7 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NUP50Q9UKX7 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NUP50Q9UKX7 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NUP50Q9UKX7 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NUP50Q9UKX7 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NUP50Q9UKX7 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NUP50Q9UKX7 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NUP50Q9UKX7 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NUP50Q9UKX7 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NUP50Q9UKX7 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
NUP50Q9UKX7 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NUP50Q9UKX7 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
NUP50Q9UKX7 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NUP50Q9UKX7 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NUP50Q9UKX7 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NUP50Q9UKX7 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NUP50Q9UKX7 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NUP50Q9UKX7 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NUP50Q9UKX7 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NUP50Q9UKX7 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NUP50Q9UKX7 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NUP50Q9UKX7 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NUP50Q9UKX7 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms