Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ11

ATP13A2, Cation-transporting ATPase 13A2, humanhuman

Predictions only

Length 1,180 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP13A2Q9NQ11 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ATP13A2Q9NQ11 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ATP13A2Q9NQ11 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ATP13A2Q9NQ11 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ATP13A2Q9NQ11 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ATP13A2Q9NQ11 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
ATP13A2Q9NQ11 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
ATP13A2Q9NQ11 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ATP13A2Q9NQ11 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ATP13A2Q9NQ11 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ATP13A2Q9NQ11 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ATP13A2Q9NQ11 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ATP13A2Q9NQ11 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ATP13A2Q9NQ11 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ATP13A2Q9NQ11 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ATP13A2Q9NQ11 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
ATP13A2Q9NQ11 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ATP13A2Q9NQ11 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ATP13A2Q9NQ11 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ATP13A2Q9NQ11 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ATP13A2Q9NQ11 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ATP13A2Q9NQ11 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ATP13A2Q9NQ11 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ATP13A2Q9NQ11 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ATP13A2Q9NQ11 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ATP13A2Q9NQ11 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ATP13A2Q9NQ11 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ATP13A2Q9NQ11 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ATP13A2Q9NQ11 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ATP13A2Q9NQ11 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ATP13A2Q9NQ11 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ATP13A2Q9NQ11 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
ATP13A2Q9NQ11 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ATP13A2Q9NQ11 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ATP13A2Q9NQ11 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ATP13A2Q9NQ11 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ATP13A2Q9NQ11 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ATP13A2Q9NQ11 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ATP13A2Q9NQ11 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ATP13A2Q9NQ11 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ATP13A2Q9NQ11 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
ATP13A2Q9NQ11 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
ATP13A2Q9NQ11 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ATP13A2Q9NQ11 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
ATP13A2Q9NQ11 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
ATP13A2Q9NQ11 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ATP13A2Q9NQ11 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ATP13A2Q9NQ11 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ATP13A2Q9NQ11 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ATP13A2Q9NQ11 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ATP13A2Q9NQ11 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ATP13A2Q9NQ11 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ATP13A2Q9NQ11 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ATP13A2Q9NQ11 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ATP13A2Q9NQ11 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ATP13A2Q9NQ11 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ATP13A2Q9NQ11 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ATP13A2Q9NQ11 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
ATP13A2Q9NQ11 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ATP13A2Q9NQ11 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ATP13A2Q9NQ11 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
ATP13A2Q9NQ11 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ATP13A2Q9NQ11 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ATP13A2Q9NQ11 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ATP13A2Q9NQ11 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ATP13A2Q9NQ11 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ATP13A2Q9NQ11 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ATP13A2Q9NQ11 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ATP13A2Q9NQ11 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ATP13A2Q9NQ11 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ATP13A2Q9NQ11 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ATP13A2Q9NQ11 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ATP13A2Q9NQ11 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ATP13A2Q9NQ11 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ATP13A2Q9NQ11 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ATP13A2Q9NQ11 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
ATP13A2Q9NQ11 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ATP13A2Q9NQ11 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ATP13A2Q9NQ11 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
ATP13A2Q9NQ11 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ATP13A2Q9NQ11 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ATP13A2Q9NQ11 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ATP13A2Q9NQ11 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ATP13A2Q9NQ11 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ATP13A2Q9NQ11 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ATP13A2Q9NQ11 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ATP13A2Q9NQ11 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
ATP13A2Q9NQ11 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ATP13A2Q9NQ11 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ATP13A2Q9NQ11 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ATP13A2Q9NQ11 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ATP13A2Q9NQ11 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ATP13A2Q9NQ11 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
ATP13A2Q9NQ11 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
ATP13A2Q9NQ11 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ATP13A2Q9NQ11 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ATP13A2Q9NQ11 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ATP13A2Q9NQ11 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ATP13A2Q9NQ11 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ATP13A2Q9NQ11 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms