Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBC3

DNMT3B, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 853 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNMT3BQ9UBC3 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
DNMT3BQ9UBC3 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
DNMT3BQ9UBC3 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
DNMT3BQ9UBC3 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
DNMT3BQ9UBC3 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
DNMT3BQ9UBC3 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
DNMT3BQ9UBC3 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
DNMT3BQ9UBC3 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC29.45■■■□□ 2.3
DNMT3BQ9UBC3 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
DNMT3BQ9UBC3 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
DNMT3BQ9UBC3 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
DNMT3BQ9UBC3 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
DNMT3BQ9UBC3 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
DNMT3BQ9UBC3 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
DNMT3BQ9UBC3 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
DNMT3BQ9UBC3 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
DNMT3BQ9UBC3 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
DNMT3BQ9UBC3 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
DNMT3BQ9UBC3 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
DNMT3BQ9UBC3 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
DNMT3BQ9UBC3 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
DNMT3BQ9UBC3 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
DNMT3BQ9UBC3 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
DNMT3BQ9UBC3 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
DNMT3BQ9UBC3 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
DNMT3BQ9UBC3 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
DNMT3BQ9UBC3 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
DNMT3BQ9UBC3 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC29.26■■■□□ 2.27
DNMT3BQ9UBC3 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
DNMT3BQ9UBC3 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
DNMT3BQ9UBC3 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
DNMT3BQ9UBC3 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
DNMT3BQ9UBC3 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
DNMT3BQ9UBC3 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
DNMT3BQ9UBC3 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
DNMT3BQ9UBC3 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
DNMT3BQ9UBC3 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
DNMT3BQ9UBC3 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
DNMT3BQ9UBC3 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC29.21■■■□□ 2.27
DNMT3BQ9UBC3 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
DNMT3BQ9UBC3 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
DNMT3BQ9UBC3 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
DNMT3BQ9UBC3 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
DNMT3BQ9UBC3 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
DNMT3BQ9UBC3 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
DNMT3BQ9UBC3 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
DNMT3BQ9UBC3 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
DNMT3BQ9UBC3 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
DNMT3BQ9UBC3 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC29.14■■■□□ 2.26
DNMT3BQ9UBC3 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
DNMT3BQ9UBC3 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
DNMT3BQ9UBC3 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
DNMT3BQ9UBC3 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
DNMT3BQ9UBC3 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
DNMT3BQ9UBC3 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
DNMT3BQ9UBC3 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
DNMT3BQ9UBC3 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
DNMT3BQ9UBC3 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
DNMT3BQ9UBC3 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
DNMT3BQ9UBC3 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
DNMT3BQ9UBC3 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
DNMT3BQ9UBC3 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
DNMT3BQ9UBC3 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
DNMT3BQ9UBC3 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
DNMT3BQ9UBC3 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
DNMT3BQ9UBC3 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
DNMT3BQ9UBC3 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
DNMT3BQ9UBC3 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
DNMT3BQ9UBC3 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
DNMT3BQ9UBC3 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
DNMT3BQ9UBC3 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
DNMT3BQ9UBC3 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
DNMT3BQ9UBC3 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
DNMT3BQ9UBC3 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
DNMT3BQ9UBC3 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
DNMT3BQ9UBC3 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
DNMT3BQ9UBC3 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
DNMT3BQ9UBC3 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
DNMT3BQ9UBC3 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
DNMT3BQ9UBC3 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
DNMT3BQ9UBC3 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
DNMT3BQ9UBC3 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
DNMT3BQ9UBC3 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
DNMT3BQ9UBC3 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
DNMT3BQ9UBC3 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
DNMT3BQ9UBC3 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
DNMT3BQ9UBC3 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
DNMT3BQ9UBC3 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
DNMT3BQ9UBC3 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
DNMT3BQ9UBC3 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
DNMT3BQ9UBC3 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
DNMT3BQ9UBC3 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
DNMT3BQ9UBC3 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.78■■■□□ 2.2
DNMT3BQ9UBC3 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
DNMT3BQ9UBC3 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
DNMT3BQ9UBC3 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
DNMT3BQ9UBC3 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
DNMT3BQ9UBC3 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
DNMT3BQ9UBC3 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
DNMT3BQ9UBC3 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 516 ms