Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKA8

RCAN3, Calcipressin-3, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCAN3Q9UKA8 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
RCAN3Q9UKA8 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
RCAN3Q9UKA8 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC36.19■■■■□ 3.38
RCAN3Q9UKA8 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
RCAN3Q9UKA8 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC36.19■■■■□ 3.38
RCAN3Q9UKA8 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
RCAN3Q9UKA8 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC36.17■■■■□ 3.38
RCAN3Q9UKA8 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC36.17■■■■□ 3.38
RCAN3Q9UKA8 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
RCAN3Q9UKA8 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC36.17■■■■□ 3.38
RCAN3Q9UKA8 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
RCAN3Q9UKA8 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
RCAN3Q9UKA8 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
RCAN3Q9UKA8 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
RCAN3Q9UKA8 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
RCAN3Q9UKA8 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
RCAN3Q9UKA8 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC36.12■■■■□ 3.37
RCAN3Q9UKA8 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
RCAN3Q9UKA8 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
RCAN3Q9UKA8 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
RCAN3Q9UKA8 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC36.09■■■■□ 3.37
RCAN3Q9UKA8 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
RCAN3Q9UKA8 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
RCAN3Q9UKA8 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.06■■■■□ 3.36
RCAN3Q9UKA8 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
RCAN3Q9UKA8 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC36.05■■■■□ 3.36
RCAN3Q9UKA8 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC36.04■■■■□ 3.36
RCAN3Q9UKA8 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
RCAN3Q9UKA8 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
RCAN3Q9UKA8 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.03■■■■□ 3.36
RCAN3Q9UKA8 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.03■■■■□ 3.36
RCAN3Q9UKA8 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
RCAN3Q9UKA8 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC35.99■■■■□ 3.35
RCAN3Q9UKA8 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
RCAN3Q9UKA8 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC35.96■■■■□ 3.35
RCAN3Q9UKA8 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC35.95■■■■□ 3.35
RCAN3Q9UKA8 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
RCAN3Q9UKA8 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC35.95■■■■□ 3.35
RCAN3Q9UKA8 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.34
RCAN3Q9UKA8 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC35.93■■■■□ 3.34
RCAN3Q9UKA8 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
RCAN3Q9UKA8 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC35.92■■■■□ 3.34
RCAN3Q9UKA8 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
RCAN3Q9UKA8 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC35.9■■■■□ 3.34
RCAN3Q9UKA8 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
RCAN3Q9UKA8 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC35.87■■■■□ 3.33
RCAN3Q9UKA8 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC35.87■■■■□ 3.33
RCAN3Q9UKA8 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
RCAN3Q9UKA8 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
RCAN3Q9UKA8 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
RCAN3Q9UKA8 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
RCAN3Q9UKA8 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC35.78■■■■□ 3.32
RCAN3Q9UKA8 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC35.78■■■■□ 3.32
RCAN3Q9UKA8 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC35.78■■■■□ 3.32
RCAN3Q9UKA8 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
RCAN3Q9UKA8 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
RCAN3Q9UKA8 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
RCAN3Q9UKA8 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
RCAN3Q9UKA8 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC35.73■■■■□ 3.31
RCAN3Q9UKA8 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC35.72■■■■□ 3.31
RCAN3Q9UKA8 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
RCAN3Q9UKA8 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
RCAN3Q9UKA8 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC35.66■■■■□ 3.3
RCAN3Q9UKA8 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC35.66■■■■□ 3.3
RCAN3Q9UKA8 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
RCAN3Q9UKA8 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
RCAN3Q9UKA8 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
RCAN3Q9UKA8 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC35.63■■■■□ 3.29
RCAN3Q9UKA8 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
RCAN3Q9UKA8 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
RCAN3Q9UKA8 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
RCAN3Q9UKA8 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
RCAN3Q9UKA8 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
RCAN3Q9UKA8 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
RCAN3Q9UKA8 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC35.57■■■■□ 3.28
RCAN3Q9UKA8 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
RCAN3Q9UKA8 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
RCAN3Q9UKA8 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
RCAN3Q9UKA8 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.55■■■■□ 3.28
RCAN3Q9UKA8 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC35.55■■■■□ 3.28
RCAN3Q9UKA8 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
RCAN3Q9UKA8 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC35.51■■■■□ 3.28
RCAN3Q9UKA8 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
RCAN3Q9UKA8 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC35.49■■■■□ 3.27
RCAN3Q9UKA8 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC35.49■■■■□ 3.27
RCAN3Q9UKA8 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.48■■■■□ 3.27
RCAN3Q9UKA8 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
RCAN3Q9UKA8 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
RCAN3Q9UKA8 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
RCAN3Q9UKA8 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC35.45■■■■□ 3.27
RCAN3Q9UKA8 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
RCAN3Q9UKA8 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
RCAN3Q9UKA8 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
RCAN3Q9UKA8 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
RCAN3Q9UKA8 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC35.42■■■■□ 3.26
RCAN3Q9UKA8 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
RCAN3Q9UKA8 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC35.41■■■■□ 3.26
RCAN3Q9UKA8 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
RCAN3Q9UKA8 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
RCAN3Q9UKA8 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms