Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR61

DLL4, Delta-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 685 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DLL4Q9NR61 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
DLL4Q9NR61 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
DLL4Q9NR61 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
DLL4Q9NR61 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
DLL4Q9NR61 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
DLL4Q9NR61 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
DLL4Q9NR61 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
DLL4Q9NR61 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
DLL4Q9NR61 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
DLL4Q9NR61 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
DLL4Q9NR61 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
DLL4Q9NR61 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
DLL4Q9NR61 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
DLL4Q9NR61 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
DLL4Q9NR61 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
DLL4Q9NR61 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
DLL4Q9NR61 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
DLL4Q9NR61 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
DLL4Q9NR61 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
DLL4Q9NR61 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
DLL4Q9NR61 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
DLL4Q9NR61 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
DLL4Q9NR61 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
DLL4Q9NR61 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
DLL4Q9NR61 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
DLL4Q9NR61 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
DLL4Q9NR61 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
DLL4Q9NR61 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
DLL4Q9NR61 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
DLL4Q9NR61 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
DLL4Q9NR61 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
DLL4Q9NR61 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
DLL4Q9NR61 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
DLL4Q9NR61 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
DLL4Q9NR61 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
DLL4Q9NR61 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
DLL4Q9NR61 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
DLL4Q9NR61 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
DLL4Q9NR61 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
DLL4Q9NR61 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DLL4Q9NR61 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
DLL4Q9NR61 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
DLL4Q9NR61 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
DLL4Q9NR61 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
DLL4Q9NR61 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
DLL4Q9NR61 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
DLL4Q9NR61 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
DLL4Q9NR61 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DLL4Q9NR61 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
DLL4Q9NR61 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
DLL4Q9NR61 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DLL4Q9NR61 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DLL4Q9NR61 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DLL4Q9NR61 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
DLL4Q9NR61 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
DLL4Q9NR61 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
DLL4Q9NR61 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
DLL4Q9NR61 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DLL4Q9NR61 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
DLL4Q9NR61 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
DLL4Q9NR61 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
DLL4Q9NR61 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
DLL4Q9NR61 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DLL4Q9NR61 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
DLL4Q9NR61 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
DLL4Q9NR61 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
DLL4Q9NR61 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
DLL4Q9NR61 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DLL4Q9NR61 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
DLL4Q9NR61 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DLL4Q9NR61 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DLL4Q9NR61 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
DLL4Q9NR61 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
DLL4Q9NR61 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
DLL4Q9NR61 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DLL4Q9NR61 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
DLL4Q9NR61 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
DLL4Q9NR61 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DLL4Q9NR61 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
DLL4Q9NR61 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
DLL4Q9NR61 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
DLL4Q9NR61 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
DLL4Q9NR61 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
DLL4Q9NR61 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
DLL4Q9NR61 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
DLL4Q9NR61 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
DLL4Q9NR61 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
DLL4Q9NR61 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
DLL4Q9NR61 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
DLL4Q9NR61 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
DLL4Q9NR61 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
DLL4Q9NR61 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
DLL4Q9NR61 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
DLL4Q9NR61 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
DLL4Q9NR61 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DLL4Q9NR61 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DLL4Q9NR61 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DLL4Q9NR61 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
DLL4Q9NR61 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DLL4Q9NR61 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms