Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV29

TMEM100, Transmembrane protein 100, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM100Q9NV29 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMEM100Q9NV29 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMEM100Q9NV29 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMEM100Q9NV29 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMEM100Q9NV29 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMEM100Q9NV29 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMEM100Q9NV29 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TMEM100Q9NV29 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMEM100Q9NV29 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMEM100Q9NV29 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TMEM100Q9NV29 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TMEM100Q9NV29 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TMEM100Q9NV29 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TMEM100Q9NV29 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TMEM100Q9NV29 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TMEM100Q9NV29 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TMEM100Q9NV29 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TMEM100Q9NV29 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TMEM100Q9NV29 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TMEM100Q9NV29 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TMEM100Q9NV29 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TMEM100Q9NV29 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TMEM100Q9NV29 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TMEM100Q9NV29 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TMEM100Q9NV29 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TMEM100Q9NV29 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TMEM100Q9NV29 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TMEM100Q9NV29 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TMEM100Q9NV29 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TMEM100Q9NV29 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TMEM100Q9NV29 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TMEM100Q9NV29 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TMEM100Q9NV29 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TMEM100Q9NV29 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TMEM100Q9NV29 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TMEM100Q9NV29 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TMEM100Q9NV29 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TMEM100Q9NV29 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TMEM100Q9NV29 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TMEM100Q9NV29 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TMEM100Q9NV29 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TMEM100Q9NV29 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TMEM100Q9NV29 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TMEM100Q9NV29 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TMEM100Q9NV29 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TMEM100Q9NV29 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TMEM100Q9NV29 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TMEM100Q9NV29 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TMEM100Q9NV29 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TMEM100Q9NV29 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TMEM100Q9NV29 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TMEM100Q9NV29 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TMEM100Q9NV29 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
TMEM100Q9NV29 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
TMEM100Q9NV29 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TMEM100Q9NV29 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TMEM100Q9NV29 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TMEM100Q9NV29 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMEM100Q9NV29 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMEM100Q9NV29 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TMEM100Q9NV29 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TMEM100Q9NV29 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TMEM100Q9NV29 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TMEM100Q9NV29 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMEM100Q9NV29 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMEM100Q9NV29 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMEM100Q9NV29 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMEM100Q9NV29 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMEM100Q9NV29 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMEM100Q9NV29 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMEM100Q9NV29 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMEM100Q9NV29 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMEM100Q9NV29 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TMEM100Q9NV29 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMEM100Q9NV29 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TMEM100Q9NV29 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TMEM100Q9NV29 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TMEM100Q9NV29 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TMEM100Q9NV29 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TMEM100Q9NV29 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TMEM100Q9NV29 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TMEM100Q9NV29 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TMEM100Q9NV29 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.35
TMEM100Q9NV29 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMEM100Q9NV29 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TMEM100Q9NV29 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
TMEM100Q9NV29 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMEM100Q9NV29 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMEM100Q9NV29 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMEM100Q9NV29 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMEM100Q9NV29 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMEM100Q9NV29 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMEM100Q9NV29 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMEM100Q9NV29 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMEM100Q9NV29 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMEM100Q9NV29 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMEM100Q9NV29 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMEM100Q9NV29 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMEM100Q9NV29 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMEM100Q9NV29 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.3 ms