Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZM1

MYOF, Myoferlin, humanhuman

Predictions only

Length 2,061 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYOFQ9NZM1 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
MYOFQ9NZM1 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
MYOFQ9NZM1 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
MYOFQ9NZM1 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
MYOFQ9NZM1 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
MYOFQ9NZM1 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
MYOFQ9NZM1 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
MYOFQ9NZM1 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
MYOFQ9NZM1 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
MYOFQ9NZM1 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
MYOFQ9NZM1 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
MYOFQ9NZM1 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
MYOFQ9NZM1 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
MYOFQ9NZM1 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
MYOFQ9NZM1 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
MYOFQ9NZM1 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
MYOFQ9NZM1 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
MYOFQ9NZM1 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
MYOFQ9NZM1 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
MYOFQ9NZM1 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
MYOFQ9NZM1 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
MYOFQ9NZM1 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
MYOFQ9NZM1 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
MYOFQ9NZM1 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
MYOFQ9NZM1 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
MYOFQ9NZM1 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
MYOFQ9NZM1 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
MYOFQ9NZM1 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
MYOFQ9NZM1 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
MYOFQ9NZM1 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
MYOFQ9NZM1 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
MYOFQ9NZM1 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
MYOFQ9NZM1 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
MYOFQ9NZM1 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
MYOFQ9NZM1 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
MYOFQ9NZM1 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
MYOFQ9NZM1 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
MYOFQ9NZM1 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
MYOFQ9NZM1 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
MYOFQ9NZM1 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
MYOFQ9NZM1 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
MYOFQ9NZM1 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
MYOFQ9NZM1 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.48■■■□□ 2.15
MYOFQ9NZM1 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
MYOFQ9NZM1 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
MYOFQ9NZM1 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
MYOFQ9NZM1 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
MYOFQ9NZM1 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
MYOFQ9NZM1 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
MYOFQ9NZM1 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
MYOFQ9NZM1 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
MYOFQ9NZM1 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
MYOFQ9NZM1 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
MYOFQ9NZM1 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
MYOFQ9NZM1 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
MYOFQ9NZM1 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
MYOFQ9NZM1 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
MYOFQ9NZM1 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
MYOFQ9NZM1 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
MYOFQ9NZM1 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
MYOFQ9NZM1 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
MYOFQ9NZM1 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
MYOFQ9NZM1 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
MYOFQ9NZM1 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
MYOFQ9NZM1 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
MYOFQ9NZM1 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
MYOFQ9NZM1 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
MYOFQ9NZM1 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
MYOFQ9NZM1 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
MYOFQ9NZM1 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
MYOFQ9NZM1 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
MYOFQ9NZM1 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
MYOFQ9NZM1 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
MYOFQ9NZM1 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
MYOFQ9NZM1 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
MYOFQ9NZM1 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
MYOFQ9NZM1 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
MYOFQ9NZM1 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
MYOFQ9NZM1 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC28.21■■■□□ 2.11
MYOFQ9NZM1 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
MYOFQ9NZM1 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.11
MYOFQ9NZM1 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
MYOFQ9NZM1 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
MYOFQ9NZM1 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
MYOFQ9NZM1 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
MYOFQ9NZM1 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
MYOFQ9NZM1 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
MYOFQ9NZM1 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
MYOFQ9NZM1 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
MYOFQ9NZM1 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
MYOFQ9NZM1 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
MYOFQ9NZM1 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
MYOFQ9NZM1 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
MYOFQ9NZM1 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
MYOFQ9NZM1 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
MYOFQ9NZM1 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
MYOFQ9NZM1 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
MYOFQ9NZM1 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
MYOFQ9NZM1 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
MYOFQ9NZM1 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms