Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2K1

CC2D2A, Coiled-coil and C2 domain-containing protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CC2D2AQ9P2K1 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC52.76■■■■■ 6.04
CC2D2AQ9P2K1 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC52.75■■■■■ 6.03
CC2D2AQ9P2K1 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC52.73■■■■■ 6.03
CC2D2AQ9P2K1 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC52.69■■■■■ 6.03
CC2D2AQ9P2K1 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC52.68■■■■■ 6.02
CC2D2AQ9P2K1 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC52.67■■■■■ 6.02
CC2D2AQ9P2K1 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC52.66■■■■■ 6.02
CC2D2AQ9P2K1 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC52.66■■■■■ 6.02
CC2D2AQ9P2K1 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC52.64■■■■■ 6.02
CC2D2AQ9P2K1 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC52.58■■■■■ 6.01
CC2D2AQ9P2K1 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC52.57■■■■■ 6.01
CC2D2AQ9P2K1 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC52.57■■■■■ 6.01
CC2D2AQ9P2K1 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC52.55■■■■■ 6
CC2D2AQ9P2K1 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC52.53■■■■■ 6
CC2D2AQ9P2K1 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC52.53■■■■■ 6
CC2D2AQ9P2K1 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC52.52■■■■■ 6
CC2D2AQ9P2K1 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC52.44■■■■■ 5.98
CC2D2AQ9P2K1 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC52.44■■■■■ 5.98
CC2D2AQ9P2K1 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC52.44■■■■■ 5.98
CC2D2AQ9P2K1 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC52.44■■■■■ 5.98
CC2D2AQ9P2K1 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC52.44■■■■■ 5.98
CC2D2AQ9P2K1 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.41■■■■■ 5.98
CC2D2AQ9P2K1 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.38■■■■■ 5.98
CC2D2AQ9P2K1 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC52.36■■■■■ 5.97
CC2D2AQ9P2K1 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC52.33■■■■■ 5.97
CC2D2AQ9P2K1 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC52.32■■■■■ 5.97
CC2D2AQ9P2K1 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC52.32■■■■■ 5.97
CC2D2AQ9P2K1 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.29■■■■■ 5.96
CC2D2AQ9P2K1 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.26■■■■■ 5.96
CC2D2AQ9P2K1 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC52.25■■■■■ 5.95
CC2D2AQ9P2K1 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC52.2■■■■■ 5.95
CC2D2AQ9P2K1 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC52.19■■■■■ 5.95
CC2D2AQ9P2K1 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC52.18■■■■■ 5.94
CC2D2AQ9P2K1 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC52.18■■■■■ 5.94
CC2D2AQ9P2K1 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.17■■■■■ 5.94
CC2D2AQ9P2K1 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC52.15■■■■■ 5.94
CC2D2AQ9P2K1 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC52.15■■■■■ 5.94
CC2D2AQ9P2K1 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC52.13■■■■■ 5.94
CC2D2AQ9P2K1 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC52.07■■■■■ 5.93
CC2D2AQ9P2K1 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.07■■■■■ 5.93
CC2D2AQ9P2K1 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC52.07■■■■■ 5.93
CC2D2AQ9P2K1 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC52.06■■■■■ 5.92
CC2D2AQ9P2K1 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.05■■■■■ 5.92
CC2D2AQ9P2K1 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC52.01■■■■■ 5.92
CC2D2AQ9P2K1 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC52■■■■■ 5.91
CC2D2AQ9P2K1 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC51.98■■■■■ 5.91
CC2D2AQ9P2K1 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC51.98■■■■■ 5.91
CC2D2AQ9P2K1 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC51.97■■■■■ 5.91
CC2D2AQ9P2K1 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.97■■■■■ 5.91
CC2D2AQ9P2K1 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC51.97■■■■■ 5.91
CC2D2AQ9P2K1 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC51.96■■■■■ 5.91
CC2D2AQ9P2K1 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC51.95■■■■■ 5.91
CC2D2AQ9P2K1 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.94■■■■■ 5.91
CC2D2AQ9P2K1 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC51.94■■■■■ 5.91
CC2D2AQ9P2K1 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC51.94■■■■■ 5.91
CC2D2AQ9P2K1 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.93■■■■■ 5.9
CC2D2AQ9P2K1 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.89■■■■■ 5.9
CC2D2AQ9P2K1 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC51.88■■■■■ 5.9
CC2D2AQ9P2K1 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC51.86■■■■■ 5.89
CC2D2AQ9P2K1 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC51.86■■■■■ 5.89
CC2D2AQ9P2K1 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC51.85■■■■■ 5.89
CC2D2AQ9P2K1 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC51.83■■■■■ 5.89
CC2D2AQ9P2K1 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC51.82■■■■■ 5.89
CC2D2AQ9P2K1 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.79■■■■■ 5.88
CC2D2AQ9P2K1 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC51.79■■■■■ 5.88
CC2D2AQ9P2K1 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC51.78■■■■■ 5.88
CC2D2AQ9P2K1 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC51.78■■■■■ 5.88
CC2D2AQ9P2K1 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC51.78■■■■■ 5.88
CC2D2AQ9P2K1 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC51.75■■■■■ 5.88
CC2D2AQ9P2K1 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC51.75■■■■■ 5.87
CC2D2AQ9P2K1 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC51.73■■■■■ 5.87
CC2D2AQ9P2K1 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC51.69■■■■■ 5.87
CC2D2AQ9P2K1 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC51.68■■■■■ 5.86
CC2D2AQ9P2K1 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC51.67■■■■■ 5.86
CC2D2AQ9P2K1 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC51.66■■■■■ 5.86
CC2D2AQ9P2K1 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC51.65■■■■■ 5.86
CC2D2AQ9P2K1 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC51.63■■■■■ 5.86
CC2D2AQ9P2K1 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC51.62■■■■■ 5.85
CC2D2AQ9P2K1 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.62■■■■■ 5.85
CC2D2AQ9P2K1 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC51.56■■■■■ 5.84
CC2D2AQ9P2K1 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.55■■■■■ 5.84
CC2D2AQ9P2K1 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC51.53■■■■■ 5.84
CC2D2AQ9P2K1 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC51.53■■■■■ 5.84
CC2D2AQ9P2K1 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC51.51■■■■■ 5.84
CC2D2AQ9P2K1 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC51.5■■■■■ 5.84
CC2D2AQ9P2K1 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC51.5■■■■■ 5.83
CC2D2AQ9P2K1 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC51.49■■■■■ 5.83
CC2D2AQ9P2K1 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.49■■■■■ 5.83
CC2D2AQ9P2K1 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC51.48■■■■■ 5.83
CC2D2AQ9P2K1 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC51.46■■■■■ 5.83
CC2D2AQ9P2K1 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.38■■■■■ 5.82
CC2D2AQ9P2K1 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC51.38■■■■■ 5.82
CC2D2AQ9P2K1 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC51.38■■■■■ 5.82
CC2D2AQ9P2K1 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC51.37■■■■■ 5.81
CC2D2AQ9P2K1 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.36■■■■■ 5.81
CC2D2AQ9P2K1 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC51.36■■■■■ 5.81
CC2D2AQ9P2K1 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC51.33■■■■■ 5.81
CC2D2AQ9P2K1 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC51.33■■■■■ 5.81
CC2D2AQ9P2K1 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC51.29■■■■■ 5.8
CC2D2AQ9P2K1 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC51.29■■■■■ 5.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.5 ms