Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXJ5

PGPEP1, Pyroglutamyl-peptidase 1, humanhuman

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGPEP1Q9NXJ5 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PGPEP1Q9NXJ5 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PGPEP1Q9NXJ5 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PGPEP1Q9NXJ5 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PGPEP1Q9NXJ5 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PGPEP1Q9NXJ5 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PGPEP1Q9NXJ5 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PGPEP1Q9NXJ5 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PGPEP1Q9NXJ5 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PGPEP1Q9NXJ5 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PGPEP1Q9NXJ5 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PGPEP1Q9NXJ5 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PGPEP1Q9NXJ5 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PGPEP1Q9NXJ5 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PGPEP1Q9NXJ5 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PGPEP1Q9NXJ5 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PGPEP1Q9NXJ5 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PGPEP1Q9NXJ5 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PGPEP1Q9NXJ5 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PGPEP1Q9NXJ5 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PGPEP1Q9NXJ5 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PGPEP1Q9NXJ5 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PGPEP1Q9NXJ5 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PGPEP1Q9NXJ5 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PGPEP1Q9NXJ5 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
PGPEP1Q9NXJ5 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PGPEP1Q9NXJ5 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PGPEP1Q9NXJ5 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PGPEP1Q9NXJ5 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PGPEP1Q9NXJ5 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PGPEP1Q9NXJ5 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PGPEP1Q9NXJ5 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PGPEP1Q9NXJ5 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PGPEP1Q9NXJ5 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PGPEP1Q9NXJ5 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PGPEP1Q9NXJ5 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PGPEP1Q9NXJ5 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PGPEP1Q9NXJ5 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PGPEP1Q9NXJ5 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PGPEP1Q9NXJ5 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PGPEP1Q9NXJ5 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PGPEP1Q9NXJ5 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PGPEP1Q9NXJ5 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PGPEP1Q9NXJ5 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PGPEP1Q9NXJ5 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PGPEP1Q9NXJ5 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PGPEP1Q9NXJ5 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PGPEP1Q9NXJ5 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PGPEP1Q9NXJ5 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PGPEP1Q9NXJ5 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PGPEP1Q9NXJ5 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PGPEP1Q9NXJ5 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PGPEP1Q9NXJ5 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PGPEP1Q9NXJ5 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PGPEP1Q9NXJ5 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PGPEP1Q9NXJ5 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PGPEP1Q9NXJ5 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PGPEP1Q9NXJ5 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PGPEP1Q9NXJ5 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PGPEP1Q9NXJ5 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PGPEP1Q9NXJ5 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PGPEP1Q9NXJ5 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PGPEP1Q9NXJ5 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PGPEP1Q9NXJ5 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PGPEP1Q9NXJ5 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PGPEP1Q9NXJ5 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PGPEP1Q9NXJ5 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PGPEP1Q9NXJ5 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PGPEP1Q9NXJ5 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PGPEP1Q9NXJ5 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PGPEP1Q9NXJ5 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PGPEP1Q9NXJ5 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PGPEP1Q9NXJ5 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PGPEP1Q9NXJ5 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PGPEP1Q9NXJ5 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PGPEP1Q9NXJ5 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PGPEP1Q9NXJ5 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PGPEP1Q9NXJ5 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PGPEP1Q9NXJ5 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PGPEP1Q9NXJ5 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PGPEP1Q9NXJ5 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PGPEP1Q9NXJ5 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PGPEP1Q9NXJ5 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PGPEP1Q9NXJ5 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PGPEP1Q9NXJ5 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PGPEP1Q9NXJ5 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PGPEP1Q9NXJ5 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PGPEP1Q9NXJ5 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PGPEP1Q9NXJ5 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PGPEP1Q9NXJ5 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PGPEP1Q9NXJ5 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PGPEP1Q9NXJ5 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PGPEP1Q9NXJ5 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PGPEP1Q9NXJ5 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PGPEP1Q9NXJ5 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PGPEP1Q9NXJ5 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PGPEP1Q9NXJ5 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PGPEP1Q9NXJ5 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PGPEP1Q9NXJ5 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PGPEP1Q9NXJ5 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.9 ms