Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQV7

PRDM9, Histone-lysine N-methyltransferase PRDM9, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM9Q9NQV7 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PRDM9Q9NQV7 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PRDM9Q9NQV7 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PRDM9Q9NQV7 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PRDM9Q9NQV7 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PRDM9Q9NQV7 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PRDM9Q9NQV7 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PRDM9Q9NQV7 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PRDM9Q9NQV7 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PRDM9Q9NQV7 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PRDM9Q9NQV7 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PRDM9Q9NQV7 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PRDM9Q9NQV7 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PRDM9Q9NQV7 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
PRDM9Q9NQV7 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PRDM9Q9NQV7 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PRDM9Q9NQV7 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
PRDM9Q9NQV7 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PRDM9Q9NQV7 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PRDM9Q9NQV7 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PRDM9Q9NQV7 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PRDM9Q9NQV7 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PRDM9Q9NQV7 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PRDM9Q9NQV7 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
PRDM9Q9NQV7 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PRDM9Q9NQV7 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PRDM9Q9NQV7 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PRDM9Q9NQV7 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PRDM9Q9NQV7 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PRDM9Q9NQV7 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PRDM9Q9NQV7 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PRDM9Q9NQV7 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PRDM9Q9NQV7 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PRDM9Q9NQV7 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PRDM9Q9NQV7 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PRDM9Q9NQV7 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PRDM9Q9NQV7 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PRDM9Q9NQV7 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PRDM9Q9NQV7 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PRDM9Q9NQV7 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PRDM9Q9NQV7 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
PRDM9Q9NQV7 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
PRDM9Q9NQV7 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
PRDM9Q9NQV7 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PRDM9Q9NQV7 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PRDM9Q9NQV7 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PRDM9Q9NQV7 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PRDM9Q9NQV7 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PRDM9Q9NQV7 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PRDM9Q9NQV7 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PRDM9Q9NQV7 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PRDM9Q9NQV7 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PRDM9Q9NQV7 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PRDM9Q9NQV7 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PRDM9Q9NQV7 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PRDM9Q9NQV7 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PRDM9Q9NQV7 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PRDM9Q9NQV7 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PRDM9Q9NQV7 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PRDM9Q9NQV7 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PRDM9Q9NQV7 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PRDM9Q9NQV7 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PRDM9Q9NQV7 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PRDM9Q9NQV7 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PRDM9Q9NQV7 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PRDM9Q9NQV7 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PRDM9Q9NQV7 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
PRDM9Q9NQV7 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PRDM9Q9NQV7 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
PRDM9Q9NQV7 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PRDM9Q9NQV7 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PRDM9Q9NQV7 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PRDM9Q9NQV7 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PRDM9Q9NQV7 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
PRDM9Q9NQV7 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PRDM9Q9NQV7 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PRDM9Q9NQV7 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PRDM9Q9NQV7 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
PRDM9Q9NQV7 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PRDM9Q9NQV7 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PRDM9Q9NQV7 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PRDM9Q9NQV7 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PRDM9Q9NQV7 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PRDM9Q9NQV7 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PRDM9Q9NQV7 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PRDM9Q9NQV7 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PRDM9Q9NQV7 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PRDM9Q9NQV7 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PRDM9Q9NQV7 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PRDM9Q9NQV7 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PRDM9Q9NQV7 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PRDM9Q9NQV7 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PRDM9Q9NQV7 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PRDM9Q9NQV7 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PRDM9Q9NQV7 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PRDM9Q9NQV7 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PRDM9Q9NQV7 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PRDM9Q9NQV7 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PRDM9Q9NQV7 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PRDM9Q9NQV7 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms