Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR61

DLL4, Delta-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 685 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DLL4Q9NR61 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC29.19■■■□□ 2.26
DLL4Q9NR61 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
DLL4Q9NR61 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC28.97■■■□□ 2.23
DLL4Q9NR61 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
DLL4Q9NR61 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
DLL4Q9NR61 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
DLL4Q9NR61 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
DLL4Q9NR61 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
DLL4Q9NR61 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
DLL4Q9NR61 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
DLL4Q9NR61 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
DLL4Q9NR61 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
DLL4Q9NR61 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
DLL4Q9NR61 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
DLL4Q9NR61 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
DLL4Q9NR61 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
DLL4Q9NR61 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
DLL4Q9NR61 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
DLL4Q9NR61 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
DLL4Q9NR61 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
DLL4Q9NR61 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
DLL4Q9NR61 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
DLL4Q9NR61 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
DLL4Q9NR61 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
DLL4Q9NR61 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
DLL4Q9NR61 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
DLL4Q9NR61 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
DLL4Q9NR61 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
DLL4Q9NR61 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
DLL4Q9NR61 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
DLL4Q9NR61 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
DLL4Q9NR61 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
DLL4Q9NR61 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
DLL4Q9NR61 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
DLL4Q9NR61 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
DLL4Q9NR61 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
DLL4Q9NR61 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
DLL4Q9NR61 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
DLL4Q9NR61 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
DLL4Q9NR61 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
DLL4Q9NR61 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
DLL4Q9NR61 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
DLL4Q9NR61 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
DLL4Q9NR61 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
DLL4Q9NR61 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
DLL4Q9NR61 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
DLL4Q9NR61 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
DLL4Q9NR61 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
DLL4Q9NR61 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
DLL4Q9NR61 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
DLL4Q9NR61 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
DLL4Q9NR61 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
DLL4Q9NR61 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
DLL4Q9NR61 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
DLL4Q9NR61 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
DLL4Q9NR61 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
DLL4Q9NR61 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
DLL4Q9NR61 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
DLL4Q9NR61 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
DLL4Q9NR61 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
DLL4Q9NR61 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
DLL4Q9NR61 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
DLL4Q9NR61 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
DLL4Q9NR61 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
DLL4Q9NR61 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
DLL4Q9NR61 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
DLL4Q9NR61 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
DLL4Q9NR61 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
DLL4Q9NR61 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
DLL4Q9NR61 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
DLL4Q9NR61 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
DLL4Q9NR61 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
DLL4Q9NR61 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
DLL4Q9NR61 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
DLL4Q9NR61 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
DLL4Q9NR61 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
DLL4Q9NR61 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
DLL4Q9NR61 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
DLL4Q9NR61 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
DLL4Q9NR61 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
DLL4Q9NR61 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
DLL4Q9NR61 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
DLL4Q9NR61 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
DLL4Q9NR61 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
DLL4Q9NR61 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
DLL4Q9NR61 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
DLL4Q9NR61 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
DLL4Q9NR61 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
DLL4Q9NR61 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
DLL4Q9NR61 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
DLL4Q9NR61 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
DLL4Q9NR61 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
DLL4Q9NR61 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
DLL4Q9NR61 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
DLL4Q9NR61 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
DLL4Q9NR61 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
DLL4Q9NR61 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
DLL4Q9NR61 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
DLL4Q9NR61 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
DLL4Q9NR61 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.4 ms