Protein–RNA interactions for Protein: Q9P109

GCNT4, Beta-1,3-galactosyl-O-glycosyl-glycoprotein beta-1,6-N-acetylglucosaminyltransferase 4, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNT4Q9P109 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
GCNT4Q9P109 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
GCNT4Q9P109 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
GCNT4Q9P109 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC30.27■■■□□ 2.44
GCNT4Q9P109 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
GCNT4Q9P109 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
GCNT4Q9P109 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
GCNT4Q9P109 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.24■■■□□ 2.43
GCNT4Q9P109 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
GCNT4Q9P109 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
GCNT4Q9P109 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
GCNT4Q9P109 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
GCNT4Q9P109 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
GCNT4Q9P109 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.2■■■□□ 2.42
GCNT4Q9P109 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC30.19■■■□□ 2.42
GCNT4Q9P109 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC30.18■■■□□ 2.42
GCNT4Q9P109 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
GCNT4Q9P109 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
GCNT4Q9P109 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC30.14■■■□□ 2.42
GCNT4Q9P109 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
GCNT4Q9P109 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
GCNT4Q9P109 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
GCNT4Q9P109 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
GCNT4Q9P109 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC30.1■■■□□ 2.41
GCNT4Q9P109 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC30.08■■■□□ 2.41
GCNT4Q9P109 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
GCNT4Q9P109 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.41
GCNT4Q9P109 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
GCNT4Q9P109 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC30.06■■■□□ 2.4
GCNT4Q9P109 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
GCNT4Q9P109 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
GCNT4Q9P109 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC30.05■■■□□ 2.4
GCNT4Q9P109 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
GCNT4Q9P109 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
GCNT4Q9P109 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
GCNT4Q9P109 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
GCNT4Q9P109 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
GCNT4Q9P109 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
GCNT4Q9P109 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
GCNT4Q9P109 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
GCNT4Q9P109 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
GCNT4Q9P109 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
GCNT4Q9P109 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
GCNT4Q9P109 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
GCNT4Q9P109 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
GCNT4Q9P109 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
GCNT4Q9P109 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.38
GCNT4Q9P109 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.38
GCNT4Q9P109 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.38
GCNT4Q9P109 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
GCNT4Q9P109 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
GCNT4Q9P109 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
GCNT4Q9P109 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
GCNT4Q9P109 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
GCNT4Q9P109 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
GCNT4Q9P109 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
GCNT4Q9P109 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
GCNT4Q9P109 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
GCNT4Q9P109 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
GCNT4Q9P109 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
GCNT4Q9P109 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
GCNT4Q9P109 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC29.89■■■□□ 2.37
GCNT4Q9P109 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
GCNT4Q9P109 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC29.88■■■□□ 2.37
GCNT4Q9P109 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
GCNT4Q9P109 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
GCNT4Q9P109 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
GCNT4Q9P109 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
GCNT4Q9P109 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
GCNT4Q9P109 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
GCNT4Q9P109 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
GCNT4Q9P109 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
GCNT4Q9P109 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
GCNT4Q9P109 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
GCNT4Q9P109 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
GCNT4Q9P109 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
GCNT4Q9P109 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
GCNT4Q9P109 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
GCNT4Q9P109 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
GCNT4Q9P109 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
GCNT4Q9P109 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
GCNT4Q9P109 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
GCNT4Q9P109 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
GCNT4Q9P109 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
GCNT4Q9P109 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
GCNT4Q9P109 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
GCNT4Q9P109 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
GCNT4Q9P109 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
GCNT4Q9P109 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
GCNT4Q9P109 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
GCNT4Q9P109 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
GCNT4Q9P109 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
GCNT4Q9P109 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
GCNT4Q9P109 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
GCNT4Q9P109 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
GCNT4Q9P109 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
GCNT4Q9P109 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
GCNT4Q9P109 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
GCNT4Q9P109 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
GCNT4Q9P109 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10 ms