Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKL3

CASP8AP2, CASP8-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,982 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP8AP2Q9UKL3 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
CASP8AP2Q9UKL3 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC33.16■■■□□ 2.9
CASP8AP2Q9UKL3 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
CASP8AP2Q9UKL3 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
CASP8AP2Q9UKL3 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.9
CASP8AP2Q9UKL3 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
CASP8AP2Q9UKL3 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.11■■■□□ 2.89
CASP8AP2Q9UKL3 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.11■■■□□ 2.89
CASP8AP2Q9UKL3 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC33.1■■■□□ 2.89
CASP8AP2Q9UKL3 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC33.1■■■□□ 2.89
CASP8AP2Q9UKL3 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
CASP8AP2Q9UKL3 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC33.1■■■□□ 2.89
CASP8AP2Q9UKL3 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC33.08■■■□□ 2.89
CASP8AP2Q9UKL3 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
CASP8AP2Q9UKL3 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
CASP8AP2Q9UKL3 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC33.05■■■□□ 2.88
CASP8AP2Q9UKL3 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
CASP8AP2Q9UKL3 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC33.03■■■□□ 2.88
CASP8AP2Q9UKL3 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC33.02■■■□□ 2.88
CASP8AP2Q9UKL3 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC33.01■■■□□ 2.88
CASP8AP2Q9UKL3 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC32.98■■■□□ 2.87
CASP8AP2Q9UKL3 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
CASP8AP2Q9UKL3 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.96■■■□□ 2.87
CASP8AP2Q9UKL3 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC32.92■■■□□ 2.86
CASP8AP2Q9UKL3 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
CASP8AP2Q9UKL3 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC32.91■■■□□ 2.86
CASP8AP2Q9UKL3 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.91■■■□□ 2.86
CASP8AP2Q9UKL3 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
CASP8AP2Q9UKL3 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC32.9■■■□□ 2.86
CASP8AP2Q9UKL3 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.9■■■□□ 2.86
CASP8AP2Q9UKL3 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC32.89■■■□□ 2.86
CASP8AP2Q9UKL3 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC32.89■■■□□ 2.85
CASP8AP2Q9UKL3 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC32.89■■■□□ 2.85
CASP8AP2Q9UKL3 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC32.87■■■□□ 2.85
CASP8AP2Q9UKL3 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
CASP8AP2Q9UKL3 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
CASP8AP2Q9UKL3 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
CASP8AP2Q9UKL3 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
CASP8AP2Q9UKL3 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
CASP8AP2Q9UKL3 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC32.77■■■□□ 2.84
CASP8AP2Q9UKL3 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC32.76■■■□□ 2.83
CASP8AP2Q9UKL3 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
CASP8AP2Q9UKL3 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC32.74■■■□□ 2.83
CASP8AP2Q9UKL3 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC32.74■■■□□ 2.83
CASP8AP2Q9UKL3 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC32.72■■■□□ 2.83
CASP8AP2Q9UKL3 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
CASP8AP2Q9UKL3 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC32.7■■■□□ 2.82
CASP8AP2Q9UKL3 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.68■■■□□ 2.82
CASP8AP2Q9UKL3 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
CASP8AP2Q9UKL3 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC32.67■■■□□ 2.82
CASP8AP2Q9UKL3 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC32.67■■■□□ 2.82
CASP8AP2Q9UKL3 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC32.66■■■□□ 2.82
CASP8AP2Q9UKL3 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.66■■■□□ 2.82
CASP8AP2Q9UKL3 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC32.66■■■□□ 2.82
CASP8AP2Q9UKL3 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
CASP8AP2Q9UKL3 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC32.63■■■□□ 2.81
CASP8AP2Q9UKL3 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
CASP8AP2Q9UKL3 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.63■■■□□ 2.81
CASP8AP2Q9UKL3 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
CASP8AP2Q9UKL3 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
CASP8AP2Q9UKL3 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC32.61■■■□□ 2.81
CASP8AP2Q9UKL3 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC32.61■■■□□ 2.81
CASP8AP2Q9UKL3 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
CASP8AP2Q9UKL3 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
CASP8AP2Q9UKL3 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC32.58■■■□□ 2.81
CASP8AP2Q9UKL3 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC32.57■■■□□ 2.81
CASP8AP2Q9UKL3 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.57■■■□□ 2.8
CASP8AP2Q9UKL3 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
CASP8AP2Q9UKL3 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
CASP8AP2Q9UKL3 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC32.52■■■□□ 2.8
CASP8AP2Q9UKL3 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC32.51■■■□□ 2.8
CASP8AP2Q9UKL3 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC32.51■■■□□ 2.8
CASP8AP2Q9UKL3 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC32.5■■■□□ 2.79
CASP8AP2Q9UKL3 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
CASP8AP2Q9UKL3 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC32.49■■■□□ 2.79
CASP8AP2Q9UKL3 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
CASP8AP2Q9UKL3 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
CASP8AP2Q9UKL3 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
CASP8AP2Q9UKL3 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.46■■■□□ 2.79
CASP8AP2Q9UKL3 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
CASP8AP2Q9UKL3 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
CASP8AP2Q9UKL3 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
CASP8AP2Q9UKL3 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
CASP8AP2Q9UKL3 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC32.39■■■□□ 2.78
CASP8AP2Q9UKL3 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC32.38■■■□□ 2.77
CASP8AP2Q9UKL3 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC32.37■■■□□ 2.77
CASP8AP2Q9UKL3 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC32.37■■■□□ 2.77
CASP8AP2Q9UKL3 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
CASP8AP2Q9UKL3 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
CASP8AP2Q9UKL3 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
CASP8AP2Q9UKL3 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
CASP8AP2Q9UKL3 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
CASP8AP2Q9UKL3 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
CASP8AP2Q9UKL3 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC32.27■■■□□ 2.76
CASP8AP2Q9UKL3 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
CASP8AP2Q9UKL3 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC32.26■■■□□ 2.75
CASP8AP2Q9UKL3 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
CASP8AP2Q9UKL3 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
CASP8AP2Q9UKL3 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
CASP8AP2Q9UKL3 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC32.22■■■□□ 2.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms