Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKG1

APPL1, DCC-interacting protein 13-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APPL1Q9UKG1 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
APPL1Q9UKG1 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
APPL1Q9UKG1 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
APPL1Q9UKG1 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
APPL1Q9UKG1 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
APPL1Q9UKG1 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
APPL1Q9UKG1 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
APPL1Q9UKG1 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
APPL1Q9UKG1 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
APPL1Q9UKG1 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
APPL1Q9UKG1 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
APPL1Q9UKG1 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
APPL1Q9UKG1 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
APPL1Q9UKG1 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
APPL1Q9UKG1 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
APPL1Q9UKG1 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
APPL1Q9UKG1 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
APPL1Q9UKG1 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
APPL1Q9UKG1 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
APPL1Q9UKG1 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
APPL1Q9UKG1 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
APPL1Q9UKG1 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
APPL1Q9UKG1 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
APPL1Q9UKG1 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
APPL1Q9UKG1 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
APPL1Q9UKG1 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
APPL1Q9UKG1 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
APPL1Q9UKG1 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
APPL1Q9UKG1 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
APPL1Q9UKG1 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
APPL1Q9UKG1 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
APPL1Q9UKG1 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
APPL1Q9UKG1 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
APPL1Q9UKG1 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
APPL1Q9UKG1 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
APPL1Q9UKG1 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
APPL1Q9UKG1 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.03
APPL1Q9UKG1 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
APPL1Q9UKG1 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
APPL1Q9UKG1 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
APPL1Q9UKG1 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
APPL1Q9UKG1 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
APPL1Q9UKG1 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
APPL1Q9UKG1 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
APPL1Q9UKG1 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
APPL1Q9UKG1 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC27.66■■■□□ 2.02
APPL1Q9UKG1 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
APPL1Q9UKG1 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
APPL1Q9UKG1 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
APPL1Q9UKG1 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
APPL1Q9UKG1 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
APPL1Q9UKG1 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
APPL1Q9UKG1 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
APPL1Q9UKG1 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
APPL1Q9UKG1 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
APPL1Q9UKG1 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
APPL1Q9UKG1 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
APPL1Q9UKG1 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
APPL1Q9UKG1 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
APPL1Q9UKG1 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
APPL1Q9UKG1 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
APPL1Q9UKG1 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC27.56■■■□□ 2
APPL1Q9UKG1 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC27.56■■■□□ 2
APPL1Q9UKG1 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
APPL1Q9UKG1 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
APPL1Q9UKG1 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
APPL1Q9UKG1 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
APPL1Q9UKG1 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
APPL1Q9UKG1 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
APPL1Q9UKG1 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
APPL1Q9UKG1 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
APPL1Q9UKG1 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
APPL1Q9UKG1 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
APPL1Q9UKG1 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
APPL1Q9UKG1 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
APPL1Q9UKG1 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
APPL1Q9UKG1 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
APPL1Q9UKG1 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
APPL1Q9UKG1 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
APPL1Q9UKG1 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
APPL1Q9UKG1 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
APPL1Q9UKG1 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
APPL1Q9UKG1 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
APPL1Q9UKG1 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
APPL1Q9UKG1 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
APPL1Q9UKG1 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
APPL1Q9UKG1 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
APPL1Q9UKG1 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
APPL1Q9UKG1 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
APPL1Q9UKG1 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
APPL1Q9UKG1 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
APPL1Q9UKG1 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
APPL1Q9UKG1 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
APPL1Q9UKG1 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
APPL1Q9UKG1 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
APPL1Q9UKG1 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
APPL1Q9UKG1 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
APPL1Q9UKG1 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
APPL1Q9UKG1 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
APPL1Q9UKG1 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms