Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBD3

XCL2, Cytokine SCM-1 beta, humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XCL2Q9UBD3 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
XCL2Q9UBD3 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
XCL2Q9UBD3 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
XCL2Q9UBD3 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
XCL2Q9UBD3 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
XCL2Q9UBD3 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
XCL2Q9UBD3 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
XCL2Q9UBD3 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
XCL2Q9UBD3 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
XCL2Q9UBD3 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
XCL2Q9UBD3 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
XCL2Q9UBD3 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
XCL2Q9UBD3 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
XCL2Q9UBD3 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
XCL2Q9UBD3 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
XCL2Q9UBD3 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
XCL2Q9UBD3 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
XCL2Q9UBD3 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
XCL2Q9UBD3 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
XCL2Q9UBD3 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
XCL2Q9UBD3 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
XCL2Q9UBD3 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
XCL2Q9UBD3 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.84
XCL2Q9UBD3 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
XCL2Q9UBD3 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
XCL2Q9UBD3 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
XCL2Q9UBD3 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
XCL2Q9UBD3 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
XCL2Q9UBD3 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
XCL2Q9UBD3 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
XCL2Q9UBD3 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
XCL2Q9UBD3 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
XCL2Q9UBD3 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
XCL2Q9UBD3 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
XCL2Q9UBD3 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
XCL2Q9UBD3 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
XCL2Q9UBD3 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
XCL2Q9UBD3 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
XCL2Q9UBD3 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
XCL2Q9UBD3 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
XCL2Q9UBD3 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
XCL2Q9UBD3 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
XCL2Q9UBD3 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
XCL2Q9UBD3 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
XCL2Q9UBD3 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
XCL2Q9UBD3 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
XCL2Q9UBD3 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
XCL2Q9UBD3 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
XCL2Q9UBD3 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
XCL2Q9UBD3 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
XCL2Q9UBD3 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
XCL2Q9UBD3 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
XCL2Q9UBD3 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
XCL2Q9UBD3 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
XCL2Q9UBD3 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
XCL2Q9UBD3 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
XCL2Q9UBD3 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
XCL2Q9UBD3 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
XCL2Q9UBD3 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
XCL2Q9UBD3 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
XCL2Q9UBD3 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
XCL2Q9UBD3 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
XCL2Q9UBD3 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
XCL2Q9UBD3 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
XCL2Q9UBD3 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
XCL2Q9UBD3 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
XCL2Q9UBD3 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
XCL2Q9UBD3 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
XCL2Q9UBD3 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
XCL2Q9UBD3 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
XCL2Q9UBD3 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
XCL2Q9UBD3 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
XCL2Q9UBD3 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
XCL2Q9UBD3 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
XCL2Q9UBD3 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
XCL2Q9UBD3 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
XCL2Q9UBD3 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
XCL2Q9UBD3 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
XCL2Q9UBD3 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
XCL2Q9UBD3 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
XCL2Q9UBD3 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
XCL2Q9UBD3 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
XCL2Q9UBD3 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
XCL2Q9UBD3 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
XCL2Q9UBD3 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
XCL2Q9UBD3 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
XCL2Q9UBD3 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
XCL2Q9UBD3 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
XCL2Q9UBD3 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
XCL2Q9UBD3 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
XCL2Q9UBD3 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
XCL2Q9UBD3 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
XCL2Q9UBD3 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
XCL2Q9UBD3 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
XCL2Q9UBD3 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
XCL2Q9UBD3 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
XCL2Q9UBD3 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
XCL2Q9UBD3 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
XCL2Q9UBD3 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
XCL2Q9UBD3 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms