Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXJ5

PGPEP1, Pyroglutamyl-peptidase 1, humanhuman

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGPEP1Q9NXJ5 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PGPEP1Q9NXJ5 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PGPEP1Q9NXJ5 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PGPEP1Q9NXJ5 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PGPEP1Q9NXJ5 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PGPEP1Q9NXJ5 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PGPEP1Q9NXJ5 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PGPEP1Q9NXJ5 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PGPEP1Q9NXJ5 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PGPEP1Q9NXJ5 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PGPEP1Q9NXJ5 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PGPEP1Q9NXJ5 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PGPEP1Q9NXJ5 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PGPEP1Q9NXJ5 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PGPEP1Q9NXJ5 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PGPEP1Q9NXJ5 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PGPEP1Q9NXJ5 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PGPEP1Q9NXJ5 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PGPEP1Q9NXJ5 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PGPEP1Q9NXJ5 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PGPEP1Q9NXJ5 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PGPEP1Q9NXJ5 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PGPEP1Q9NXJ5 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PGPEP1Q9NXJ5 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PGPEP1Q9NXJ5 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PGPEP1Q9NXJ5 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PGPEP1Q9NXJ5 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PGPEP1Q9NXJ5 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PGPEP1Q9NXJ5 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PGPEP1Q9NXJ5 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PGPEP1Q9NXJ5 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PGPEP1Q9NXJ5 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PGPEP1Q9NXJ5 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PGPEP1Q9NXJ5 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PGPEP1Q9NXJ5 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PGPEP1Q9NXJ5 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PGPEP1Q9NXJ5 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PGPEP1Q9NXJ5 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PGPEP1Q9NXJ5 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PGPEP1Q9NXJ5 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PGPEP1Q9NXJ5 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PGPEP1Q9NXJ5 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PGPEP1Q9NXJ5 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PGPEP1Q9NXJ5 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PGPEP1Q9NXJ5 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PGPEP1Q9NXJ5 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PGPEP1Q9NXJ5 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PGPEP1Q9NXJ5 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PGPEP1Q9NXJ5 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PGPEP1Q9NXJ5 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PGPEP1Q9NXJ5 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PGPEP1Q9NXJ5 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PGPEP1Q9NXJ5 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PGPEP1Q9NXJ5 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PGPEP1Q9NXJ5 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PGPEP1Q9NXJ5 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PGPEP1Q9NXJ5 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PGPEP1Q9NXJ5 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PGPEP1Q9NXJ5 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PGPEP1Q9NXJ5 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PGPEP1Q9NXJ5 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PGPEP1Q9NXJ5 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PGPEP1Q9NXJ5 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
PGPEP1Q9NXJ5 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PGPEP1Q9NXJ5 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PGPEP1Q9NXJ5 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PGPEP1Q9NXJ5 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PGPEP1Q9NXJ5 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PGPEP1Q9NXJ5 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PGPEP1Q9NXJ5 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PGPEP1Q9NXJ5 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PGPEP1Q9NXJ5 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PGPEP1Q9NXJ5 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PGPEP1Q9NXJ5 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PGPEP1Q9NXJ5 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PGPEP1Q9NXJ5 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PGPEP1Q9NXJ5 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PGPEP1Q9NXJ5 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PGPEP1Q9NXJ5 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PGPEP1Q9NXJ5 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
PGPEP1Q9NXJ5 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PGPEP1Q9NXJ5 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PGPEP1Q9NXJ5 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PGPEP1Q9NXJ5 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PGPEP1Q9NXJ5 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
PGPEP1Q9NXJ5 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PGPEP1Q9NXJ5 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PGPEP1Q9NXJ5 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PGPEP1Q9NXJ5 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PGPEP1Q9NXJ5 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PGPEP1Q9NXJ5 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
PGPEP1Q9NXJ5 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PGPEP1Q9NXJ5 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PGPEP1Q9NXJ5 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PGPEP1Q9NXJ5 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PGPEP1Q9NXJ5 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PGPEP1Q9NXJ5 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PGPEP1Q9NXJ5 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PGPEP1Q9NXJ5 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PGPEP1Q9NXJ5 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms